大黃魚標(biāo)志技術(shù)研究及耐低溫性狀相關(guān)SSR標(biāo)記篩選
發(fā)布時(shí)間:2021-05-06 09:33
大黃魚是我國重要的海洋經(jīng)濟(jì)魚類,由于酷漁濫捕,大黃魚資源嚴(yán)重枯竭,已到了瀕臨滅絕的地步,目前我國大黃魚種質(zhì)面臨著生長變緩,抵抗力變差,耐受性變?nèi),個(gè)體變小和性成熟提早等各種種質(zhì)退化的問題,大黃魚在浙江地區(qū)無法自然過冬對(duì)浙江大黃魚養(yǎng)殖業(yè)造成致命打擊,大黃魚種質(zhì)資源改良選育迫在眉睫。本研究通過群體選育方法,以岱衢洋大黃魚幼魚(耐低溫品系F2代儲(chǔ)備親魚)為研究對(duì)象,初步探索了熒光和PIT兩種傳統(tǒng)標(biāo)志技術(shù)對(duì)大黃魚生長狀況的影響,得到了較優(yōu)標(biāo)志方法。另一方面,對(duì)耐低溫品系F2代儲(chǔ)備親魚進(jìn)行人工低溫脅迫實(shí)驗(yàn),初步篩選出F2代大黃魚耐低溫群體,利用微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù),對(duì)低溫耐受群體和非耐受群體進(jìn)行遺傳多樣性比較分析,并篩選出1個(gè)與耐低溫性狀相關(guān)的微衛(wèi)星標(biāo)記位點(diǎn)。通過傳統(tǒng)標(biāo)志技術(shù)和現(xiàn)代化基因標(biāo)記技術(shù)手段的結(jié)合研究,為耐低溫品系后續(xù)的大黃魚群體選育及培育研究提供了較優(yōu)的標(biāo)志方法和高效的分子標(biāo)記檢測手段。主要研究內(nèi)容及成果如下:1、大黃魚VIE與PIT標(biāo)志的初步研究群體選育目標(biāo)群體較多,在群體數(shù)量較多時(shí)(大于兩個(gè)群體),標(biāo)志技術(shù)的使用不僅可有效保證選育外界環(huán)境一致,保證選育結(jié)果的有效性,還可以減少所使用的養(yǎng)殖...
【文章來源】:浙江海洋大學(xué)浙江省
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
目錄
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 引言
1.2 大黃魚概述
1.2.1 大黃魚分類地位、種類和地理分布
1.2.2 大黃魚的生物學(xué)特性
1.2.2.1 形態(tài)特征
1.2.2.2 生活習(xí)性
1.3 大黃魚的營養(yǎng)價(jià)值
1.4 大黃魚養(yǎng)殖業(yè)產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀
1.4.1 大黃魚漁業(yè)資源狀況
1.4.2 大黃魚養(yǎng)殖現(xiàn)狀
1.5 大黃魚繁殖生物學(xué)
1.5.1 生殖洄游
1.5.2 繁殖季節(jié)
1.5.3 繁殖習(xí)性
1.6 魚類標(biāo)志技術(shù)研究進(jìn)展
1.6.1 體外標(biāo)志技術(shù)
1.6.1.1 鰓蓋骨和鰭穿孔
1.6.1.2 切鰭標(biāo)志
1.6.1.3 烙印
1.6.1.4 顏料標(biāo)志
1.6.1.5 體外標(biāo)
1.6.2 體內(nèi)標(biāo)志技術(shù)
1.6.2.1 編碼金屬標(biāo)
1.6.2.2 被動(dòng)整合雷達(dá)標(biāo)
1.6.2.3 內(nèi)藏可視標(biāo)
1.6.2.4 化學(xué)標(biāo)志
1.6.3 生物遙測技術(shù)
1.7 魚類抗逆性研究
1.8 微衛(wèi)星標(biāo)記的原理
1.8.1 魚類微衛(wèi)星標(biāo)記理論基礎(chǔ)簡介
1.8.1.1 從 EST 等序列數(shù)據(jù)庫中篩選搜索微衛(wèi)星
1.8.1.2 構(gòu)建小片段微衛(wèi)星富集文庫
1.8.1.3 借助近緣物種的微衛(wèi)星序列
1.8.2 微衛(wèi)星分子標(biāo)記在水產(chǎn)動(dòng)物中的應(yīng)用
1.8.2.1 遺傳多樣性分析
1.8.2.2 親緣關(guān)系鑒定
1.8.2.3 遺傳圖譜的構(gòu)建
1.8.3 微衛(wèi)星在性狀相關(guān)分子標(biāo)記的研究進(jìn)展
1.8.4 大黃魚 SSR 標(biāo)記研究進(jìn)展
1.9 本研究的目的和意義
1.10 本研究的技術(shù)路線
第二章 大黃魚 VIE 與 PIT 標(biāo)志的初步研究
2.1 目的和意義
2.2 熒光顏料標(biāo)志和被動(dòng)整合雷達(dá)標(biāo)志
2.3 材料和方法
2.3.1 試驗(yàn)時(shí)間和地點(diǎn)
2.3.2 標(biāo)志魚來源
2.3.3 試劑及標(biāo)記產(chǎn)品
2.3.4 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.4.1 VIE 標(biāo)志
2.3.4.2 PIT 標(biāo)志
2.3.5 標(biāo)志影響生長情況評(píng)估及顯著性檢驗(yàn)
2.4 結(jié)果與分析
2.4.1 兩種標(biāo)志方法比較
2.4.2 標(biāo)志后大黃魚生長情況
2.5 討論
第三章 大黃魚群體的遺傳多樣性分析及耐低溫相關(guān) SSR 標(biāo)記篩選
3.1 目的和意義
3.2 材料與方法
3.2.1 試驗(yàn)時(shí)間與地點(diǎn)
3.2.2 主要試劑及溶液的配制
3.2.2.1 主要試劑
3.2.2.2 溶液的配制
3.2.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器
3.2.4 基因組 DNA 的提取
3.2.5 微衛(wèi)星分析
3.2.5.1 微衛(wèi)星引物獲得
3.2.5.2 SSR-PCR 擴(kuò)增與分析
3.2.6 特異性片段的回收、克隆及測序
3.2.7 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 群體遺傳多樣性分析
3.3.2 耐低溫性狀相關(guān) SSR 標(biāo)記的篩選
3.4 討論
第四章 結(jié)論與展望
4.1 結(jié)論
4.2 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及研究成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大黃魚微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)及其遺傳方式分析[J]. 葉華,任鵬,劉洋,劉賢德,王志勇. 水生生物學(xué)報(bào). 2012(06)
[2]埃及品系尼羅羅非魚三個(gè)世代耐寒性能的選育[J]. 陳忠,唐章生,林勇,楊慧贊,張永德,黃姻,彭婷,張妍. 廣西師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(02)
[3]三疣梭子蟹選育家系微衛(wèi)星分析[J]. 韓智科,劉萍,李健,高保全,陳萍. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2012(01)
[4]我國大黃魚產(chǎn)業(yè)的發(fā)展現(xiàn)狀與對(duì)策[J]. 劉家富,韓坤煌. 福建水產(chǎn). 2011(05)
[5]大黃魚野生群體與養(yǎng)殖群體遺傳多樣性研究[J]. 陳淑吟,徐士霞,張志勇,郭忠仁,孫中響,朱立靜. 海洋科學(xué). 2011(12)
[6]大菱鲆與耐高溫性狀相關(guān)的微衛(wèi)星標(biāo)記篩選[J]. 馬愛軍,許可,黃智慧,王新安. 海洋科學(xué)進(jìn)展. 2011(03)
[7]魚類育種實(shí)踐中的個(gè)體標(biāo)記技術(shù)[J]. 張磊,董在杰,明俊超,梁政遠(yuǎn),蘇勝彥. 水產(chǎn)學(xué)雜志. 2010(01)
[8]大黃魚耐低溫性狀相關(guān)微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選[J]. 高國強(qiáng),常玉梅,韓啟霞,池炳杰,李明云,薛良義,梁利群. 遺傳. 2010(03)
[9]水產(chǎn)動(dòng)物重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)聯(lián)的微衛(wèi)星標(biāo)記研究進(jìn)展[J]. 付春鵬,傅洪拓,蔣速飛,萬山青,喬慧,吳滟,龔永生,熊貽偉. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2010(04)
[10]大黃魚連續(xù)兩代雌核發(fā)育群體的微衛(wèi)星標(biāo)記分析[J]. 葉小軍,王志勇,劉賢德,蔡明夷,姚翠鸞. 水生生物學(xué)報(bào). 2010(01)
博士論文
[1]大黃魚SSR遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及生長相關(guān)性狀的QTL定位[D]. 葉華.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[2]海灣扇貝微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)及遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[D]. 李宏俊.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2009
[3]大黃魚DNA分子標(biāo)記技術(shù)及其在遺傳育種中應(yīng)用研究[D]. 王曉清.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
碩士論文
[1]合浦珠母貝微衛(wèi)星標(biāo)記的分離篩選及F2代家系的遺傳多樣性分析[D]. 油九菊.上海海洋大學(xué) 2012
[2]熒光標(biāo)記斑馬魚稚魚耳石的效果及其對(duì)抗氧化酶活力的影響[D]. 許莉佳.西南大學(xué) 2012
[3]借助遠(yuǎn)緣雜交構(gòu)建大黃魚微衛(wèi)星標(biāo)記連鎖圖譜[D]. 武祥偉.集美大學(xué) 2011
[4]低溫選擇大黃魚子代SSR分析及越冬季節(jié)生理生化指標(biāo)變化[D]. 胡玉珍.寧波大學(xué) 2011
[5]幾種鱘魚及雜交種DNA條形碼研究及分子鑒別[D]. 吳文化.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]大黃魚早期發(fā)育生長與耐環(huán)境因子的遺傳力估計(jì)[D]. 何湘蓉.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[7]櫛江珧微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選及其遺傳多樣性的研究[D]. 李明爽.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[8]大黃魚人工養(yǎng)殖和雌核發(fā)育群體的微衛(wèi)星標(biāo)記分析[D]. 葉小軍.集美大學(xué) 2008
[9]雜色鮑和大黃魚微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選[D]. 任鵬.集美大學(xué) 2008
本文編號(hào):3171687
【文章來源】:浙江海洋大學(xué)浙江省
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
目錄
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 引言
1.2 大黃魚概述
1.2.1 大黃魚分類地位、種類和地理分布
1.2.2 大黃魚的生物學(xué)特性
1.2.2.1 形態(tài)特征
1.2.2.2 生活習(xí)性
1.3 大黃魚的營養(yǎng)價(jià)值
1.4 大黃魚養(yǎng)殖業(yè)產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀
1.4.1 大黃魚漁業(yè)資源狀況
1.4.2 大黃魚養(yǎng)殖現(xiàn)狀
1.5 大黃魚繁殖生物學(xué)
1.5.1 生殖洄游
1.5.2 繁殖季節(jié)
1.5.3 繁殖習(xí)性
1.6 魚類標(biāo)志技術(shù)研究進(jìn)展
1.6.1 體外標(biāo)志技術(shù)
1.6.1.1 鰓蓋骨和鰭穿孔
1.6.1.2 切鰭標(biāo)志
1.6.1.3 烙印
1.6.1.4 顏料標(biāo)志
1.6.1.5 體外標(biāo)
1.6.2 體內(nèi)標(biāo)志技術(shù)
1.6.2.1 編碼金屬標(biāo)
1.6.2.2 被動(dòng)整合雷達(dá)標(biāo)
1.6.2.3 內(nèi)藏可視標(biāo)
1.6.2.4 化學(xué)標(biāo)志
1.6.3 生物遙測技術(shù)
1.7 魚類抗逆性研究
1.8 微衛(wèi)星標(biāo)記的原理
1.8.1 魚類微衛(wèi)星標(biāo)記理論基礎(chǔ)簡介
1.8.1.1 從 EST 等序列數(shù)據(jù)庫中篩選搜索微衛(wèi)星
1.8.1.2 構(gòu)建小片段微衛(wèi)星富集文庫
1.8.1.3 借助近緣物種的微衛(wèi)星序列
1.8.2 微衛(wèi)星分子標(biāo)記在水產(chǎn)動(dòng)物中的應(yīng)用
1.8.2.1 遺傳多樣性分析
1.8.2.2 親緣關(guān)系鑒定
1.8.2.3 遺傳圖譜的構(gòu)建
1.8.3 微衛(wèi)星在性狀相關(guān)分子標(biāo)記的研究進(jìn)展
1.8.4 大黃魚 SSR 標(biāo)記研究進(jìn)展
1.9 本研究的目的和意義
1.10 本研究的技術(shù)路線
第二章 大黃魚 VIE 與 PIT 標(biāo)志的初步研究
2.1 目的和意義
2.2 熒光顏料標(biāo)志和被動(dòng)整合雷達(dá)標(biāo)志
2.3 材料和方法
2.3.1 試驗(yàn)時(shí)間和地點(diǎn)
2.3.2 標(biāo)志魚來源
2.3.3 試劑及標(biāo)記產(chǎn)品
2.3.4 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.4.1 VIE 標(biāo)志
2.3.4.2 PIT 標(biāo)志
2.3.5 標(biāo)志影響生長情況評(píng)估及顯著性檢驗(yàn)
2.4 結(jié)果與分析
2.4.1 兩種標(biāo)志方法比較
2.4.2 標(biāo)志后大黃魚生長情況
2.5 討論
第三章 大黃魚群體的遺傳多樣性分析及耐低溫相關(guān) SSR 標(biāo)記篩選
3.1 目的和意義
3.2 材料與方法
3.2.1 試驗(yàn)時(shí)間與地點(diǎn)
3.2.2 主要試劑及溶液的配制
3.2.2.1 主要試劑
3.2.2.2 溶液的配制
3.2.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器
3.2.4 基因組 DNA 的提取
3.2.5 微衛(wèi)星分析
3.2.5.1 微衛(wèi)星引物獲得
3.2.5.2 SSR-PCR 擴(kuò)增與分析
3.2.6 特異性片段的回收、克隆及測序
3.2.7 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 群體遺傳多樣性分析
3.3.2 耐低溫性狀相關(guān) SSR 標(biāo)記的篩選
3.4 討論
第四章 結(jié)論與展望
4.1 結(jié)論
4.2 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及研究成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大黃魚微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)及其遺傳方式分析[J]. 葉華,任鵬,劉洋,劉賢德,王志勇. 水生生物學(xué)報(bào). 2012(06)
[2]埃及品系尼羅羅非魚三個(gè)世代耐寒性能的選育[J]. 陳忠,唐章生,林勇,楊慧贊,張永德,黃姻,彭婷,張妍. 廣西師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(02)
[3]三疣梭子蟹選育家系微衛(wèi)星分析[J]. 韓智科,劉萍,李健,高保全,陳萍. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2012(01)
[4]我國大黃魚產(chǎn)業(yè)的發(fā)展現(xiàn)狀與對(duì)策[J]. 劉家富,韓坤煌. 福建水產(chǎn). 2011(05)
[5]大黃魚野生群體與養(yǎng)殖群體遺傳多樣性研究[J]. 陳淑吟,徐士霞,張志勇,郭忠仁,孫中響,朱立靜. 海洋科學(xué). 2011(12)
[6]大菱鲆與耐高溫性狀相關(guān)的微衛(wèi)星標(biāo)記篩選[J]. 馬愛軍,許可,黃智慧,王新安. 海洋科學(xué)進(jìn)展. 2011(03)
[7]魚類育種實(shí)踐中的個(gè)體標(biāo)記技術(shù)[J]. 張磊,董在杰,明俊超,梁政遠(yuǎn),蘇勝彥. 水產(chǎn)學(xué)雜志. 2010(01)
[8]大黃魚耐低溫性狀相關(guān)微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選[J]. 高國強(qiáng),常玉梅,韓啟霞,池炳杰,李明云,薛良義,梁利群. 遺傳. 2010(03)
[9]水產(chǎn)動(dòng)物重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)聯(lián)的微衛(wèi)星標(biāo)記研究進(jìn)展[J]. 付春鵬,傅洪拓,蔣速飛,萬山青,喬慧,吳滟,龔永生,熊貽偉. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2010(04)
[10]大黃魚連續(xù)兩代雌核發(fā)育群體的微衛(wèi)星標(biāo)記分析[J]. 葉小軍,王志勇,劉賢德,蔡明夷,姚翠鸞. 水生生物學(xué)報(bào). 2010(01)
博士論文
[1]大黃魚SSR遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及生長相關(guān)性狀的QTL定位[D]. 葉華.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[2]海灣扇貝微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)及遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[D]. 李宏俊.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2009
[3]大黃魚DNA分子標(biāo)記技術(shù)及其在遺傳育種中應(yīng)用研究[D]. 王曉清.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
碩士論文
[1]合浦珠母貝微衛(wèi)星標(biāo)記的分離篩選及F2代家系的遺傳多樣性分析[D]. 油九菊.上海海洋大學(xué) 2012
[2]熒光標(biāo)記斑馬魚稚魚耳石的效果及其對(duì)抗氧化酶活力的影響[D]. 許莉佳.西南大學(xué) 2012
[3]借助遠(yuǎn)緣雜交構(gòu)建大黃魚微衛(wèi)星標(biāo)記連鎖圖譜[D]. 武祥偉.集美大學(xué) 2011
[4]低溫選擇大黃魚子代SSR分析及越冬季節(jié)生理生化指標(biāo)變化[D]. 胡玉珍.寧波大學(xué) 2011
[5]幾種鱘魚及雜交種DNA條形碼研究及分子鑒別[D]. 吳文化.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]大黃魚早期發(fā)育生長與耐環(huán)境因子的遺傳力估計(jì)[D]. 何湘蓉.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[7]櫛江珧微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選及其遺傳多樣性的研究[D]. 李明爽.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[8]大黃魚人工養(yǎng)殖和雌核發(fā)育群體的微衛(wèi)星標(biāo)記分析[D]. 葉小軍.集美大學(xué) 2008
[9]雜色鮑和大黃魚微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選[D]. 任鵬.集美大學(xué) 2008
本文編號(hào):3171687
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