髭鯛屬（Hapalogenys）魚類隸屬于鱸形目，鱸亞目，石鱸科，是世界性溫?zé)釒Ыｔ~類。髭鯛屬具有明顯的地域分布特征，已經(jīng)成為研究魚類系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系、起源與進(jìn)化的良好材料，而到目前為止髭鯛屬魚類在鱸亞目中的分類地位仍然沒(méi)有明確。因此，本研究測(cè)定4種鱸形目魚類線粒體全序列，并分析其基因組編碼區(qū)和非編碼區(qū)序列特征，同時(shí)我們基于62條線粒體基因組全序列應(yīng)用最大似然法和貝葉斯法來(lái)討論髭鯛屬在鱸亞目的分類地位問(wèn)題，并結(jié)合松散分子鐘推算鱸形目魚類的起源時(shí)間，期望為鱸形目魚類起源分化積累理論材料。主要研究結(jié)果如下：（1）本文測(cè)定4種鱸形目代表魚類（橫帶髭鯛，六帶線紋魚，花瓣鯧和矛尾蝦虎魚）線粒體基因組全序列，并對(duì)其線粒體基因組進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)其線粒體基因組中堿基組成及基因排序與大多數(shù)的硬骨魚一致，較為保守，但在橫帶髭鯛線粒體基因組中缺少tRNA-Pro基因。4種魚類線粒體基因組長(zhǎng)度差異較大，主要是由于控制區(qū)長(zhǎng)度變化所引起的。輕鏈復(fù)制起始區(qū)（OL）均能形成穩(wěn)定的莖環(huán)二級(jí)結(jié)構(gòu)，其臂結(jié)構(gòu)存在三種保守序列：5’-GCCGG-3’，5’-TCCGG-3’以及5’-GCGGG-3。多數(shù)物種識(shí)別了終止結(jié)合序... 

【文章來(lái)源】：浙江海洋大學(xué)浙江省

【文章頁(yè)數(shù)】：56 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
目錄
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 分子系統(tǒng)學(xué)研究進(jìn)展
        1.1.1 分子系統(tǒng)學(xué)簡(jiǎn)介
        1.1.2 分子系統(tǒng)學(xué)發(fā)展
        1.1.3 分子系統(tǒng)學(xué)分析方法
        1.1.4 分子數(shù)據(jù)的特點(diǎn)
        1.1.5 分子鐘與分子鐘假說(shuō)
    1.2 魚類線粒體基因組
        1.2.1 魚類線粒體基因組的組成和結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
        1.2.2 魚類線粒體基因組的特點(diǎn)
        1.2.3 線粒體遺傳標(biāo)記在魚類分子系統(tǒng)學(xué)中的應(yīng)用
    1.3 髭鯛屬魚類研究概述
        1.3.1 髭鯛屬魚類簡(jiǎn)介
        1.3.2 髭鯛屬魚類系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究進(jìn)展
        1.3.3 鱸形目魚類起源時(shí)間研究概況
    1.4 本文研究目的和意義
第二章 4種鱸形目線粒體基因組結(jié)構(gòu)和特征
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料和方法
        2.1.1 樣品的采集與鑒定
        2.1.2 主要儀器
        2.1.3 主要試劑
        2.1.4 實(shí)驗(yàn)步驟
    2.2 結(jié)果
        2.2.1 橫帶髭鯛(Hapalogenys analis)線粒體全基因組特征
        2.2.2 花瓣鯧(Psenes pellucidus)線粒體全基因組特征
        2.2.3 六帶線紋魚(Grammi stessexlineatus)線粒體全基因組特征
        2.2.4 矛尾蝦虎魚(Chaeturichthys stigmatias)線粒體全基因組特征
    2.3 討論
        2.3.1 4種鱸形目魚類線粒體基因組結(jié)構(gòu)分析
第三章 髭鯛屬分類地位研究以及鱸形目魚類分化時(shí)間估計(jì)
    3.1 材料與方法
        3.1.1 線粒體基因組全序列數(shù)據(jù)的獲得
        3.1.2 系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.1.3 分歧時(shí)間估算
    3.2 結(jié)果
        3.2.1 髭鯛屬分類地位研究
    3.3 鱸形目魚類起源時(shí)間的估算
    3.4 討論
        3.4.1 髭鯛屬系統(tǒng)分類地位
        3.4.2 鱸形目起源時(shí)間
總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及研究成果


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于髭鯛屬魚類Cyt b基因全序列探討髭鯛屬在鱸總科的分類地位[J]. 徐田軍,王健鑫,孫悅娜,石戈,王日昕.  動(dòng)物分類學(xué)報(bào). 2010(03)
[2]鳥類線粒體DNA結(jié)構(gòu)特點(diǎn)及在鳥類研究中的應(yīng)用[J]. 劉鑄,楊春文,金建麗,金志民,戴鵬.  生物技術(shù)通報(bào). 2009(12)
[3]中國(guó)石鱸屬（鱸形目:石鱸科）魚類一新種[J]. 田明誠(chéng).  動(dòng)物分類學(xué)報(bào). 1982(03)

碩士論文
[1]鱘形目部分種類基于線粒體COⅠ基因的分子進(jìn)化研究[D]. 胡佳.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[2]金屬硫蛋白基因的分子進(jìn)化分析[D]. 姬廣超.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[3]斜帶石斑魚和赤點(diǎn)石斑魚線粒體基因組全序列研究[D]. 莊軒.廈門大學(xué) 2007
[4]瓢蟲科部分種類基于線粒體COI基因的系統(tǒng)發(fā)育與食性演化研究[D]. 付景.陜西師范大學(xué) 2007



本文編號(hào)：3182774