大菱鲆是當(dāng)前我國(guó)水產(chǎn)養(yǎng)殖中主要的經(jīng)濟(jì)品種之一,為社會(huì)產(chǎn)生了巨大的經(jīng)濟(jì)效益。實(shí)驗(yàn)對(duì)大菱鲆的遺傳育種進(jìn)行了研究。為開發(fā)大菱鲆的EST-SSR標(biāo)記,通過建立c DNA文庫(kù)和測(cè)序重組,對(duì)大菱鲆轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了微衛(wèi)星序列分析和初步的篩選。測(cè)序后得到了71107條Unigene,從中篩選到39430處含SSR序列,其中含有單堿基重復(fù)序列18013條,二堿基重復(fù)序列8388條,三堿基重復(fù)序列8241條,四堿基重復(fù)序列1518條,五堿基重復(fù)序列1848條,六堿基重復(fù)序列1197條,七堿基重復(fù)序列225條。有4251處SSR序列是可以設(shè)計(jì)引物,隨即選取了210處設(shè)計(jì)引物,有150對(duì)經(jīng)PCR檢測(cè)有目的條帶,19對(duì)有多態(tài)性,為以后開發(fā)大菱鲆EST-SSR標(biāo)記提供了有價(jià)值的信息。對(duì)70個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)和19個(gè)EST-SSR標(biāo)記在大菱鲆親本后代中的基因型分離方式進(jìn)行檢測(cè)與群體分析。結(jié)果顯示,70個(gè)位點(diǎn)共產(chǎn)生了12種分離方式（♀×♂）。70個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)中45個(gè)位點(diǎn)符合孟德爾遺傳定律（P≥0.05）,有25個(gè)位點(diǎn)偏離了孟德爾遺傳定律（P<0.05）。平均等位基因數(shù)目為2.2,平均有效等位基因數(shù)為1.885。平均期望雜... 

【文章來源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁(yè)數(shù)】：90 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

各種作圖群體間的關(guān)系

上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文.結(jié)果1 EST-SSR 的篩選結(jié)果從構(gòu)建的 cDNA 文庫(kù)中得到了 71107 個(gè) unigene，平均選后共得到 25698 個(gè)含有 SSR 的 EST 序列，占整個(gè)數(shù)據(jù)430 處含有 SSR 序列，其中含有單堿基重復(fù)序列 18013 條88 條，三堿基重復(fù)序列 8241 條，四堿基重復(fù)序列 1518 條48 條，六堿基重復(fù)序列 1197 條，七堿基重復(fù)序列 225 條。.68%、21.27%、20.9%、3.85%、4.7%、3.03%、0.57%。如，共發(fā)現(xiàn)有 4251 處可以進(jìn)行引物設(shè)計(jì)。四堿基, 3.85%五堿基, 4.70%六堿基, 3.03%七堿基, 0.57%

圖 2-2.多態(tài)性篩選結(jié)果Fig.2-2.Polymorphism screening results表 2-1 本實(shí)驗(yàn)篩選所得的微衛(wèi)星引物的核心序列、引物序列、退火溫度和片段長(zhǎng)度Tab.2-1 Repeat motif sequence， primer sequences， annealing temperature and fragment lengthof the microsatellite primers used in this experiment位點(diǎn)名稱 Nameof locus核心序列repeat motifsequence片段長(zhǎng)度(bp)fragmentlength退火溫度（℃）annealingtemperature引物序列primer sequencescomp15993_c0_seq1(GACCTG)3 129 58F:ACTGGAGACGGTCCGATACCTGR:ACTCATGGTGCTGGTCCAGGTCcomp18360_c0_seq1(CCTGGA)3 125 58F:ACTCTCCGCCGCTCAGTAAGGR:GTCTCCGTCGTCCAGGTCGTCcomp20204_c0_seq1(CTC)6 132 57F:GTGAGCTGGTGCTGAGTGTAGGR:TGAGGATGAGGCGGAGGAAGAGcomp20308_c0_F:ACATGCAGCAGGAGACC

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]水產(chǎn)動(dòng)物遺傳圖譜的構(gòu)建和QTL定位研究進(jìn)展[J]. 王俊,曹英偉,李良玉,魏文燕,陳霞,楊馬,唐洪,張小麗.  水產(chǎn)科學(xué). 2014(11)
[2]調(diào)味大菱鲆魚片的工藝優(yōu)化[J]. 滕瑜,李輝,苑德順,王彩理.  中國(guó)調(diào)味品. 2014(11)
[3]西北太平洋大彈涂魚群體遺傳結(jié)構(gòu)的AFLP分析[J]. 陳維,洪萬樹,陳仕璽,王瓊,張其永.  中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2014(05)
[4]大菱鲆幼魚長(zhǎng)途運(yùn)輸技術(shù)[J]. 于雷,宋效飛,孫玉明,李寶山,王偉.  齊魯漁業(yè). 2014 (09)
[5]白斑狗魚F1代微衛(wèi)星標(biāo)記及其與生長(zhǎng)性狀的相關(guān)性[J]. 孟瑋,海薩,楊天燕,高攀,杜勁松.  水產(chǎn)學(xué)雜志. 2014(04)
[6]分子標(biāo)記技術(shù)的產(chǎn)生與引物設(shè)計(jì)[J]. 張羽.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(06)
[7]山東省克氏原螯蝦3個(gè)地理群體遺傳差異的RAPD分析[J]. 張龍崗,楊玲,劉羽清,董學(xué)颯,朱永安,付佩勝.  長(zhǎng)江大學(xué)學(xué)報(bào)(自科版). 2014(17)
[8]ISSR標(biāo)記在牙鲆（♀）×圓斑星鰈（♂）雜交子代中的分離方式[J]. 張正睿,王興蓮,張全啟.  海洋湖沼通報(bào). 2014(02)
[9]南湖和響水河鯽群體的RAPD分析[J]. 杜民,牛寶珍,劉艷紅,李云崧.  淡水漁業(yè). 2014(03)
[10]大菱鲆四倍體的人工誘導(dǎo)研究[J]. 吳志昊,尤鋒,宋宗誠(chéng),胡金偉,王麗娟,朱香萍,譚訓(xùn)剛,李軍.  海洋與湖沼. 2014(03)

碩士論文
[1]孔雀魚遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及性別特異標(biāo)記的篩選[D]. 劉昕.中國(guó)海洋大學(xué) 2011



本文編號(hào)：2981732