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斜帶石斑魚(Epinephelus coioides)eIF2α激酶基因PKR和HRI的克隆表達(dá)和功能初步分析

發(fā)布時(shí)間:2020-12-28 07:27
  石斑魚是我國南部沿海及東南亞地區(qū)重要的海水養(yǎng)殖魚類。石斑魚肉質(zhì)鮮美、蛋白質(zhì)含量高、脂肪含量低,富含人體代謝所必須的多種氨基酸和多種維生素,是一種經(jīng)濟(jì)價(jià)值和營養(yǎng)價(jià)值都很高的食用魚類,隨著石斑魚養(yǎng)殖規(guī)模的擴(kuò)大及養(yǎng)殖環(huán)境的惡化,石斑魚病害頻發(fā)且呈逐年上升趨勢,已成為石斑魚養(yǎng)殖業(yè)可持續(xù)發(fā)展最大的障礙。因此,研究石斑魚自身的免疫相關(guān)基因及其作用機(jī)制,從而提高石斑魚的免疫力和抗病能力,對于石斑魚養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)十分重要。魚類eIF2 α激酶PKR和HRI與魚類的免疫系統(tǒng)密切相關(guān),其中,PKR能激活細(xì)胞的抗病毒能力,調(diào)節(jié)生物體的免疫機(jī)制,本文對斜帶石斑魚(Epinepheluscoioides)的PKR和HHI基因進(jìn)行了克隆表達(dá),并對其功能做了初步研究。本研究利用RACE技術(shù),從石斑魚的脾組織中克隆獲得了PK 與HRI基因全長cDNA。其中石斑魚PKR全長為2151bp,其中ORF區(qū)為1863bp,編碼621個(gè)氨基酸,蛋白的分子量大小為70157.15 D,PI為5.72。石斑魚的HRI基因全長為2467bp,其中ORF區(qū)為1995bp,編碼664個(gè)氨基酸,其蛋白分子量大小為74207.58 D,PI為6.... 

【文章來源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:63 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

斜帶石斑魚(Epinephelus coioides)eIF2α激酶基因PKR和HRI的克隆表達(dá)和功能初步分析


Sb1ART軟件分析P%R的結(jié)構(gòu)城Fig.3.3TheconserveddomainofP%Ranalyzedby

結(jié)構(gòu)域,軟件分析


圖3.4?SMART軟件分析ffiW的結(jié)構(gòu)域??Fig.?3.4?The?conserved?domain?of?HRI?analyzed?by?SMART??35??

石斑魚,內(nèi)參,腸道,脾臟


中取材正常生長石斑魚的肝臟、脾臟、腎臟、腦、腸道、心臟、皮膚、肌肉、胃、鰓??和頭腎等11種組織,抽提組織的RNA并逆轉(zhuǎn)錄成cDNA用real-time?PCR的方法在??RocheLightCycler480熒光定量PCR儀上進(jìn)行分析,結(jié)果如圖3.7和3.8所示,經(jīng)研??究發(fā)現(xiàn)石斑魚的各組織中均有份?/和?的表達(dá),其中石斑魚的腸道和胃中W基??因的表達(dá)量最高,而在脾臟和腸道,胃中//似表達(dá)量最高,這表明/^以和?在石??斑魚體內(nèi)是普遍表達(dá)廣泛分布的兩種蛋白。??^?fonl'nl?—――_?.?-T..??C?}?I,?.??ill];?—.................:.._^=術(shù)??〇?2.00E-04?N?FT??。0?00E+0(j?_?i?i?id?i?n?i?fj?i?lj?1?L?i?11」...l.?m?i?i...?JI?i?f?11?;??i??/??圖3.7石斑魚各組織中PO的表達(dá)情況??用ReaUimePCR的方法檢測各組織中的P/W?niRNA以18SrRNA為內(nèi)參,分析各組織中的??//?/的相對表達(dá)量。每個(gè)樣品重復(fù)3次,得到其標(biāo)準(zhǔn)偏差。??Fig?3.7?Distribution?of?PKR?in?different?tissues??Real-time?PCR?detection?of?PKR?transcripts?in?flounder?tissues.?The?samples?were?normalized?on??the?basis?of?18S?rRNA?expression.Tis


本文編號:2943370

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