igf2bp3在斑馬魚胚胎發(fā)育中的功能研究
發(fā)布時間:2021-04-22 17:12
在動物早期胚胎發(fā)育過程中,母源遺傳的m RNA對早期胚胎的發(fā)育起到重要作用。雖然在脊椎動物中,母源m RNA降解的機(jī)制已被廣泛研究,但胚胎如何維持母源m RNA的穩(wěn)定性仍不清楚。在本研究中,我們確定了igf2bp3是斑馬魚母源m RNA穩(wěn)定性的重要調(diào)節(jié)因子。在母源合子轉(zhuǎn)換(maternal-to-zygotic transition,MZT)之前,母源igf2bp3缺失會破壞母源的m RNA穩(wěn)定性,導(dǎo)致嚴(yán)重的發(fā)育缺陷,包括異常的細(xì)胞骨架重組和細(xì)胞分裂。然而,在igf2bp3突變體中,未受精卵的母源m RNA表達(dá)水平卻是正常的。另外,Igf2bp3能結(jié)合母源m RNA,通過GO富集分析發(fā)現(xiàn)這些基因大部分富集在RNA調(diào)控與代謝、細(xì)胞分裂、細(xì)胞骨架組裝和表觀修飾過程中。事實上,igf2bp3的缺失會破壞母源m RNA穩(wěn)定性,導(dǎo)致母源m RNA在pre-MZT階段發(fā)生大規(guī)模降解。相反,過表達(dá)igf2bp3 m RNA則會增強Igf2bp3結(jié)合的母源m RNA穩(wěn)定性,并伴有胚胎發(fā)育遲緩現(xiàn)象?傊,這些發(fā)現(xiàn)說明Igf2bp3通過結(jié)合母源m RNA并維持母源m RNA的穩(wěn)定性,控制斑馬魚早期胚胎發(fā)育...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:114 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語表
第一章 前言
1 母源因子概述
1.1 母源因子簡介
1.2 母源突變體的構(gòu)建
1.3 母源因子的功能
2 母源合子轉(zhuǎn)換概述
2.1 母源RNA的降解
2.2 合子基因組激活
3 IGF2BPs基因家族概述
3.1 IGF2BPs簡介
3.2 IGF2BPs基因家族研究進(jìn)展
4 RNA甲基化修飾概述
4.1 RNA甲基化修飾簡介
6ARNA甲基化研究進(jìn)展"> 4.2 m6ARNA甲基化研究進(jìn)展
5 生殖質(zhì)及生殖細(xì)胞概述
5.1 生殖質(zhì)及生殖細(xì)胞簡介
5.2 生殖質(zhì)及生殖細(xì)胞研究進(jìn)展
6 實驗動物斑馬魚的研究背景
7 研究目的和意義
第二章 材料與方法
1 實驗動物
2 實驗所用載體和菌株
3 儀器設(shè)備
4 實驗試劑
5 RNA提取
6 RNA逆轉(zhuǎn)錄
7 熒光定量PCR
8 斑馬魚胚胎轉(zhuǎn)錄組測序
9 基因組DNA提取
10 DNA純化回收
11 斑馬魚胚胎整體原位雜交(WISH)
12 斑馬魚igf2bp3基因突變體構(gòu)建
13 斑馬魚敲除igf2bp3靶位點有效性驗證
14 斑馬魚igf2bp3突變體篩選
15 RNA穩(wěn)定性實驗
16 質(zhì)粒構(gòu)建
17 免疫熒光
18 蛋白互作實驗
19 RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀
20 RNA甲基化免疫沉淀
21 體外轉(zhuǎn)錄合成過表達(dá)mRNA和挽救實驗
22 組織切片蘇木精-伊紅(HE)染色
23 蛋白免疫印跡
24 數(shù)據(jù)分析
25 實驗所用引物
第三章 結(jié)果
1 Igf2bp3維持母源RNA穩(wěn)定以保證胚胎正常發(fā)育
1.1 igf2bp3mRNA的表達(dá)模式
1.2 igf2bp3突變體構(gòu)建及驗證
1.3 母源igf2bp3缺失導(dǎo)致胚胎發(fā)育缺陷
1.4 母源igf2bp3突變體中細(xì)胞骨架組裝出現(xiàn)缺陷
1.5 母源igf2bp3突變體胚胎中的母源RNA降解更快
1.6 igf2bp3突變不影響卵母細(xì)胞的發(fā)生
1.7 Igf2bp3蛋白結(jié)合母源mRNA調(diào)節(jié)其穩(wěn)定性
1.8 過表達(dá)igf2bp3mRNA可以延緩母源RNA的降解
6A讀取器Igf2bp3通過調(diào)控m6A依賴的基因表達(dá)實現(xiàn)種質(zhì)組裝"> 2 m6A讀取器Igf2bp3通過調(diào)控m6A依賴的基因表達(dá)實現(xiàn)種質(zhì)組裝
2.1 Igf2bp3與Buc互作并共定位在種質(zhì)中
2.2 母源igf2bp3突變導(dǎo)致生殖質(zhì)組裝與生殖細(xì)胞發(fā)生出現(xiàn)缺陷
2.3 igf2bp3突變對卵母細(xì)胞中生殖質(zhì)mRNA的定位和表達(dá)影響較小
2.4 Igf2bp3調(diào)控早期胚胎中生殖質(zhì)mRNA的表達(dá)
6A修飾基因的表達(dá)"> 2.5 Igf2bp3調(diào)控m6A修飾基因的表達(dá)
6A修飾的生殖質(zhì)mRNA并調(diào)節(jié)其穩(wěn)定性"> 2.6 Igf2bp3蛋白結(jié)合m6A修飾的生殖質(zhì)mRNA并調(diào)節(jié)其穩(wěn)定性
第四章 討論
1 Igf2bp3維持母源RNA穩(wěn)定以保證胚胎正常發(fā)育
6A讀取器Igf2bp3通過調(diào)控m6A依賴的基因表達(dá)實現(xiàn)種質(zhì)組裝"> 2 m6A讀取器Igf2bp3通過調(diào)控m6A依賴的基因表達(dá)實現(xiàn)種質(zhì)組裝
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]斑馬魚母源因子在胚胎發(fā)育中的作用[J]. 胥鵬飛,孟安明. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2014(10)
[2]以斑馬魚為模式動物研究器官的發(fā)育與再生[J]. 李禮,羅凌飛. 遺傳. 2013(04)
[3]Tudor and its domains: germ cell formation from a Tudor perspective[J]. Travis THOMSON,Paul LASKO. Cell Research. 2005(04)
本文編號:3154154
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:114 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語表
第一章 前言
1 母源因子概述
1.1 母源因子簡介
1.2 母源突變體的構(gòu)建
1.3 母源因子的功能
2 母源合子轉(zhuǎn)換概述
2.1 母源RNA的降解
2.2 合子基因組激活
3 IGF2BPs基因家族概述
3.1 IGF2BPs簡介
3.2 IGF2BPs基因家族研究進(jìn)展
4 RNA甲基化修飾概述
4.1 RNA甲基化修飾簡介
6ARNA甲基化研究進(jìn)展"> 4.2 m6ARNA甲基化研究進(jìn)展
5 生殖質(zhì)及生殖細(xì)胞概述
5.1 生殖質(zhì)及生殖細(xì)胞簡介
5.2 生殖質(zhì)及生殖細(xì)胞研究進(jìn)展
6 實驗動物斑馬魚的研究背景
7 研究目的和意義
第二章 材料與方法
1 實驗動物
2 實驗所用載體和菌株
3 儀器設(shè)備
4 實驗試劑
5 RNA提取
6 RNA逆轉(zhuǎn)錄
7 熒光定量PCR
8 斑馬魚胚胎轉(zhuǎn)錄組測序
9 基因組DNA提取
10 DNA純化回收
11 斑馬魚胚胎整體原位雜交(WISH)
12 斑馬魚igf2bp3基因突變體構(gòu)建
13 斑馬魚敲除igf2bp3靶位點有效性驗證
14 斑馬魚igf2bp3突變體篩選
15 RNA穩(wěn)定性實驗
16 質(zhì)粒構(gòu)建
17 免疫熒光
18 蛋白互作實驗
19 RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀
20 RNA甲基化免疫沉淀
21 體外轉(zhuǎn)錄合成過表達(dá)mRNA和挽救實驗
22 組織切片蘇木精-伊紅(HE)染色
23 蛋白免疫印跡
24 數(shù)據(jù)分析
25 實驗所用引物
第三章 結(jié)果
1 Igf2bp3維持母源RNA穩(wěn)定以保證胚胎正常發(fā)育
1.1 igf2bp3mRNA的表達(dá)模式
1.2 igf2bp3突變體構(gòu)建及驗證
1.3 母源igf2bp3缺失導(dǎo)致胚胎發(fā)育缺陷
1.4 母源igf2bp3突變體中細(xì)胞骨架組裝出現(xiàn)缺陷
1.5 母源igf2bp3突變體胚胎中的母源RNA降解更快
1.6 igf2bp3突變不影響卵母細(xì)胞的發(fā)生
1.7 Igf2bp3蛋白結(jié)合母源mRNA調(diào)節(jié)其穩(wěn)定性
1.8 過表達(dá)igf2bp3mRNA可以延緩母源RNA的降解
6A讀取器Igf2bp3通過調(diào)控m6A依賴的基因表達(dá)實現(xiàn)種質(zhì)組裝"> 2 m6A讀取器Igf2bp3通過調(diào)控m6A依賴的基因表達(dá)實現(xiàn)種質(zhì)組裝
2.1 Igf2bp3與Buc互作并共定位在種質(zhì)中
2.2 母源igf2bp3突變導(dǎo)致生殖質(zhì)組裝與生殖細(xì)胞發(fā)生出現(xiàn)缺陷
2.3 igf2bp3突變對卵母細(xì)胞中生殖質(zhì)mRNA的定位和表達(dá)影響較小
2.4 Igf2bp3調(diào)控早期胚胎中生殖質(zhì)mRNA的表達(dá)
6A修飾基因的表達(dá)"> 2.5 Igf2bp3調(diào)控m6A修飾基因的表達(dá)
6A修飾的生殖質(zhì)mRNA并調(diào)節(jié)其穩(wěn)定性"> 2.6 Igf2bp3蛋白結(jié)合m6A修飾的生殖質(zhì)mRNA并調(diào)節(jié)其穩(wěn)定性
第四章 討論
1 Igf2bp3維持母源RNA穩(wěn)定以保證胚胎正常發(fā)育
6A讀取器Igf2bp3通過調(diào)控m6A依賴的基因表達(dá)實現(xiàn)種質(zhì)組裝"> 2 m6A讀取器Igf2bp3通過調(diào)控m6A依賴的基因表達(dá)實現(xiàn)種質(zhì)組裝
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]斑馬魚母源因子在胚胎發(fā)育中的作用[J]. 胥鵬飛,孟安明. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2014(10)
[2]以斑馬魚為模式動物研究器官的發(fā)育與再生[J]. 李禮,羅凌飛. 遺傳. 2013(04)
[3]Tudor and its domains: germ cell formation from a Tudor perspective[J]. Travis THOMSON,Paul LASKO. Cell Research. 2005(04)
本文編號:3154154
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/3154154.html
最近更新
教材專著