凡納濱對與生長繁殖相關的遺傳標記的篩選
發(fā)布時間:2021-05-06 09:59
凡納濱對蝦(Litopenaeus vannamei)又稱南美白對蝦,原產(chǎn)于中南美洲,自然分布于東太平洋美洲沿岸。因其具有生長速度快、抗病能力強、營養(yǎng)豐富、肉味鮮美等優(yōu)點,目前成為世界養(yǎng)殖產(chǎn)量最高的三大蝦種之一。但近年來,由于病毒病害流行、水質(zhì)不斷惡化以及一些養(yǎng)殖戶不規(guī)范地引種、導種等,凡納濱對蝦在養(yǎng)殖過程中,出現(xiàn)種質(zhì)衰退的現(xiàn)象。為了合理保護和充分利用優(yōu)良凡納濱對蝦的種質(zhì)資源,獲得優(yōu)良性狀穩(wěn)定遺傳的新品種,本研究從數(shù)量遺傳學和分子生物學兩個方面,探究影響凡納濱對蝦體重的主要形態(tài)性狀,篩選與生長和繁殖相關的遺傳標記,以期為凡納濱對蝦的遺傳改良提供參考。在數(shù)量遺傳學方面,運用單因素方差分析、通徑分析和多元回歸分析等方法,比較了V101、OS、NS、GD2四個凡納濱對蝦種群的頭胸甲長(L1)、第16腹節(jié)長(L2-L7)、尾節(jié)長(L8)、體長(L9)、全長(L10)、頭胸甲寬(W1)、第16腹節(jié)寬(W2-W7)、頭胸甲高(H1)、第16腹節(jié)高(H2-H7)等24項形態(tài)性狀和體重m及其所有性狀的比例參數(shù),分析了各群體形態(tài)差異以及主...
【文章來源】:上海海洋大學上海市
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 凡納濱對蝦的研究概況
1.1.1 凡納濱對蝦的分布及養(yǎng)殖現(xiàn)狀
1.2 凡納濱對蝦的數(shù)量性狀研究
1.3 凡納濱對蝦的分子生物學研究
1.3.1 凡納濱對蝦的遺傳多樣性
1.3.2 微衛(wèi)星標記在水產(chǎn)動物遺傳育種的應用
1.3.3 EST-SSR標記在水產(chǎn)動物遺傳育種的應用
1.4 本研究的背景與意義
第二章 凡納濱對蝦不同群體影響體重的主要形態(tài)性狀
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 方法
2.1.2.1 測量方法
2.1.2.2 分析方法
2.2 結果
2.2.1 凡納濱對蝦4個養(yǎng)殖群體形態(tài)參數(shù)分析
2.2.2 凡納濱對蝦4個養(yǎng)殖群體形態(tài)性狀與體重的關系
2.2.2.1 V101群體
2.2.2.2 OS群體
2.2.2.3 NS群體
2.2.2.4 GD2群體
2.2.3 凡納濱對蝦4個養(yǎng)殖群體的回歸方程
2.3 討論
2.3.1 凡納濱對蝦4個種群形態(tài)差異分析
2.3.2 影響不同種群凡納濱對蝦體重的主要形態(tài)性狀
第三章 凡納濱對蝦與生長相關的微衛(wèi)星標記的篩選與驗證
3.1 材料與方法
3.1.1 實驗材料
3.1.1.1 實驗樣品
3.1.1.2 實驗儀器
3.1.1.3 實驗試劑
3.1.2 實驗設計
3.1.3 實驗方法
3.1.3.1 主要生長性狀的測定
3.1.3.2 基因組DNA提取及檢測
3.1.3.3 微衛(wèi)星標記
3.1.3.4 PCR反應及電泳
3.1.3.5 統(tǒng)計分析
3.2 結果
3.2.1 凡納濱對蝦與生長相關的微衛(wèi)星標記篩選結果
3.2.1.1 凡納濱對蝦主要生長性狀描述統(tǒng)計分析
3.2.1.2 凡納濱對蝦8對微衛(wèi)星引物擴增結果
3.2.1.3 凡納濱對蝦遺傳多樣性分析
3.2.1.4 凡納濱對蝦微衛(wèi)星標記與生長性狀的相關性分析
3.2.2 凡納濱對蝦與生長相關微衛(wèi)星標記在不同群體驗證結果
3.2.2.1 凡納濱對蝦主要生長性狀描述統(tǒng)計分析
3.2.2.2 凡納濱對蝦TUM-6.124在兩個群體的擴增結果
3.2.2.3 凡納濱對蝦與生長相關微衛(wèi)星標記在兩個群體驗證分析
3.3 討論
3.3.1 凡納濱對蝦遺傳多樣性分析
3.3.2 凡納濱對蝦與生長相關的微衛(wèi)星標記分析
第四章 凡納濱對蝦與繁殖相關的EST-SSR引物篩選與驗證
4.1 材料與方法
4.1.1 實驗材料
4.1.2 實驗設計
4.1.3 實驗方法
4.1.3.1 繁殖指標和形態(tài)性狀的測定
4.1.3.2 基因組DNA提取及檢測
4.1.3.3 瓊脂糖電泳和最佳退火溫度的確定
4.1.3.4 多態(tài)良好的EST-SSR引物的篩選
4.1.3.5 與繁殖相關的EST-SSR引物的篩選
4.2 結果
4.2.1 多態(tài)良好的EST-SSR引物的篩選
4.2.1.1 瓊脂糖電泳和最佳退火溫度的確定
4.2.1.2 多態(tài)良好的EST-SSR引物篩選
4.2.2 與繁殖相關的EST-SSR引物的篩選
4.2.2.1 12對微衛(wèi)星擴增結果
4.2.2.2 凡納濱對蝦遺傳多樣性分析
4.2.2.3 凡納濱對蝦微衛(wèi)星標記與繁殖性狀的相關性分析
4.2.3 與繁殖相關的EST-SSR引物在其他群體驗證
4.2.3.1 凡納濱對蝦GD2群體單位體重產(chǎn)卵量分析
4.2.3.2 凡納濱對蝦EST-SSR引物V-15在GD2群體中的擴增
4.2.3.3 凡納濱對蝦與繁殖相關EST-SSR標記的驗證分析
4.3 討論
4.3.1 EST-SSR標記的篩選
4.3.2 凡納濱對蝦遺傳多樣性分析
4.3.3 EST-SSR標記與繁殖指標的相關性分析
4.3.4 關于與特定性狀關聯(lián)的標記篩選時模板的選擇
結論
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]縊蟶(Sinonovacula constricta)EST-SSR標記與生長性狀的相關性分析[J]. 邵艷卿,方軍,柏艷,張炯明,肖國強,滕爽爽,劉博,柴雪良. 海洋與湖沼. 2015(05)
[2]斑點叉尾形態(tài)性狀對體質(zhì)量的影響[J]. 鐘立強,陳校輝,王明華,陳友明,秦欽,邊文冀. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2015(05)
[3]2個類型平瀨掌扇貝殼性狀對活體質(zhì)量的影響分析[J]. 宋堅,肖登兵,張偉杰,常亞青,宮海寧. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2015(03)
[4]中華鱉3個養(yǎng)殖群體形態(tài)性狀對體質(zhì)量的影響[J]. 肖鳳芳,李偉,朱新平,趙建,洪孝友,朱阿莉,史燕,黃啟成. 基因組學與應用生物學. 2014(06)
[5]凡納濱對蝦新品系體形性狀對其體質(zhì)量的影響[J]. 李玉虎,張志懷,宋芹芹,魏琳,黃皓,周代金,周海龍,相建海. 熱帶生物學報. 2014(04)
[6]Correlation and path analysis of morphological and weight traits in marine gastropod Glossaulax reiniana[J]. 趙力強,何陽陽,楊鳳,聶鴻濤,閆喜武. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2014(04)
[7]日本囊對蝦2種形態(tài)變異類型群體形態(tài)性狀對體質(zhì)量的影響效果分析[J]. 董宏標,蘇永全,毛勇,邊力,王軍. 廈門大學學報(自然科學版). 2014(02)
[8]大黃魚快長相關微衛(wèi)星標記的篩選與驗證[J]. 劉賢德,隋班良,王志勇,蔡明夷. 水生生物學報. 2013(06)
[9]中華鱉(Pelodiscus sinensis)EST-SSR標記與生長性狀相關性分析[J]. 張群英,黃鶴忠,袁文成,李文龍,雍福和,徐雪英,張平. 海洋與湖沼. 2013(06)
[10]凡納濱對蝦大量EST的生物信息學分析[J]. 孫政,柳承璋,李富花,張曉軍,張俊彬,相建海. 海洋學報(中文版). 2013(05)
博士論文
[1]三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)遺傳連鎖圖譜的構建和生長相關性狀QTL定位的研究[D]. 劉磊.中國海洋大學 2014
[2]鯉生長性狀主效QTL育種潛力評估及其在染色體上的定位[D]. 魯翠云.上海海洋大學 2014
[3]基于牙鲆DH群體的遺傳圖譜構建及生長相關性狀的QTL定位[D]. 劉奕.東北農(nóng)業(yè)大學 2013
碩士論文
[1]凡納濱對蝦選育群體遺傳多樣性分析[D]. 包秀鳳.廣東海洋大學 2014
[2]合浦珠母貝選育群體與家系的遺傳多樣性及其與生長表現(xiàn)的相關性分析[D]. 許成帥.上海海洋大學 2013
[3]凡納濱對蝦養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性分析[D]. 李小雙.天津科技大學 2011
[4]凡納濱對蝦EST-SSR遺傳多態(tài)性與生長性狀的關聯(lián)分析[D]. 張瓊.西北農(nóng)林科技大學 2010
本文編號:3171721
【文章來源】:上海海洋大學上海市
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 凡納濱對蝦的研究概況
1.1.1 凡納濱對蝦的分布及養(yǎng)殖現(xiàn)狀
1.2 凡納濱對蝦的數(shù)量性狀研究
1.3 凡納濱對蝦的分子生物學研究
1.3.1 凡納濱對蝦的遺傳多樣性
1.3.2 微衛(wèi)星標記在水產(chǎn)動物遺傳育種的應用
1.3.3 EST-SSR標記在水產(chǎn)動物遺傳育種的應用
1.4 本研究的背景與意義
第二章 凡納濱對蝦不同群體影響體重的主要形態(tài)性狀
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 方法
2.1.2.1 測量方法
2.1.2.2 分析方法
2.2 結果
2.2.1 凡納濱對蝦4個養(yǎng)殖群體形態(tài)參數(shù)分析
2.2.2 凡納濱對蝦4個養(yǎng)殖群體形態(tài)性狀與體重的關系
2.2.2.1 V101群體
2.2.2.2 OS群體
2.2.2.3 NS群體
2.2.2.4 GD2群體
2.2.3 凡納濱對蝦4個養(yǎng)殖群體的回歸方程
2.3 討論
2.3.1 凡納濱對蝦4個種群形態(tài)差異分析
2.3.2 影響不同種群凡納濱對蝦體重的主要形態(tài)性狀
第三章 凡納濱對蝦與生長相關的微衛(wèi)星標記的篩選與驗證
3.1 材料與方法
3.1.1 實驗材料
3.1.1.1 實驗樣品
3.1.1.2 實驗儀器
3.1.1.3 實驗試劑
3.1.2 實驗設計
3.1.3 實驗方法
3.1.3.1 主要生長性狀的測定
3.1.3.2 基因組DNA提取及檢測
3.1.3.3 微衛(wèi)星標記
3.1.3.4 PCR反應及電泳
3.1.3.5 統(tǒng)計分析
3.2 結果
3.2.1 凡納濱對蝦與生長相關的微衛(wèi)星標記篩選結果
3.2.1.1 凡納濱對蝦主要生長性狀描述統(tǒng)計分析
3.2.1.2 凡納濱對蝦8對微衛(wèi)星引物擴增結果
3.2.1.3 凡納濱對蝦遺傳多樣性分析
3.2.1.4 凡納濱對蝦微衛(wèi)星標記與生長性狀的相關性分析
3.2.2 凡納濱對蝦與生長相關微衛(wèi)星標記在不同群體驗證結果
3.2.2.1 凡納濱對蝦主要生長性狀描述統(tǒng)計分析
3.2.2.2 凡納濱對蝦TUM-6.124在兩個群體的擴增結果
3.2.2.3 凡納濱對蝦與生長相關微衛(wèi)星標記在兩個群體驗證分析
3.3 討論
3.3.1 凡納濱對蝦遺傳多樣性分析
3.3.2 凡納濱對蝦與生長相關的微衛(wèi)星標記分析
第四章 凡納濱對蝦與繁殖相關的EST-SSR引物篩選與驗證
4.1 材料與方法
4.1.1 實驗材料
4.1.2 實驗設計
4.1.3 實驗方法
4.1.3.1 繁殖指標和形態(tài)性狀的測定
4.1.3.2 基因組DNA提取及檢測
4.1.3.3 瓊脂糖電泳和最佳退火溫度的確定
4.1.3.4 多態(tài)良好的EST-SSR引物的篩選
4.1.3.5 與繁殖相關的EST-SSR引物的篩選
4.2 結果
4.2.1 多態(tài)良好的EST-SSR引物的篩選
4.2.1.1 瓊脂糖電泳和最佳退火溫度的確定
4.2.1.2 多態(tài)良好的EST-SSR引物篩選
4.2.2 與繁殖相關的EST-SSR引物的篩選
4.2.2.1 12對微衛(wèi)星擴增結果
4.2.2.2 凡納濱對蝦遺傳多樣性分析
4.2.2.3 凡納濱對蝦微衛(wèi)星標記與繁殖性狀的相關性分析
4.2.3 與繁殖相關的EST-SSR引物在其他群體驗證
4.2.3.1 凡納濱對蝦GD2群體單位體重產(chǎn)卵量分析
4.2.3.2 凡納濱對蝦EST-SSR引物V-15在GD2群體中的擴增
4.2.3.3 凡納濱對蝦與繁殖相關EST-SSR標記的驗證分析
4.3 討論
4.3.1 EST-SSR標記的篩選
4.3.2 凡納濱對蝦遺傳多樣性分析
4.3.3 EST-SSR標記與繁殖指標的相關性分析
4.3.4 關于與特定性狀關聯(lián)的標記篩選時模板的選擇
結論
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]縊蟶(Sinonovacula constricta)EST-SSR標記與生長性狀的相關性分析[J]. 邵艷卿,方軍,柏艷,張炯明,肖國強,滕爽爽,劉博,柴雪良. 海洋與湖沼. 2015(05)
[2]斑點叉尾形態(tài)性狀對體質(zhì)量的影響[J]. 鐘立強,陳校輝,王明華,陳友明,秦欽,邊文冀. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2015(05)
[3]2個類型平瀨掌扇貝殼性狀對活體質(zhì)量的影響分析[J]. 宋堅,肖登兵,張偉杰,常亞青,宮海寧. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2015(03)
[4]中華鱉3個養(yǎng)殖群體形態(tài)性狀對體質(zhì)量的影響[J]. 肖鳳芳,李偉,朱新平,趙建,洪孝友,朱阿莉,史燕,黃啟成. 基因組學與應用生物學. 2014(06)
[5]凡納濱對蝦新品系體形性狀對其體質(zhì)量的影響[J]. 李玉虎,張志懷,宋芹芹,魏琳,黃皓,周代金,周海龍,相建海. 熱帶生物學報. 2014(04)
[6]Correlation and path analysis of morphological and weight traits in marine gastropod Glossaulax reiniana[J]. 趙力強,何陽陽,楊鳳,聶鴻濤,閆喜武. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2014(04)
[7]日本囊對蝦2種形態(tài)變異類型群體形態(tài)性狀對體質(zhì)量的影響效果分析[J]. 董宏標,蘇永全,毛勇,邊力,王軍. 廈門大學學報(自然科學版). 2014(02)
[8]大黃魚快長相關微衛(wèi)星標記的篩選與驗證[J]. 劉賢德,隋班良,王志勇,蔡明夷. 水生生物學報. 2013(06)
[9]中華鱉(Pelodiscus sinensis)EST-SSR標記與生長性狀相關性分析[J]. 張群英,黃鶴忠,袁文成,李文龍,雍福和,徐雪英,張平. 海洋與湖沼. 2013(06)
[10]凡納濱對蝦大量EST的生物信息學分析[J]. 孫政,柳承璋,李富花,張曉軍,張俊彬,相建海. 海洋學報(中文版). 2013(05)
博士論文
[1]三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)遺傳連鎖圖譜的構建和生長相關性狀QTL定位的研究[D]. 劉磊.中國海洋大學 2014
[2]鯉生長性狀主效QTL育種潛力評估及其在染色體上的定位[D]. 魯翠云.上海海洋大學 2014
[3]基于牙鲆DH群體的遺傳圖譜構建及生長相關性狀的QTL定位[D]. 劉奕.東北農(nóng)業(yè)大學 2013
碩士論文
[1]凡納濱對蝦選育群體遺傳多樣性分析[D]. 包秀鳳.廣東海洋大學 2014
[2]合浦珠母貝選育群體與家系的遺傳多樣性及其與生長表現(xiàn)的相關性分析[D]. 許成帥.上海海洋大學 2013
[3]凡納濱對蝦養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性分析[D]. 李小雙.天津科技大學 2011
[4]凡納濱對蝦EST-SSR遺傳多態(tài)性與生長性狀的關聯(lián)分析[D]. 張瓊.西北農(nóng)林科技大學 2010
本文編號:3171721
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