水產(chǎn)養(yǎng)殖池塘是一種受到高強(qiáng)度人為干預(yù)的生態(tài)系統(tǒng),其中的微生物對過多營養(yǎng)物質(zhì)的輸入具有直接的響應(yīng),同時這些微生物是代謝這些過多營養(yǎng)物質(zhì)的最重要的生物類群。因此,研究水產(chǎn)養(yǎng)殖池塘中微生物群落狀況對于了解養(yǎng)殖過程對池塘生態(tài)功能和池塘的環(huán)境承載力的變化具有重要的意義。既2007年以后,羅非魚成為繼鰱、鳙、草、鯉、鯽之后我國第六大淡水養(yǎng)殖品種,其中池塘集約化養(yǎng)殖產(chǎn)量一度占到總產(chǎn)量的約50%,因而,池塘集約化養(yǎng)殖羅非魚在我國淡水養(yǎng)殖中占有重要位置。有鑒于此,本試驗采用高通量測序技術(shù)對羅非魚養(yǎng)殖池塘中細(xì)菌群落、古菌群落和真菌群落結(jié)構(gòu)狀況進(jìn)行了研究,采用熒光定量PCR技術(shù)對不同密度羅非魚養(yǎng)殖池塘中氨氧化細(xì)菌、古菌的動態(tài)變化進(jìn)行了研究,采用分離、培養(yǎng)的方法對羅非魚養(yǎng)殖池塘中分離到的3株異養(yǎng)硝化細(xì)菌的無機(jī)氮利用特性進(jìn)行了研究,以期為有關(guān)研究提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。1吉富羅非魚養(yǎng)殖高峰期池塘細(xì)菌群落的空間分布狀況研究對吉富羅非魚（Oreochromis niloticus）養(yǎng)殖高峰期池塘細(xì)菌群落的空間分布狀況進(jìn)行了研究,結(jié)果表明,放線菌門（Actinobacteria）、變形菌門（Proteobacteria）、藍(lán)細(xì)... 

【文章來源】：南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：164 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖１－１?４５４平臺的測序原理??Ｆｉｇ．?１－１?Ｔｈｅ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｗｏｒｋｆｌｏｗ?ｏｆ?化ｅ?４５４?ｓｙｓ化ｍ??（ｈｔｔ：ｐ：／／４５４．ｃｏｍ／ｐｒｏｄｕｃｔｓ／ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ．ａｓｐ）??＂

雜交形成＂橋＂式結(jié)構(gòu)，通過橋式擴(kuò)增進(jìn)行文庫模板的富集，最終形成＂ＤＮＡ簇＂。??其次，測序時的不同之處在于前者的信號產(chǎn)生方式是酶聯(lián)級聯(lián)反應(yīng)，后者則是分別被??４種不同巧光素標(biāo)記的ｄＮＴＰ。圖１－２為叫ｕｍｉｎａ?Ｓｏｌｅｘａ測序平臺的測序原理圖。??另夕ｈ和４５４測序平臺相比，Ｉｌｌｕｍｉｎａ?Ｓｏｌｅｘａ測序平臺操作更為簡單、成本更低、??測序速度更快、測序通量也更高（焦晶凱和莫稽紅，２０１４）。但是讀長也低。??‘。。心ｇ’?＼｜｜?Ｉ?？：??Ｉ?口鈔一亦??Ｉ?．???／?—????Ｉ?Ｉ?＞??Ｊ??Ｕｂｒａｒｙ?Ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎ?ｄＨ?Ｇｒｏｗｔｈ?Ｊｊｊ?Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ??ｌｍ：ｉｇｅ?Ａｃｑｕｉｓｉｔｉｏｎ?ｒ?ｉｓ＆?Ｃａｌｌｉｎｇ??圖１－２?Ｉｌｌｕｍｉｎａ?Ｓｏｌｅｘａ平臺的測序原理??Ｆｉｇ．?１－２?Ｔｈｅ?ｓｅｑｕｅ打ｃｉｎｇ?ｗｏｒｋｆｌｏｗ?ｏｆ?ｔｈｅ?Ｉｌｌｕｍｉｎａ?Ｓｏｌｅｘａ?ｓｙｓｔｅｍ??（ｈｔｔｔ）：／／ｗｗｗ．ｂｉｏｍａｒｔ．ｃｎ／ｓｐｅｃｉａｌｓ／ｉｌｌｕｍｉｎａ／ａｒｔｉｃｌｅ＾７６１７）??Ｉ．４．５．３高通量測序技術(shù)的優(yōu)勢??作為一種測序技術(shù)本身，高通量測序技術(shù)采用了大規(guī)模平行測序的技術(shù)，使得多??１１??

通過對高通量測序結(jié)果的進(jìn)一步分析，得到７２７４７條原始序列，優(yōu)化后８０．０９％的序??列被認(rèn)定為有效序列，這些序列可Ｗ歸結(jié)為１８個口，３０個綱和３０個屬。稀釋性曲線分??析（圖２－１）表明，水樣（Ｗ１１／Ｗ１２／Ｗ２１／Ｗ２２／Ｗ３１／Ｗ３２／Ｗ４１／Ｗ４２）和腸道樣品（Ｃ１??和Ｃ巧更趨向于進(jìn)入平臺期（ｓａｔｕｒａｔｉｏｎｐｌａｔｅａｕ），表明表層沉積物樣品（ＣＪ１和ＣＪ２）中??擁有更為豐富的微生物資源信息。??〇??皂］???ＣＪ１??ｌｉ－??￣Ｉ?Ｉ?１?！?Ｉ?Ｉ￣??０?１０００?２０００?３０００?４０００?５０００?６０００??Ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?Ｒｅａｄｓ?Ｓａｍｐｌｅｄ??ｌａｂｅｌ：?０．９７??圖２－１相似度９７％時的稀釋性曲線圖??Ｆｉｇ．?２－１?民ａｒｅｆａｃｔｉｏ打?ｃｕｒｖｅｓ?ｏｆ?ＯＴＵｓ?ｃｌｕｓｔｅｒｅｄ?ａｔ?９７〇／〇?ｓｅｑｕｅｎｃｅ?ｉｄｅｎｔｉｔｙ??２２??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]羅非魚養(yǎng)殖池塘底泥微生物群落代謝功能的動態(tài)變化[J]. 楊鶯鶯,袁翠霖,李卓佳,楊鏗,林小濤.  廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(19)
[2]池塘殘餌對底泥氮、磷釋放影響的模擬研究[J]. 呂元蛟,李瑞嬌,張念,趙峰,謝從新,張敏.  環(huán)境科學(xué). 2014(06)
[3]水產(chǎn)診所 春季常見水產(chǎn)寄生蟲與真菌混合感染的防治[J]. 譚愛萍,羅理,姜蘭.  海洋與漁業(yè). 2014(05)
[4]Illumina MiSeq平臺高覆蓋率測定干酪中的細(xì)菌微生物多樣性[J]. 焦晶凱,莫蓓紅.  中國釀造. 2014(05)
[5]一種新型的復(fù)合生態(tài)浮床及其對浮游植物群落結(jié)構(gòu)的影響[J]. 李艷楓,劉凌,陳寧,夏倩,邢西剛,燕文明,張喜,王浠浠.  水資源保護(hù). 2014(02)
[6]精養(yǎng)團(tuán)頭魴池塘沉積物微生物群落的結(jié)構(gòu)特征及組成多樣性分析[J]. 李曉,李冰,董玉峰,朱健.  水產(chǎn)學(xué)報. 2014(02)
[7]羅非魚主養(yǎng)池塘水體微生物群落對碳源代謝的動態(tài)變化[J]. 曹煜成,李卓佳,文國樑,袁翠霖,楊鶯鶯,胡曉娟,林小濤.  農(nóng)業(yè)環(huán)境科學(xué)學(xué)報. 2014(01)
[8]淡水養(yǎng)殖池塘微生態(tài)環(huán)境調(diào)控研究綜述[J]. 范立民,徐跑,吳偉,瞿建宏,裘麗萍,陳家長.  生態(tài)學(xué)雜志. 2013(11)
[9]滇池水葫蘆規(guī)模化控養(yǎng)生態(tài)環(huán)境效應(yīng)分析[J]. 張霞,蔡宗壽,陳麗紅,陳穎.  環(huán)境工程. 2013(S1)
[10]環(huán)境微生物的宏基因組學(xué)研究新進(jìn)展[J]. 孫欣,高瑩,楊云鋒.  生物多樣性. 2013(04)

碩士論文
[1]典型淡水養(yǎng)殖池塘厭氧氨氧化細(xì)菌的菌群結(jié)構(gòu)、多樣性和定量研究[D]. 王謹(jǐn).中國海洋大學(xué) 2013
[2]生態(tài)浮床對藻類群落結(jié)構(gòu)及N、P的影響[D]. 張偉.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[3]草魚混養(yǎng)系統(tǒng)菌群結(jié)構(gòu)與功能多樣性的研究[D]. 鄭瑤瑤.中國海洋大學(xué) 2012
[4]烏伊嶺濕地水生真菌多樣性的研究[D]. 吳雪梅.東北林業(yè)大學(xué) 2010



本文編號：2979163