大口黑鱸HBP基因和CTSB基因SNPs的篩選及與生長(zhǎng)關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-05-20 06:12
大口黑鱸(Micropterus salmoides),俗名加州鱸,隸屬鱸形目(Perciformes)、鱸亞目(Porcoidei)、太陽(yáng)魚科(Cehtrachidae)、黑鱸屬(Micropterus),是我國(guó)重要的淡水養(yǎng)殖品種之一。然而近年來(lái),養(yǎng)殖大口黑鱸呈現(xiàn)的種質(zhì)衰退,生長(zhǎng)速度下降的問(wèn)題,嚴(yán)重制約我國(guó)大口黑鱸養(yǎng)殖業(yè)的快速發(fā)展。培育出具有優(yōu)良生長(zhǎng)性狀的大口黑鱸養(yǎng)殖品種,是現(xiàn)階段育種研究者的研究重點(diǎn)。篩選具有良好遺傳性狀的相關(guān)分子標(biāo)記,并應(yīng)用于分子標(biāo)記輔助育種已經(jīng)成為魚類遺傳改良的重要研究手段,也是其它動(dòng)植物研究中的重要技術(shù)手段。分子標(biāo)記輔助選擇育種是借助分子標(biāo)記對(duì)標(biāo)記基因和目標(biāo)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)和選擇,由于是從分子的角度對(duì)性狀直接準(zhǔn)確標(biāo)記,所以能夠有效提高性狀選擇的效率,減少育種過(guò)程的泛泛的盲目選擇,有效縮短育種時(shí)間;诖罂诤邝|EST-SNP庫(kù),選取高密度脂蛋白結(jié)合蛋白基因和組織蛋白酶B為與生長(zhǎng)性狀相關(guān)的候選基因,分析其單核苷酸多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)性。1.高密度脂蛋白結(jié)合蛋白基因(HBP)SNPs的篩選及與生長(zhǎng)關(guān)聯(lián)分析高密度脂蛋白結(jié)合蛋白(high density lipoprot...
【文章來(lái)源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁(yè)數(shù)】:57 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
引言
1 高密度脂蛋白結(jié)合蛋白基因和組織蛋白 B 基因
1.1 高密度脂蛋白結(jié)合蛋白基因
1.2 組織蛋白酶 B
2. 魚類中用候選基因法篩選 SNP 標(biāo)記進(jìn)展
2.1 單核苷酸多態(tài)性 SNP
2.2 候選基因法
2.3 候選基因法在魚類中的應(yīng)用
2.4 候選基因法開(kāi)發(fā)的大口黑鱸 SNP 標(biāo)記
3. 分子標(biāo)記輔助選擇育種策略
3.1 單基因選擇育種
3.2 多基因選擇育種
3.3 全基因組選擇
4. 研究的目的與意義
第一章 大口黑鱸高密度脂蛋白結(jié)合蛋白基因(HBP)SNPs 的篩選及與生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)性分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 SNPs 位點(diǎn)篩選
1.3 SnaPshot 分型
1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
2.1 HBP 基因部分序列的 SNP 位點(diǎn)獲得和分析
2.2 HBP 基因上 SNPs 位點(diǎn)在群體中的遺傳結(jié)構(gòu)分析
2.3 HBP 基因的 H1、H2 和 H3 位點(diǎn)與生長(zhǎng)性狀相關(guān)性分析
3 討論
第二章 大口黑鱸組織蛋白酶 B 基因 SNP 篩選及與生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 SNPs 位點(diǎn)篩選
1.3 SnaPshot 分型
1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
2.1 CTSB 基因的 SNP 位點(diǎn)獲得和分析
2.2 CTSB 基因編碼的氨基酸序列分析
2.3 CTSB 基因突變位點(diǎn)在群體中多態(tài)性分析
2.4 CTSB 基因的突變位點(diǎn)與生長(zhǎng)性狀相關(guān)性分析
3 討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄 1 中英文對(duì)照縮略詞表(Abbreviations)
附錄 2 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文
本文編號(hào):3197243
【文章來(lái)源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁(yè)數(shù)】:57 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
引言
1 高密度脂蛋白結(jié)合蛋白基因和組織蛋白 B 基因
1.1 高密度脂蛋白結(jié)合蛋白基因
1.2 組織蛋白酶 B
2. 魚類中用候選基因法篩選 SNP 標(biāo)記進(jìn)展
2.1 單核苷酸多態(tài)性 SNP
2.2 候選基因法
2.3 候選基因法在魚類中的應(yīng)用
2.4 候選基因法開(kāi)發(fā)的大口黑鱸 SNP 標(biāo)記
3. 分子標(biāo)記輔助選擇育種策略
3.1 單基因選擇育種
3.2 多基因選擇育種
3.3 全基因組選擇
4. 研究的目的與意義
第一章 大口黑鱸高密度脂蛋白結(jié)合蛋白基因(HBP)SNPs 的篩選及與生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)性分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 SNPs 位點(diǎn)篩選
1.3 SnaPshot 分型
1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
2.1 HBP 基因部分序列的 SNP 位點(diǎn)獲得和分析
2.2 HBP 基因上 SNPs 位點(diǎn)在群體中的遺傳結(jié)構(gòu)分析
2.3 HBP 基因的 H1、H2 和 H3 位點(diǎn)與生長(zhǎng)性狀相關(guān)性分析
3 討論
第二章 大口黑鱸組織蛋白酶 B 基因 SNP 篩選及與生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 SNPs 位點(diǎn)篩選
1.3 SnaPshot 分型
1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
2.1 CTSB 基因的 SNP 位點(diǎn)獲得和分析
2.2 CTSB 基因編碼的氨基酸序列分析
2.3 CTSB 基因突變位點(diǎn)在群體中多態(tài)性分析
2.4 CTSB 基因的突變位點(diǎn)與生長(zhǎng)性狀相關(guān)性分析
3 討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄 1 中英文對(duì)照縮略詞表(Abbreviations)
附錄 2 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文
本文編號(hào):3197243
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