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基于線粒體DNA標(biāo)記對(duì)3個(gè)華鳈群體的遺傳結(jié)構(gòu)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-04-19 23:16
  華鳈(Sarcocheilichthys sinensis)是一種兼具食用和觀賞價(jià)值的小型鯉科魚(yú)類。采用Cytb和D-loop 2個(gè)線粒體DNA序列對(duì)洪澤湖、千島湖和西湖3個(gè)群體的45尾華鳈樣本進(jìn)行了遺傳變異與遺傳結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果顯示,在長(zhǎng)度為404 bp的Cytb序列中,共檢測(cè)出變異位點(diǎn)22個(gè)(5.4%),定義了10種單倍型;在998 bp的D-loop序列中,變異位點(diǎn)有40個(gè)(4.0%),構(gòu)成了7種單倍型。2個(gè)標(biāo)記在華鳈群體中的平均單倍型多樣性、核苷酸多樣性和平均核苷酸差異數(shù)分別為0.840±0.033、0.012±0.002、4.759±1.660(Cytb)和0.755±0.036、0.006±0.002、6.430±2.241(D-loop),表現(xiàn)了較高的遺傳多態(tài)性。遺傳多樣性大小順序?yàn)楹闈珊?gt;西湖>千島湖,3個(gè)群體間基因交流較少,表現(xiàn)出極大的遺傳分化,此外,分子變異分析結(jié)果表明華鳈變異的主要來(lái)源為群體內(nèi)變異。本研究結(jié)果將為了解我國(guó)東部地區(qū)華鳈的遺傳多樣性現(xiàn)狀提供基礎(chǔ)資料,同時(shí)為華鳈種質(zhì)資源保護(hù)與合理利用提供參考。 

【文章來(lái)源】:江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(05)

【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 樣本采集及DNA抽提
    1.2 線粒體DNA片段擴(kuò)增與測(cè)序
    1.3 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
    2.1 華鳈C(jī)ytb序列變異與群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
    2.2 華鳈D-loop序列變異與群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
3 討論
    3.1 華鳈C(jī)ytb和D-loop堿基組成與變異程度
    3.2 華鳈遺傳多樣性與群體遺傳分化



本文編號(hào):3148504

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