團(tuán)頭魴JAK家族基因的鑒定和表達(dá)分析
發(fā)布時間:2021-03-23 06:51
大量的研究表明,JAK/STAT信號通路作為非特異性免疫系統(tǒng)的重要組成,在脊椎動物抗細(xì)菌活動中起著關(guān)鍵的作用。JAK激酶是一種非受體型絡(luò)氨酸激酶,在哺乳動物中,已被證實是參與干擾素或白介素介導(dǎo)信號傳導(dǎo)的關(guān)鍵蛋白。團(tuán)頭魴(Megalobrama amblycephala)是我國重要的淡水養(yǎng)殖魚類之一,但由嗜水氣單胞菌(Aeromonas hydrophila)引起的細(xì)菌性敗血癥嚴(yán)重影響了其經(jīng)濟(jì)效益。為了探究團(tuán)頭魴JAK家族基因是否參與團(tuán)頭魴感染嗜水氣單胞菌后的免疫過程,本研究以團(tuán)頭魴為對象,克隆鑒定了5個團(tuán)頭魴JAK家族基因的ORF序列,并對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析;通過實時熒光定量PCR技術(shù)對團(tuán)頭魴JAK家族基因在健康成魚組織和感染嗜水氣單胞菌后免疫相關(guān)組織中的表達(dá)進(jìn)行了分析;利用Western-blot技術(shù)檢測MamJAK1磷酸化蛋白在團(tuán)頭魴感染嗜水氣單胞菌后,在脾臟和中腎中的表達(dá)變化;之后,使用LPS刺激草魚CIK細(xì)胞后,檢測IL-6R和JAK1基因的表達(dá),以及JAK1蛋白磷酸化表達(dá);最后,構(gòu)建真核表達(dá)載體p EGFP-IL-6R轉(zhuǎn)染到草魚CIK細(xì)胞中,檢測JAK1磷酸化蛋白的表達(dá)變化...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
JAK/STAT信號通路(Yanetal2018)
華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆碩士學(xué)位(畢業(yè))論文20圖3團(tuán)頭魴JAK家族基因氨基酸序列對比Fig.3AminoacidsequencecomparisonofJAKgenefamilyinM.amblycephala相同和相似的氨基酸殘基分別以灰色和淺灰色陰影顯示。紅色矩形標(biāo)記磷酸化位點。Identicalandsimilarresiduesareshadedingrayandlightgray,respectively.Theredsquaremarksthephosphorylationsite.使用MEGA7.0對脊椎動物的JAK家族蛋白進(jìn)行了系統(tǒng)進(jìn)化分析,結(jié)果如圖4所示,人、小鼠、原雞和非洲爪蟾的JAK1、JAK3和TYK2蛋白分別聚為一支;而草魚、斑馬魚、青鳉、鯉和半滑舌鰨等硬骨魚的聚為一支,其中草魚、鯉和團(tuán)頭魴的最先聚在一起,在進(jìn)化關(guān)系上最為接近。另外,硬骨魚類如矛尾虎蝦魚、斑馬魚和團(tuán)頭魴的JAK2b和哺乳動物的JAK2聚為一支,硬骨魚類的JAK2a聚為另外一支,說明硬骨魚類的JAK2b和哺乳動物的JAK2在進(jìn)化關(guān)系上較為接近;其中,斑馬魚的JAK2a和JAK2b蛋白與團(tuán)頭魴的在進(jìn)化關(guān)系上最為接近。
團(tuán)頭魴JAK家族基因的鑒定和表達(dá)分析21圖4脊椎動物JAKs蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化分析Fig.4PhylogeneticanalysisoftheproteinsequencesofJAKsproteininvertebrates物種登錄號:1.JAK1蛋白:草魚Ctenopharyngodonidella(AMK47891.1),鯉Cyprinuscarpio(AAB38256.1),斑馬魚Daniorerio(BAH47261.1),斑點叉尾鮰Ictaluruspunctatus(XP_017335000.1),黃顙魚Tetraodonfluviatilis(AAC00207.1),大西洋鮭Salmosalar(XP_013978894.1),青鳉Oryziaslatipe(XP_020558118.1),半滑舌鰨Cynoglossussemilaevis(XP_008331503.1),大黃魚Larimichthyscrocea(XP_019120796.1),非洲爪蟾Xenopuslaevis(AAH77570.1),原雞Gallusgallus(NP_990201.1),小鼠Musmusculus(P52332.1),馬Equuscaballus(XP_023497716.1),人Homosapiens(P23458.2),野牦牛Bosmutus(XP_005886754.1),野豬Susscrofa(XP_020949197.1);2.JAK2蛋白:斑馬魚DaniorerioJAK2a(AAI62596.1),斑馬魚JAK2bDaniorerioJAK2b(ABD73285.1),青鳉NothobranchiusfurzeriJAK2a(tr|A0A1A8UC21|A0A1A8UC21),青鳉NothobranchiusfurzeriJAK2b(tr|A0A1A8ANY6|A0A1A8ANY6),矛尾復(fù)蝦虎魚AcanthogobiushastaJAK2a(tr|A0A1Z1BIC0|A0A1Z1BIC0_9GOBI),矛尾復(fù)蝦虎魚AcanthogobiushastaJAK2b(tr|A0A1Z1B8L8|A0A1Z1B8L8_9GOBI),黃顙魚TachysurusfulvidracoJAK2a(ALJ92427.1),黃顙魚TachysurusfulvidracoJAK2b(ALJ92428.1),
本文編號:3095357
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
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【部分圖文】:
JAK/STAT信號通路(Yanetal2018)
華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆碩士學(xué)位(畢業(yè))論文20圖3團(tuán)頭魴JAK家族基因氨基酸序列對比Fig.3AminoacidsequencecomparisonofJAKgenefamilyinM.amblycephala相同和相似的氨基酸殘基分別以灰色和淺灰色陰影顯示。紅色矩形標(biāo)記磷酸化位點。Identicalandsimilarresiduesareshadedingrayandlightgray,respectively.Theredsquaremarksthephosphorylationsite.使用MEGA7.0對脊椎動物的JAK家族蛋白進(jìn)行了系統(tǒng)進(jìn)化分析,結(jié)果如圖4所示,人、小鼠、原雞和非洲爪蟾的JAK1、JAK3和TYK2蛋白分別聚為一支;而草魚、斑馬魚、青鳉、鯉和半滑舌鰨等硬骨魚的聚為一支,其中草魚、鯉和團(tuán)頭魴的最先聚在一起,在進(jìn)化關(guān)系上最為接近。另外,硬骨魚類如矛尾虎蝦魚、斑馬魚和團(tuán)頭魴的JAK2b和哺乳動物的JAK2聚為一支,硬骨魚類的JAK2a聚為另外一支,說明硬骨魚類的JAK2b和哺乳動物的JAK2在進(jìn)化關(guān)系上較為接近;其中,斑馬魚的JAK2a和JAK2b蛋白與團(tuán)頭魴的在進(jìn)化關(guān)系上最為接近。
團(tuán)頭魴JAK家族基因的鑒定和表達(dá)分析21圖4脊椎動物JAKs蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化分析Fig.4PhylogeneticanalysisoftheproteinsequencesofJAKsproteininvertebrates物種登錄號:1.JAK1蛋白:草魚Ctenopharyngodonidella(AMK47891.1),鯉Cyprinuscarpio(AAB38256.1),斑馬魚Daniorerio(BAH47261.1),斑點叉尾鮰Ictaluruspunctatus(XP_017335000.1),黃顙魚Tetraodonfluviatilis(AAC00207.1),大西洋鮭Salmosalar(XP_013978894.1),青鳉Oryziaslatipe(XP_020558118.1),半滑舌鰨Cynoglossussemilaevis(XP_008331503.1),大黃魚Larimichthyscrocea(XP_019120796.1),非洲爪蟾Xenopuslaevis(AAH77570.1),原雞Gallusgallus(NP_990201.1),小鼠Musmusculus(P52332.1),馬Equuscaballus(XP_023497716.1),人Homosapiens(P23458.2),野牦牛Bosmutus(XP_005886754.1),野豬Susscrofa(XP_020949197.1);2.JAK2蛋白:斑馬魚DaniorerioJAK2a(AAI62596.1),斑馬魚JAK2bDaniorerioJAK2b(ABD73285.1),青鳉NothobranchiusfurzeriJAK2a(tr|A0A1A8UC21|A0A1A8UC21),青鳉NothobranchiusfurzeriJAK2b(tr|A0A1A8ANY6|A0A1A8ANY6),矛尾復(fù)蝦虎魚AcanthogobiushastaJAK2a(tr|A0A1Z1BIC0|A0A1Z1BIC0_9GOBI),矛尾復(fù)蝦虎魚AcanthogobiushastaJAK2b(tr|A0A1Z1B8L8|A0A1Z1B8L8_9GOBI),黃顙魚TachysurusfulvidracoJAK2a(ALJ92427.1),黃顙魚TachysurusfulvidracoJAK2b(ALJ92428.1),
本文編號:3095357
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