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基于細胞色素b的中國9個大銀魚群體遺傳多樣性研究

發(fā)布時間:2021-03-25 20:48
  大銀魚(Protosalanx hyalocranius)是東亞特有一年生小型魚類,有河海洄游和淡水定居2種生態(tài)型,是我國重要的出口創(chuàng)匯魚類。近年來受自然和人為因素影響,土著大銀魚資源枯竭,同時全國范圍內(nèi)廣泛移植使很多水體的大銀魚來源復雜。本文測定了6水系9群體180尾大銀魚的線粒體Cytb序列,旨在了解中國大銀魚的遺傳背景,為種質(zhì)資源的有效保護和合理利用提供理論依據(jù),結(jié)果如下:1、大銀魚Cytb序列全長1141bp,多態(tài)位點26個,簡約信息位點16個,單倍型27個,其中單倍型1、5、6、14為優(yōu)勢單倍型,單倍型1在全部流域均有分布,單倍型5和單倍型6主要分布在移植區(qū),其余局域分布。2、中國大銀魚單倍型多樣性高而核苷酸多樣性低(Hd=0.789±0.021,π=0.0014±0.0001),總體遺傳多樣性偏低,也沒有明顯的譜系結(jié)構(gòu)和地理結(jié)構(gòu)。就土著群體而言,洄游型的遼河口、鴨綠江口和長江口群體間不存在明顯分化(Fst=0.0544-0.0834,P>0.05);長江流域陸封型巢湖和太湖群體間存在顯著分化(Fst=0.1394,P<0.01);洄游型和陸封型大銀魚不存在顯著分... 

【文章來源】:暨南大學廣東省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:75 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于細胞色素b的中國9個大銀魚群體遺傳多樣性研究


-1中國大銀魚的采樣地點分布示意圖(中國地圖出版社,2003)

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ddH2O 22.2 μL2.6.3 PCR 反應程序大銀魚線粒體各基因序列 PCR 擴增反應程序如下:94℃預變性 4min;循環(huán) 36 次,94℃變性 30s,55℃退火 30s,72℃延伸 45s;最后延伸 5min。2.6.4 瓊脂糖凝膠檢測PCR 擴增產(chǎn)物用 1%-1.2%的瓊脂糖凝膠水平型電泳檢測,電壓為 100V,電泳時間約分鐘。電泳完后將凝膠置于 EB 溶液中染色 30min,雙蒸水漂洗后用凝膠成像系統(tǒng)觀察結(jié)若電泳圖譜和預期的片段大小相符,則表明本次擴增結(jié)果較為可靠。然后選擇帶型單規(guī)則且亮度與 DNA Marker 相當?shù)?PCR 產(chǎn)物送去測序,如圖 2.6.4-1。

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暨南大學碩士學位論文表 3.1.1-1 大銀魚 Cytb 序列核苷酸替換率Table3.1-1 The pattern of nucleotide substitution of P. hyalocranius Cytb sequenA T C G - 3.38 3.37 26.512.53 - 8.03 1.92 2.53 7.27 - 1.92 35.08 3.38 3.73 -1.2 大銀魚 Cytb 序列的密碼子偏倚性分析

【參考文獻】:
期刊論文
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[7]我國銀魚資源的分布及加工概況[J]. 胡駿,倪瑞芳,王開洋.  河北漁業(yè). 2010(09)
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碩士論文
[1]銀魚科魚類的分子系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 郭立.復旦大學 2010
[2]中國野生香魚(Plecoglossus altivelis)遺傳多樣性分析[D]. 樂小亮.暨南大學 2010
[3]長江流域兩種新銀魚分子生態(tài)學初步研究[D]. 史潔薔.首都師范大學 2008
[4]大銀魚遺傳多樣性的研究[D]. 張穎.天津師范大學 2005



本文編號:3100304

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