WSSV變異分析及wsv089和wsv150酵母雙雜交誘餌載體的構(gòu)建
發(fā)布時(shí)間:2021-01-27 09:36
白斑綜合征病毒(WSSV)是造成全球范圍內(nèi)蝦類養(yǎng)殖中經(jīng)濟(jì)損失的一個(gè)主要原因。為了解我國(guó)WSSV的流行變異情況,本研究對(duì)5個(gè)高變異區(qū)ORF14/15、ORF23/24、ORF75、ORF94、ORF125以及wsv089、wsv150進(jìn)行了變異分析,并構(gòu)建了wsv089和wsv150的酵母雙雜交誘餌載體。具體內(nèi)容如下:選取2017年中國(guó)部分地區(qū)的42個(gè)WSSV陽(yáng)性樣本,對(duì)ORF14/15、ORF23/24、ORF75、ORF94和ORF125共5個(gè)可變區(qū)進(jìn)行PCR特異性擴(kuò)增,分析其序列的缺失情況和重復(fù)單元(Ru)中單核苷酸多態(tài)性的變化。研究結(jié)果顯示,在ORF14/15的擴(kuò)增中各分離株共出現(xiàn)4種缺失片段,各片段之間差異較小;ORF23/24只出現(xiàn)11945bp的缺失片段;ORF75擴(kuò)增中,總RUs數(shù)目為3、4、9,其中45bp的RUs在12、27、80位點(diǎn)發(fā)生多核苷酸多態(tài)性;ORF94的RUs數(shù)目為6,且均在48bp的位置出現(xiàn)單核苷酸多態(tài)性;ORF125的RUs數(shù)目為4、6、7不等,其各重復(fù)單元分別在20、27、50、53、61位發(fā)生堿基突變。研究結(jié)果表明,在2017年樣本中來(lái)自我國(guó)不同地...
【文章來(lái)源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
ORF14/15的PCR擴(kuò)增電泳結(jié)果
圖 2-2 ORF23/24 的 PCR 擴(kuò)增電泳結(jié)果注: M: DNA Marker DL 2000; (+)陽(yáng)性對(duì)照, (–)陰性對(duì)照; 1-42: 樣品編號(hào)Fig. 2-2 PCR amplification electrophoresis results of ORF23/24: M: DNAMarker DL 2000; (+) positive control, (–) negative control; 1-42: number of s在 ORF75 擴(kuò)增中, 共有 7 份樣本檢出(7#、9#、11#、14#、27#、37#、率為 16.67%(圖 2-3)。
圖 2-3 ORF75 的 PCR 擴(kuò)增電泳結(jié)果注: M: DNA Marker DL 2000; (+)陽(yáng)性對(duì)照, (–)陰性對(duì)照; 1-42: 樣品編號(hào)Fig.2- 3 PCR amplification electrophoresis results of ORF75: M: DNAMarker DL 2000; (+) positive control, (–) negative control; 1-42: number of s在 ORF94 擴(kuò)增中,只有東營(yíng)(37#)的樣本有目的條帶檢出,其余地區(qū)現(xiàn)特異性條帶,檢出率為 2.38%(圖 2-4)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)水產(chǎn)動(dòng)物病毒學(xué)研究概述[J]. 桂朗,張奇亞. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2019(01)
[2]馬鈴薯StERF5轉(zhuǎn)錄因子酵母雙雜交誘餌載體的構(gòu)建及鑒定[J]. 徐萍萍,房宸曦,梁麗娜,王亞鵬,張寧,司懷軍. 分子植物育種. 2018(19)
[3]加工番茄PVYN:O HC-Pro、STV RdRp酵母雙雜交誘餌載體的構(gòu)建及自激活驗(yàn)證[J]. 路遙,周東,鄭銀英. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(17)
[4]南美白對(duì)蝦養(yǎng)殖現(xiàn)狀、存在問(wèn)題及發(fā)展對(duì)策[J]. 陳健,李良玉,楊壯志,唐洪,楊馬. 漁業(yè)致富指南. 2018(16)
[5]2016年中國(guó)部分地區(qū)白斑綜合征病毒高變異區(qū)序列的分析比較[J]. 蔡苗,孫新穎,劉慶慧,萬(wàn)曉媛,黃倢. 海洋漁業(yè). 2018(04)
[6]2015年中國(guó)典型對(duì)蝦養(yǎng)殖區(qū)WSSV流行株高變異區(qū)序列的分析比較[J]. 秦夢(mèng)雪,孫新穎,萬(wàn)曉媛,劉慶慧,黃倢. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2018(02)
[7]安徽省克氏原螯蝦白斑綜合征病毒變異區(qū)序列分析[J]. 陳紅蓮,王永杰,蔣業(yè)林,程云生,張靜,王芬. 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(05)
[8]中國(guó)部分地區(qū)對(duì)蝦白斑綜合征病毒膠原蛋白基因缺失變異分析[J]. 秦夢(mèng)雪,劉慶慧,萬(wàn)曉媛,黃捷. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2017(01)
[9]2014年中國(guó)不同地區(qū)對(duì)蝦白斑綜合征病毒ORF14/15和ORF23/24缺失區(qū)序列比較[J]. 孫新穎,劉慶慧,萬(wàn)曉媛,黃倢. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2016(04)
[10]白斑綜合征病毒2014年中國(guó)毒株變異區(qū)的序列比較[J]. 孫新穎,萬(wàn)曉媛,劉慶慧,黃倢. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2016(02)
博士論文
[1]利用酵母雙雜交解析WSSV感染凡納濱對(duì)蝦途徑的研究[D]. 謝世筠.中國(guó)科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2016
碩士論文
[1]凡納濱對(duì)蝦養(yǎng)殖池塘中的微生物調(diào)控作用及機(jī)制[D]. 李云夢(mèng).浙江大學(xué) 2018
[2]SPAG6相互作用蛋白的酵母雙雜交篩選[D]. 平光倫.武漢科技大學(xué) 2015
[3]柔嫩艾美耳球蟲(chóng)子孢子酵母雙雜交cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及EtAMA1相互作用蛋白的初步篩選[D]. 薛璞.上海師范大學(xué) 2013
[4]白斑綜合癥病毒(WSSV)侵染對(duì)蝦途徑的研究[D]. 戴俊逸.國(guó)家海洋局第三海洋研究所 2012
[5]應(yīng)用分子檢測(cè)技術(shù)對(duì)養(yǎng)殖對(duì)蝦病毒性疾病流行情況的初步研究[D]. 王明森.青島科技大學(xué) 2010
本文編號(hào):3002831
【文章來(lái)源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
ORF14/15的PCR擴(kuò)增電泳結(jié)果
圖 2-2 ORF23/24 的 PCR 擴(kuò)增電泳結(jié)果注: M: DNA Marker DL 2000; (+)陽(yáng)性對(duì)照, (–)陰性對(duì)照; 1-42: 樣品編號(hào)Fig. 2-2 PCR amplification electrophoresis results of ORF23/24: M: DNAMarker DL 2000; (+) positive control, (–) negative control; 1-42: number of s在 ORF75 擴(kuò)增中, 共有 7 份樣本檢出(7#、9#、11#、14#、27#、37#、率為 16.67%(圖 2-3)。
圖 2-3 ORF75 的 PCR 擴(kuò)增電泳結(jié)果注: M: DNA Marker DL 2000; (+)陽(yáng)性對(duì)照, (–)陰性對(duì)照; 1-42: 樣品編號(hào)Fig.2- 3 PCR amplification electrophoresis results of ORF75: M: DNAMarker DL 2000; (+) positive control, (–) negative control; 1-42: number of s在 ORF94 擴(kuò)增中,只有東營(yíng)(37#)的樣本有目的條帶檢出,其余地區(qū)現(xiàn)特異性條帶,檢出率為 2.38%(圖 2-4)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)水產(chǎn)動(dòng)物病毒學(xué)研究概述[J]. 桂朗,張奇亞. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2019(01)
[2]馬鈴薯StERF5轉(zhuǎn)錄因子酵母雙雜交誘餌載體的構(gòu)建及鑒定[J]. 徐萍萍,房宸曦,梁麗娜,王亞鵬,張寧,司懷軍. 分子植物育種. 2018(19)
[3]加工番茄PVYN:O HC-Pro、STV RdRp酵母雙雜交誘餌載體的構(gòu)建及自激活驗(yàn)證[J]. 路遙,周東,鄭銀英. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(17)
[4]南美白對(duì)蝦養(yǎng)殖現(xiàn)狀、存在問(wèn)題及發(fā)展對(duì)策[J]. 陳健,李良玉,楊壯志,唐洪,楊馬. 漁業(yè)致富指南. 2018(16)
[5]2016年中國(guó)部分地區(qū)白斑綜合征病毒高變異區(qū)序列的分析比較[J]. 蔡苗,孫新穎,劉慶慧,萬(wàn)曉媛,黃倢. 海洋漁業(yè). 2018(04)
[6]2015年中國(guó)典型對(duì)蝦養(yǎng)殖區(qū)WSSV流行株高變異區(qū)序列的分析比較[J]. 秦夢(mèng)雪,孫新穎,萬(wàn)曉媛,劉慶慧,黃倢. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2018(02)
[7]安徽省克氏原螯蝦白斑綜合征病毒變異區(qū)序列分析[J]. 陳紅蓮,王永杰,蔣業(yè)林,程云生,張靜,王芬. 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(05)
[8]中國(guó)部分地區(qū)對(duì)蝦白斑綜合征病毒膠原蛋白基因缺失變異分析[J]. 秦夢(mèng)雪,劉慶慧,萬(wàn)曉媛,黃捷. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2017(01)
[9]2014年中國(guó)不同地區(qū)對(duì)蝦白斑綜合征病毒ORF14/15和ORF23/24缺失區(qū)序列比較[J]. 孫新穎,劉慶慧,萬(wàn)曉媛,黃倢. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2016(04)
[10]白斑綜合征病毒2014年中國(guó)毒株變異區(qū)的序列比較[J]. 孫新穎,萬(wàn)曉媛,劉慶慧,黃倢. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2016(02)
博士論文
[1]利用酵母雙雜交解析WSSV感染凡納濱對(duì)蝦途徑的研究[D]. 謝世筠.中國(guó)科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2016
碩士論文
[1]凡納濱對(duì)蝦養(yǎng)殖池塘中的微生物調(diào)控作用及機(jī)制[D]. 李云夢(mèng).浙江大學(xué) 2018
[2]SPAG6相互作用蛋白的酵母雙雜交篩選[D]. 平光倫.武漢科技大學(xué) 2015
[3]柔嫩艾美耳球蟲(chóng)子孢子酵母雙雜交cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及EtAMA1相互作用蛋白的初步篩選[D]. 薛璞.上海師范大學(xué) 2013
[4]白斑綜合癥病毒(WSSV)侵染對(duì)蝦途徑的研究[D]. 戴俊逸.國(guó)家海洋局第三海洋研究所 2012
[5]應(yīng)用分子檢測(cè)技術(shù)對(duì)養(yǎng)殖對(duì)蝦病毒性疾病流行情況的初步研究[D]. 王明森.青島科技大學(xué) 2010
本文編號(hào):3002831
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