太平洋中部黃鰭金槍魚種群遺傳多樣性研究
發(fā)布時間:2021-03-28 23:48
黃鰭金槍魚(Thunnus albacares)是一種高度洄游的大洋性魚類,廣泛分布于熱帶和亞熱水的溫暖水域,遍及太平洋、大西洋和印度洋。其較高的經(jīng)濟價值使其成為遠洋漁業(yè)重要的捕撈對象,現(xiàn)已有研究指出,中西太平洋黃鰭金槍魚已經(jīng)處于過度捕撈的狀態(tài),呼吁對其進行合理的管理,確保太平洋黃鰭金槍魚漁業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。清楚認(rèn)識太平洋中部黃鰭金槍魚種群遺傳現(xiàn)狀,有助于合理提出黃鰭金槍魚漁業(yè)資源的管理策略,實現(xiàn)金槍魚漁業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。為此,本文采用線粒體細胞色素c氧化酶Ⅰ(COⅠ)、線粒體細胞色素b(Cytb)基因和線粒體DNA控制區(qū)D-Loop(mtDNA D-Loop)三個分子標(biāo)記對太平洋中部黃鰭金槍魚種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)做深入研究,取得以下研究結(jié)論:(1)通過對太平洋中部11個黃鰭金槍魚采樣群體203個樣本研究發(fā)現(xiàn),203個樣本獲得的203條黃鰭金槍魚線粒體細胞色素c氧化酶Ⅰ(COⅠ)基因序列,得到38個變異位點,定義61個單倍型。序列多樣性分析結(jié)果顯示:11個采樣群體單倍型多樣指數(shù)為0.650,核苷酸多樣性指數(shù)為0.00364。分子方差分析揭示了94.13%的變異來源種群內(nèi),只有5.87%...
【文章來源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
黃鰭金槍魚采樣位點分布圖
18 圖 2-2 核苷酸不配對曲線A 東部太平洋黃鰭金槍魚核苷酸不配對曲線B 西部太平洋黃鰭金槍魚核苷酸不配對曲線Fig2-2. Mismatch distribution for the sampling locations of T.albacoreA as mismatch distribution for the East Pacific Ocean populationB as mismatch distribution for the West Pacific Ocean population
圖 2-3 黃鰭金槍魚單倍型進化網(wǎng)絡(luò)圖Fig. 2-3 Haplotypes evolutionary network of T.albacore2.3 討論2.3.1 群體遺傳多樣性合理掌握太平洋黃鰭金槍魚種群的遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)有助于太平洋漁業(yè)管理組織對黃鰭金槍魚漁業(yè)管理策略的制定以及實施,而關(guān)于太平洋黃鰭金槍魚種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究,不同的學(xué)者提出不同的研究結(jié)論,為此,本文將采用線粒體 COI 基因?qū)μ窖笕S鰭金槍魚的種群遺傳結(jié)構(gòu)做合理的探討。π 是表征群體內(nèi)遺傳多樣性的的重要指標(biāo)[71],π 值和 h 值越大,表明種群的遺傳多樣性越高,也即遺傳多樣性越豐富[72]。但是,標(biāo)記的基因以及基因序列的大小,可以導(dǎo)致研究群體遺傳多樣性和核苷酸多樣性的結(jié)果[73]。表 2-2 結(jié)果顯示,本研究的 11 個太平洋中部黃鰭金槍魚群體, h =0.650±0.040 和 π = 0.00364±0.00044 具有較高的單倍型多樣性和較低的核苷酸多
【參考文獻】:
期刊論文
[1]南太平洋所羅門群島海域黃鰭金槍魚的漁業(yè)生物學(xué)特性[J]. 陳峰,郭愛,朱文斌,張洪亮,周永東,徐漢祥,徐開達. 漁業(yè)科學(xué)進展. 2013(03)
[2]基于COI部分序列探討南海鯧屬魚類系統(tǒng)進化與種群遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 孫鵬,尹飛,施兆鴻,彭士明. 海洋科學(xué). 2012(06)
[3]馬紹爾群島海域和吉爾伯特群島海域黃鰭金槍魚生物學(xué)特性比較[J]. 宋利明,惠明明. 海洋漁業(yè). 2012(02)
[4]長江口及其南部鄰近地區(qū)大彈涂魚種群遺傳結(jié)構(gòu)及種群歷史分析[J]. 劉至治,楊金權(quán),王正琦,唐文喬. 動物學(xué)研究. 2009(01)
[5]3種鯧屬魚類線粒體COI基因序列變異及系統(tǒng)進化[J]. 張鳳英,馬凌波,施兆鴻,馬春艷. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2008(03)
[6]世界主要金槍魚類資源狀況與管理[J]. 黃斌. 現(xiàn)代漁業(yè)信息. 2008(01)
[7]發(fā)展中西太平洋金槍魚圍網(wǎng)的問題與對策[J]. 王學(xué)鋒,盧伙勝,顏云榕. 南方水產(chǎn). 2007(06)
[8]中西太平洋金槍魚漁業(yè)概況[J]. 張新軍,楊軍勇,連大軍. 齊魯漁業(yè). 2006(07)
[9]鳳鱭兩群體線粒體細胞色素b基因片斷多態(tài)性及進化特征[J]. 程起群,韓金娣,王云龍,盧大儒. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2006(03)
[10]藏羚羊mtDNA D-loop區(qū)遺傳多樣性研究[J]. 周慧,李迪強,張于光,易湘蓉,劉毅. 遺傳. 2006(03)
碩士論文
[1]基于線粒體細胞色素b的3江水系草魚群體遺傳多樣性分析[D]. 朱葉.暨南大學(xué) 2012
本文編號:3106474
【文章來源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
黃鰭金槍魚采樣位點分布圖
18 圖 2-2 核苷酸不配對曲線A 東部太平洋黃鰭金槍魚核苷酸不配對曲線B 西部太平洋黃鰭金槍魚核苷酸不配對曲線Fig2-2. Mismatch distribution for the sampling locations of T.albacoreA as mismatch distribution for the East Pacific Ocean populationB as mismatch distribution for the West Pacific Ocean population
圖 2-3 黃鰭金槍魚單倍型進化網(wǎng)絡(luò)圖Fig. 2-3 Haplotypes evolutionary network of T.albacore2.3 討論2.3.1 群體遺傳多樣性合理掌握太平洋黃鰭金槍魚種群的遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)有助于太平洋漁業(yè)管理組織對黃鰭金槍魚漁業(yè)管理策略的制定以及實施,而關(guān)于太平洋黃鰭金槍魚種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究,不同的學(xué)者提出不同的研究結(jié)論,為此,本文將采用線粒體 COI 基因?qū)μ窖笕S鰭金槍魚的種群遺傳結(jié)構(gòu)做合理的探討。π 是表征群體內(nèi)遺傳多樣性的的重要指標(biāo)[71],π 值和 h 值越大,表明種群的遺傳多樣性越高,也即遺傳多樣性越豐富[72]。但是,標(biāo)記的基因以及基因序列的大小,可以導(dǎo)致研究群體遺傳多樣性和核苷酸多樣性的結(jié)果[73]。表 2-2 結(jié)果顯示,本研究的 11 個太平洋中部黃鰭金槍魚群體, h =0.650±0.040 和 π = 0.00364±0.00044 具有較高的單倍型多樣性和較低的核苷酸多
【參考文獻】:
期刊論文
[1]南太平洋所羅門群島海域黃鰭金槍魚的漁業(yè)生物學(xué)特性[J]. 陳峰,郭愛,朱文斌,張洪亮,周永東,徐漢祥,徐開達. 漁業(yè)科學(xué)進展. 2013(03)
[2]基于COI部分序列探討南海鯧屬魚類系統(tǒng)進化與種群遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 孫鵬,尹飛,施兆鴻,彭士明. 海洋科學(xué). 2012(06)
[3]馬紹爾群島海域和吉爾伯特群島海域黃鰭金槍魚生物學(xué)特性比較[J]. 宋利明,惠明明. 海洋漁業(yè). 2012(02)
[4]長江口及其南部鄰近地區(qū)大彈涂魚種群遺傳結(jié)構(gòu)及種群歷史分析[J]. 劉至治,楊金權(quán),王正琦,唐文喬. 動物學(xué)研究. 2009(01)
[5]3種鯧屬魚類線粒體COI基因序列變異及系統(tǒng)進化[J]. 張鳳英,馬凌波,施兆鴻,馬春艷. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2008(03)
[6]世界主要金槍魚類資源狀況與管理[J]. 黃斌. 現(xiàn)代漁業(yè)信息. 2008(01)
[7]發(fā)展中西太平洋金槍魚圍網(wǎng)的問題與對策[J]. 王學(xué)鋒,盧伙勝,顏云榕. 南方水產(chǎn). 2007(06)
[8]中西太平洋金槍魚漁業(yè)概況[J]. 張新軍,楊軍勇,連大軍. 齊魯漁業(yè). 2006(07)
[9]鳳鱭兩群體線粒體細胞色素b基因片斷多態(tài)性及進化特征[J]. 程起群,韓金娣,王云龍,盧大儒. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2006(03)
[10]藏羚羊mtDNA D-loop區(qū)遺傳多樣性研究[J]. 周慧,李迪強,張于光,易湘蓉,劉毅. 遺傳. 2006(03)
碩士論文
[1]基于線粒體細胞色素b的3江水系草魚群體遺傳多樣性分析[D]. 朱葉.暨南大學(xué) 2012
本文編號:3106474
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