RNA干擾對大鯢蛙病毒(CGSRV)主要功能基因表達與增殖影響的研究
發(fā)布時間:2020-12-24 06:43
大鯢蛙病毒(Chinese giant salamander Ranavirus, CGSRV)屬于虹彩病毒科、蛙病毒屬,是近年來發(fā)現(xiàn)的一種嚴重危害養(yǎng)殖大鯢的新病原,其感染具有發(fā)病率與死亡率高的特點,給大鯢養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展造成了嚴重威脅,其防控技術(shù)已成為人們研究的熱點。RNA干擾(RNA interference, RNAi)是利用小干擾RNA(small interfering RNA, siRNA)作為序列特異性的觸發(fā)器,與細胞內(nèi)同源的mRNA互補配對后再由RNase III家族中能夠特異性識別雙鏈RNA的Dicer酶切斷,引起生物細胞內(nèi)同源基因發(fā)生降解而表現(xiàn)出該基因特異性沉默的現(xiàn)象,達到阻礙病毒基因順利表達的目的,起到預(yù)防和治療病毒感染的目的。RNA干擾是生物進化的結(jié)果,參與多種真核生物功能,包括病毒防御、基因組重排、染色質(zhì)重組、干細胞的維持、腦的形態(tài)建成以及發(fā)育時序決定等。本研究通過化學(xué)合成的方法,合成CGSRV病毒主要衣殼蛋白基因(MCP)、甲基轉(zhuǎn)移酶基因(MTase)、DNA多聚酶基因(DNA polymerase)特異的siRNA,把siRNA轉(zhuǎn)染到鯉魚上皮瘤細胞(Epi...
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
論文縮略詞表
第一章 文獻綜述
1 蛙病毒概述
1.1 蛙病毒生物學(xué)特性
1.2 蛙病毒的復(fù)制周期
1.3 蛙病毒的主要功能基因
1.4 蛙病毒的感染特性
1.5 大鯢蛙病毒
2 RNA干擾(RNA interference,RNAi)
2.1 RNA干擾現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)
2.2 RNA干擾的作用機制
2.3 獲得siRNA的方法
2.4 展望未來
3 研究目的與意義
第二章 siRNA對CGSRV病毒MCP、MTases、DNA polymerase基因的干擾
1 實驗材料
1.1 大鯢蛙病毒(CGSRV)懸液
1.2 細胞株
1.3 細胞培養(yǎng)基
1.4 溶液及試劑
1.5 主要儀器
2 方法
2.1 siRNA靶序列的設(shè)計與合成
2.2 EPC細胞的傳代培養(yǎng)
2.3 siRNA轉(zhuǎn)染濃度的優(yōu)化
2.4 最適病毒濃度的優(yōu)化
2.5 siRNA對MCP、MTases、DNA polymerase基因的干擾
3 結(jié)果與分析
3.1 siRNA靶序列的設(shè)計與合成
3.2 siRNA轉(zhuǎn)染濃度的優(yōu)化
3.3 最適病毒濃度的優(yōu)化
3.4 siRNA對MCP、MTases、DNA polymerase基因的干擾
4 討論
4.1 siRNA的設(shè)計與合成
4.2 siRNA轉(zhuǎn)染影響因素
4.3 siRNA的干擾
5 小結(jié)
第三章 熒光定量PCR法和病毒滴度(TCIDso)法檢測siRNA的干擾效果
1 實驗材料
1.1 CGSRV病毒懸液
1.2 實驗試劑
1.3 主要儀器
1.4 主要試劑配制方法
2 方法
2.1 熒光定量PCR(qRT-PCR)引物設(shè)計與合成
2.2 總RNA提取
2.3 RNA純度及濃度檢測
2.4 RNA反轉(zhuǎn)錄(RT-PCR)
2.5 退火溫度的優(yōu)化與標準曲線的建立
2.6 MCP、MTases、DNA polymerase基因表達量的檢測
50)測定"> 2.7 病毒滴度(TCID50)測定
3 結(jié)果與分析
3.1 RNA純度和濃度檢測
3.2 退火溫度的優(yōu)化
3.3 標準曲線及擴增效率
3.4 RNA干擾后各基因在不同時間點的相對表達
50)測定"> 3.5 病毒滴度(TCID50)測定
4 討論
5 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表及參與發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻】:
期刊論文
[1]PCR引物設(shè)計方法綜述[J]. 尤超,趙大球,梁乘榜,周春華. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2011(17)
[2]患病中國大鯢中分離到一株虹彩病毒及其特性的研究[J]. 江育林,張旻,景宏麗,高隆英. 病毒學(xué)報. 2011(03)
[3]慢病毒載體靶向沉默原代大鼠海馬神經(jīng)元黏著斑激酶表達siRNA的篩選[J]. 張金平,唐榮華,吳軍,劉紅星,焦莉,許峰,康慧聰,朱遂強,薛崢. 華中科技大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2011(01)
[4]蛙病毒感染致養(yǎng)殖大鯢大規(guī)模死亡的電鏡觀察及PCR檢測[J]. 耿毅,汪開毓,李成偉,王均,廖雨婷,黃錦爐,周趙英. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2010(08)
[5]miRNA在肝細胞癌中的研究進展[J]. 戚鵬,高春芳. 中國生物工程雜志. 2008(12)
[6]蛙虹彩病毒一個晚期基因的鑒定[J]. 徐維,趙哲,張奇亞. 武漢大學(xué)學(xué)報(理學(xué)版). 2007(06)
[7]RNA干擾的實驗方法及應(yīng)用[J]. 吳丹,章麗娜,石嬌,高志峰,譚克,劉雷,胡蘭. 畜牧與獸醫(yī). 2007(07)
[8]沉默基因“閃亮”2006年諾貝爾醫(yī)學(xué)獎[J]. 饒新華. 世界科學(xué). 2006(11)
[9]RNA干擾與抗病毒感染[J]. 曹明媚,戚中田. 微生物學(xué)雜志. 2005(05)
[10]小鼠植入前胚胎對輸卵管上皮細胞DNA甲基轉(zhuǎn)移酶1表達的影響(英文)[J]. 黃瓊曉,徐晨明,金帆,黃荷鳳,錢羽力. 中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2005(04)
博士論文
[1]蛙虹彩病毒(RGV)的復(fù)制與宿主細胞骨架及超微組織變化[D]. 黃曉紅.中國科學(xué)院研究生院(水生生物研究所) 2006
碩士論文
[1]大鯢蛙病毒生物學(xué)特性及其感染的病理學(xué)研究[D]. 周趙英.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
本文編號:2935185
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
論文縮略詞表
第一章 文獻綜述
1 蛙病毒概述
1.1 蛙病毒生物學(xué)特性
1.2 蛙病毒的復(fù)制周期
1.3 蛙病毒的主要功能基因
1.4 蛙病毒的感染特性
1.5 大鯢蛙病毒
2 RNA干擾(RNA interference,RNAi)
2.1 RNA干擾現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)
2.2 RNA干擾的作用機制
2.3 獲得siRNA的方法
2.4 展望未來
3 研究目的與意義
第二章 siRNA對CGSRV病毒MCP、MTases、DNA polymerase基因的干擾
1 實驗材料
1.1 大鯢蛙病毒(CGSRV)懸液
1.2 細胞株
1.3 細胞培養(yǎng)基
1.4 溶液及試劑
1.5 主要儀器
2 方法
2.1 siRNA靶序列的設(shè)計與合成
2.2 EPC細胞的傳代培養(yǎng)
2.3 siRNA轉(zhuǎn)染濃度的優(yōu)化
2.4 最適病毒濃度的優(yōu)化
2.5 siRNA對MCP、MTases、DNA polymerase基因的干擾
3 結(jié)果與分析
3.1 siRNA靶序列的設(shè)計與合成
3.2 siRNA轉(zhuǎn)染濃度的優(yōu)化
3.3 最適病毒濃度的優(yōu)化
3.4 siRNA對MCP、MTases、DNA polymerase基因的干擾
4 討論
4.1 siRNA的設(shè)計與合成
4.2 siRNA轉(zhuǎn)染影響因素
4.3 siRNA的干擾
5 小結(jié)
第三章 熒光定量PCR法和病毒滴度(TCIDso)法檢測siRNA的干擾效果
1 實驗材料
1.1 CGSRV病毒懸液
1.2 實驗試劑
1.3 主要儀器
1.4 主要試劑配制方法
2 方法
2.1 熒光定量PCR(qRT-PCR)引物設(shè)計與合成
2.2 總RNA提取
2.3 RNA純度及濃度檢測
2.4 RNA反轉(zhuǎn)錄(RT-PCR)
2.5 退火溫度的優(yōu)化與標準曲線的建立
2.6 MCP、MTases、DNA polymerase基因表達量的檢測
50)測定"> 2.7 病毒滴度(TCID50)測定
3 結(jié)果與分析
3.1 RNA純度和濃度檢測
3.2 退火溫度的優(yōu)化
3.3 標準曲線及擴增效率
3.4 RNA干擾后各基因在不同時間點的相對表達
50)測定"> 3.5 病毒滴度(TCID50)測定
4 討論
5 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表及參與發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻】:
期刊論文
[1]PCR引物設(shè)計方法綜述[J]. 尤超,趙大球,梁乘榜,周春華. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2011(17)
[2]患病中國大鯢中分離到一株虹彩病毒及其特性的研究[J]. 江育林,張旻,景宏麗,高隆英. 病毒學(xué)報. 2011(03)
[3]慢病毒載體靶向沉默原代大鼠海馬神經(jīng)元黏著斑激酶表達siRNA的篩選[J]. 張金平,唐榮華,吳軍,劉紅星,焦莉,許峰,康慧聰,朱遂強,薛崢. 華中科技大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2011(01)
[4]蛙病毒感染致養(yǎng)殖大鯢大規(guī)模死亡的電鏡觀察及PCR檢測[J]. 耿毅,汪開毓,李成偉,王均,廖雨婷,黃錦爐,周趙英. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2010(08)
[5]miRNA在肝細胞癌中的研究進展[J]. 戚鵬,高春芳. 中國生物工程雜志. 2008(12)
[6]蛙虹彩病毒一個晚期基因的鑒定[J]. 徐維,趙哲,張奇亞. 武漢大學(xué)學(xué)報(理學(xué)版). 2007(06)
[7]RNA干擾的實驗方法及應(yīng)用[J]. 吳丹,章麗娜,石嬌,高志峰,譚克,劉雷,胡蘭. 畜牧與獸醫(yī). 2007(07)
[8]沉默基因“閃亮”2006年諾貝爾醫(yī)學(xué)獎[J]. 饒新華. 世界科學(xué). 2006(11)
[9]RNA干擾與抗病毒感染[J]. 曹明媚,戚中田. 微生物學(xué)雜志. 2005(05)
[10]小鼠植入前胚胎對輸卵管上皮細胞DNA甲基轉(zhuǎn)移酶1表達的影響(英文)[J]. 黃瓊曉,徐晨明,金帆,黃荷鳳,錢羽力. 中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2005(04)
博士論文
[1]蛙虹彩病毒(RGV)的復(fù)制與宿主細胞骨架及超微組織變化[D]. 黃曉紅.中國科學(xué)院研究生院(水生生物研究所) 2006
碩士論文
[1]大鯢蛙病毒生物學(xué)特性及其感染的病理學(xué)研究[D]. 周趙英.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
本文編號:2935185
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/2935185.html
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