南美白對蝦4種病原體可視化快速檢測試劑盒(生物芯片法)的研發(fā)
發(fā)布時間:2021-03-11 00:57
利用反向點(diǎn)雜交技術(shù),研制靈敏度較高的南美白對蝦4種病原體檢測試劑盒,其檢測指標(biāo)包括致對蝦急性肝胰腺壞死病副溶血弧菌(VpAHPND)、對蝦白斑綜合征病毒(WSSV)、對蝦傳染性皮下及造血組織壞死病毒(IHHNV)、對蝦肝腸胞蟲(EHP),用重組質(zhì)粒分別對其進(jìn)行了最低檢測限測試,并與現(xiàn)有推薦方法進(jìn)行比較。本研究研發(fā)的檢測試劑盒對4種病原體的最低檢測限為1μl 10~100拷貝。特異性檢測結(jié)果表明,4種病原體彼此不產(chǎn)生交叉反應(yīng),特異性良好,與各病原體推薦檢測方法的結(jié)果相比,陽性符合率完全一致。本研究研發(fā)的檢測試劑盒具有操作方便,靈敏度高,特異性好,檢測時間短,設(shè)備要求簡單等特點(diǎn),適合應(yīng)用于南美白對蝦VpAHPND、WSSV、IHHNV、EHP的檢測、篩查工作中。
【文章來源】:江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2020,36(03)北大核心
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
普通PCR法和生物芯片法對IHHNV的檢測結(jié)果
表2 探針及其序列Table 2 Sequences of the probes used in this study 探針名稱 序列 (5′→3′) 探針長度 (bp) 檢測對象 Pir-P AGGAAAACCAACAGCAGGTGA 21 pirB 基因 EHP-P CATCGCTCTCGCAACACCCA 20 對蝦肝腸胞蟲 vp28-P TAGAGACGGGGGTGAAGGAG 20 對蝦白斑綜合征病毒 IHHNV-P CTTTCGGCGTGTTCTTCGTC 20 對蝦傳染性皮下及造血組織壞死病毒 18S rDNA-P CTAGGGCGGTATCTGATCGC 20 南美白對蝦 HC TTTTTTTAAATGTTGGGGAA 20 擴(kuò)增產(chǎn)物1.2.5 對蝦組織樣本提取
圖5顯示,將最低檢測限濃度的質(zhì)粒與陰性蝦基因組混合,VpAHPND、WSSV、IHHNV的最低檢測限可達(dá)到1 μl 10拷貝,EHP的最低檢測限為1 μl 100拷貝,VpAHPND、IHHNV、WSSV、EHP在最低檢測限下的信號均明顯增強(qiáng)。圖3 生物芯片檢測體系雜交時間的優(yōu)化
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]豬偽狂犬病毒實(shí)時熒光定量PCR檢測方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 溫書香,安利民,趙協(xié),張軍,潘燕燕,葛位西. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(07)
[2]云南地區(qū)豬畢氏微孢子蟲的分子檢測及其基因型鑒定[J]. 石蓮琴,翟國蓮,吳杰,李朝,趙國洪,鄒豐才. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2018(08)
[3]Comparison of the Tellgenplex HPV DNA test with the PCR-reverse dot blot assay for human papillomavirus genotyping[J]. Ya-Chao Yao,Nan Li,Liang-Shan Hu,Ya-Hong Li,Zhi Zhang. Asian Pacific Journal of Tropical Medicine. 2018(02)
[4]應(yīng)用鎖式探針結(jié)合斑點(diǎn)雜交技術(shù)檢測甜瓜細(xì)菌性葉斑病[J]. 徐瑞,胡白石,田艷麗,黃艷寧,謝進(jìn),曹亮,彭斯文,朱校奇. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(04)
本文編號:3075580
【文章來源】:江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2020,36(03)北大核心
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
普通PCR法和生物芯片法對IHHNV的檢測結(jié)果
表2 探針及其序列Table 2 Sequences of the probes used in this study 探針名稱 序列 (5′→3′) 探針長度 (bp) 檢測對象 Pir-P AGGAAAACCAACAGCAGGTGA 21 pirB 基因 EHP-P CATCGCTCTCGCAACACCCA 20 對蝦肝腸胞蟲 vp28-P TAGAGACGGGGGTGAAGGAG 20 對蝦白斑綜合征病毒 IHHNV-P CTTTCGGCGTGTTCTTCGTC 20 對蝦傳染性皮下及造血組織壞死病毒 18S rDNA-P CTAGGGCGGTATCTGATCGC 20 南美白對蝦 HC TTTTTTTAAATGTTGGGGAA 20 擴(kuò)增產(chǎn)物1.2.5 對蝦組織樣本提取
圖5顯示,將最低檢測限濃度的質(zhì)粒與陰性蝦基因組混合,VpAHPND、WSSV、IHHNV的最低檢測限可達(dá)到1 μl 10拷貝,EHP的最低檢測限為1 μl 100拷貝,VpAHPND、IHHNV、WSSV、EHP在最低檢測限下的信號均明顯增強(qiáng)。圖3 生物芯片檢測體系雜交時間的優(yōu)化
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]豬偽狂犬病毒實(shí)時熒光定量PCR檢測方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 溫書香,安利民,趙協(xié),張軍,潘燕燕,葛位西. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(07)
[2]云南地區(qū)豬畢氏微孢子蟲的分子檢測及其基因型鑒定[J]. 石蓮琴,翟國蓮,吳杰,李朝,趙國洪,鄒豐才. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2018(08)
[3]Comparison of the Tellgenplex HPV DNA test with the PCR-reverse dot blot assay for human papillomavirus genotyping[J]. Ya-Chao Yao,Nan Li,Liang-Shan Hu,Ya-Hong Li,Zhi Zhang. Asian Pacific Journal of Tropical Medicine. 2018(02)
[4]應(yīng)用鎖式探針結(jié)合斑點(diǎn)雜交技術(shù)檢測甜瓜細(xì)菌性葉斑病[J]. 徐瑞,胡白石,田艷麗,黃艷寧,謝進(jìn),曹亮,彭斯文,朱校奇. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(04)
本文編號:3075580
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