基于細(xì)胞色素b的中國(guó)9個(gè)大銀魚群體遺傳多樣性研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-25 20:48
大銀魚(Protosalanx hyalocranius)是東亞特有一年生小型魚類,有河海洄游和淡水定居2種生態(tài)型,是我國(guó)重要的出口創(chuàng)匯魚類。近年來(lái)受自然和人為因素影響,土著大銀魚資源枯竭,同時(shí)全國(guó)范圍內(nèi)廣泛移植使很多水體的大銀魚來(lái)源復(fù)雜。本文測(cè)定了6水系9群體180尾大銀魚的線粒體Cytb序列,旨在了解中國(guó)大銀魚的遺傳背景,為種質(zhì)資源的有效保護(hù)和合理利用提供理論依據(jù),結(jié)果如下:1、大銀魚Cytb序列全長(zhǎng)1141bp,多態(tài)位點(diǎn)26個(gè),簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)16個(gè),單倍型27個(gè),其中單倍型1、5、6、14為優(yōu)勢(shì)單倍型,單倍型1在全部流域均有分布,單倍型5和單倍型6主要分布在移植區(qū),其余局域分布。2、中國(guó)大銀魚單倍型多樣性高而核苷酸多樣性低(Hd=0.789±0.021,π=0.0014±0.0001),總體遺傳多樣性偏低,也沒(méi)有明顯的譜系結(jié)構(gòu)和地理結(jié)構(gòu)。就土著群體而言,洄游型的遼河口、鴨綠江口和長(zhǎng)江口群體間不存在明顯分化(Fst=0.0544-0.0834,P>0.05);長(zhǎng)江流域陸封型巢湖和太湖群體間存在顯著分化(Fst=0.1394,P<0.01);洄游型和陸封型大銀魚不存在顯著分...
【文章來(lái)源】:暨南大學(xué)廣東省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
-1中國(guó)大銀魚的采樣地點(diǎn)分布示意圖(中國(guó)地圖出版社,2003)
ddH2O 22.2 μL2.6.3 PCR 反應(yīng)程序大銀魚線粒體各基因序列 PCR 擴(kuò)增反應(yīng)程序如下:94℃預(yù)變性 4min;循環(huán) 36 次,94℃變性 30s,55℃退火 30s,72℃延伸 45s;最后延伸 5min。2.6.4 瓊脂糖凝膠檢測(cè)PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物用 1%-1.2%的瓊脂糖凝膠水平型電泳檢測(cè),電壓為 100V,電泳時(shí)間約分鐘。電泳完后將凝膠置于 EB 溶液中染色 30min,雙蒸水漂洗后用凝膠成像系統(tǒng)觀察結(jié)若電泳圖譜和預(yù)期的片段大小相符,則表明本次擴(kuò)增結(jié)果較為可靠。然后選擇帶型單規(guī)則且亮度與 DNA Marker 相當(dāng)?shù)?PCR 產(chǎn)物送去測(cè)序,如圖 2.6.4-1。
暨南大學(xué)碩士學(xué)位論文表 3.1.1-1 大銀魚 Cytb 序列核苷酸替換率Table3.1-1 The pattern of nucleotide substitution of P. hyalocranius Cytb sequenA T C G - 3.38 3.37 26.512.53 - 8.03 1.92 2.53 7.27 - 1.92 35.08 3.38 3.73 -1.2 大銀魚 Cytb 序列的密碼子偏倚性分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大銀魚線粒體DNA細(xì)胞色素b序列的研究[J]. 肖明松,夏海武,鮑方印,康健. 安徽科技學(xué)院學(xué)報(bào). 2014(05)
[2]基于回歸分析的巢湖銀魚數(shù)量變化因素[J]. 呂云鵬,魏紅晶,金梓建,陶有田. 科技視界. 2014(14)
[3]基于線粒體DNA D-loop序列分析養(yǎng)殖刀鱭與湖鱭的遺傳多樣性[J]. 徐鋼春,魏廣蓮,李建林,徐跑,張呈祥,顧若波. 大連海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(05)
[4]叉尾斗魚遺傳多樣性的RAPD分析[J]. 劉宏毅,黎明星,肖俊,黃愉淋,張明,甘西. 大連海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(02)
[5]3個(gè)地理群體大銀魚營(yíng)養(yǎng)成分的分析與評(píng)價(jià)[J]. 周彥鋒,徐東坡,單俊峰,尤洋. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(05)
[6]基于四個(gè)線粒體基因片段的銀魚科魚類系統(tǒng)發(fā)育[J]. 郭立,李雋,王忠鎖,傅萃長(zhǎng). 水生生物學(xué)報(bào). 2011(03)
[7]我國(guó)銀魚資源的分布及加工概況[J]. 胡駿,倪瑞芳,王開洋. 河北漁業(yè). 2010(09)
[8]喬氏新銀魚基于細(xì)胞色素b序列的種群遺傳結(jié)構(gòu)和種群歷史[J]. 趙亮,張潔,劉志瑾,許木啟,李明. 生物多樣性. 2010(03)
[9]太湖新銀魚線粒體D-loop和Cyt b片段序列結(jié)構(gòu)與進(jìn)化速率比較[J]. 趙亮,謝本貴,劉志瑾,許木啟,李明. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2010(02)
[10]長(zhǎng)江下游銅魚線粒體DNA(mtDNA)遺傳多樣性的PCR-RFLP分析[J]. 張敏瑩,段金榮,徐東坡,劉凱,施煒綱. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2009(22)
碩士論文
[1]銀魚科魚類的分子系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 郭立.復(fù)旦大學(xué) 2010
[2]中國(guó)野生香魚(Plecoglossus altivelis)遺傳多樣性分析[D]. 樂(lè)小亮.暨南大學(xué) 2010
[3]長(zhǎng)江流域兩種新銀魚分子生態(tài)學(xué)初步研究[D]. 史潔薔.首都師范大學(xué) 2008
[4]大銀魚遺傳多樣性的研究[D]. 張穎.天津師范大學(xué) 2005
本文編號(hào):3100304
【文章來(lái)源】:暨南大學(xué)廣東省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
-1中國(guó)大銀魚的采樣地點(diǎn)分布示意圖(中國(guó)地圖出版社,2003)
ddH2O 22.2 μL2.6.3 PCR 反應(yīng)程序大銀魚線粒體各基因序列 PCR 擴(kuò)增反應(yīng)程序如下:94℃預(yù)變性 4min;循環(huán) 36 次,94℃變性 30s,55℃退火 30s,72℃延伸 45s;最后延伸 5min。2.6.4 瓊脂糖凝膠檢測(cè)PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物用 1%-1.2%的瓊脂糖凝膠水平型電泳檢測(cè),電壓為 100V,電泳時(shí)間約分鐘。電泳完后將凝膠置于 EB 溶液中染色 30min,雙蒸水漂洗后用凝膠成像系統(tǒng)觀察結(jié)若電泳圖譜和預(yù)期的片段大小相符,則表明本次擴(kuò)增結(jié)果較為可靠。然后選擇帶型單規(guī)則且亮度與 DNA Marker 相當(dāng)?shù)?PCR 產(chǎn)物送去測(cè)序,如圖 2.6.4-1。
暨南大學(xué)碩士學(xué)位論文表 3.1.1-1 大銀魚 Cytb 序列核苷酸替換率Table3.1-1 The pattern of nucleotide substitution of P. hyalocranius Cytb sequenA T C G - 3.38 3.37 26.512.53 - 8.03 1.92 2.53 7.27 - 1.92 35.08 3.38 3.73 -1.2 大銀魚 Cytb 序列的密碼子偏倚性分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大銀魚線粒體DNA細(xì)胞色素b序列的研究[J]. 肖明松,夏海武,鮑方印,康健. 安徽科技學(xué)院學(xué)報(bào). 2014(05)
[2]基于回歸分析的巢湖銀魚數(shù)量變化因素[J]. 呂云鵬,魏紅晶,金梓建,陶有田. 科技視界. 2014(14)
[3]基于線粒體DNA D-loop序列分析養(yǎng)殖刀鱭與湖鱭的遺傳多樣性[J]. 徐鋼春,魏廣蓮,李建林,徐跑,張呈祥,顧若波. 大連海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(05)
[4]叉尾斗魚遺傳多樣性的RAPD分析[J]. 劉宏毅,黎明星,肖俊,黃愉淋,張明,甘西. 大連海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(02)
[5]3個(gè)地理群體大銀魚營(yíng)養(yǎng)成分的分析與評(píng)價(jià)[J]. 周彥鋒,徐東坡,單俊峰,尤洋. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(05)
[6]基于四個(gè)線粒體基因片段的銀魚科魚類系統(tǒng)發(fā)育[J]. 郭立,李雋,王忠鎖,傅萃長(zhǎng). 水生生物學(xué)報(bào). 2011(03)
[7]我國(guó)銀魚資源的分布及加工概況[J]. 胡駿,倪瑞芳,王開洋. 河北漁業(yè). 2010(09)
[8]喬氏新銀魚基于細(xì)胞色素b序列的種群遺傳結(jié)構(gòu)和種群歷史[J]. 趙亮,張潔,劉志瑾,許木啟,李明. 生物多樣性. 2010(03)
[9]太湖新銀魚線粒體D-loop和Cyt b片段序列結(jié)構(gòu)與進(jìn)化速率比較[J]. 趙亮,謝本貴,劉志瑾,許木啟,李明. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2010(02)
[10]長(zhǎng)江下游銅魚線粒體DNA(mtDNA)遺傳多樣性的PCR-RFLP分析[J]. 張敏瑩,段金榮,徐東坡,劉凱,施煒綱. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2009(22)
碩士論文
[1]銀魚科魚類的分子系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 郭立.復(fù)旦大學(xué) 2010
[2]中國(guó)野生香魚(Plecoglossus altivelis)遺傳多樣性分析[D]. 樂(lè)小亮.暨南大學(xué) 2010
[3]長(zhǎng)江流域兩種新銀魚分子生態(tài)學(xué)初步研究[D]. 史潔薔.首都師范大學(xué) 2008
[4]大銀魚遺傳多樣性的研究[D]. 張穎.天津師范大學(xué) 2005
本文編號(hào):3100304
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