大菱鲆耐高溫性狀QTL區(qū)間候選功能基因篩選與鑒定
發(fā)布時(shí)間:2020-12-18 16:06
大菱鲆(Scophthalmus maximus)是原產(chǎn)歐洲沿海的一種特有的名貴低溫經(jīng)濟(jì)魚類。耐高溫性能是大菱鲆重要性狀和遺傳改良的主要目標(biāo),而通過QTL定位獲得與耐高溫性狀緊密連鎖的分子標(biāo)記以及功能基因是分子遺傳育種的重要工具。本實(shí)驗(yàn)室在豐富的遺傳群體基礎(chǔ)上,已完成高密度遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建工作,本論文主要開展大菱鲆耐高溫性狀的QTL定位;并對(duì)定位區(qū)間進(jìn)行全基因組比對(duì)及注釋,篩選與耐溫相關(guān)的候選基因;并對(duì)QTL區(qū)間內(nèi)富集的P53信號(hào)通路中的相關(guān)基因在高溫脅迫條件下的影響開展初步探究。本研究對(duì)于大菱鲆耐高溫性狀選育以及分子機(jī)理研究提供理論依據(jù)。具體內(nèi)容如下:1.本研究在實(shí)驗(yàn)室已構(gòu)建的高密度遺傳連鎖圖譜基礎(chǔ)上,開展耐高溫性狀QTL定位及區(qū)間內(nèi)候選基因篩選。結(jié)果顯示:共獲得7個(gè)QTL區(qū)間與耐高溫性狀相關(guān)聯(lián),它們分別定位在LG17,LG17,LG17,LG20,LG21,LG4和LG6,其中LG17(0cM)具有最大LOD值(5.77),表型變異解釋率達(dá)36.3%;而LG17(81.113 cM)具有最小LOD值(3.08),表型變異解釋率21.4%。耐高溫QTL區(qū)間,標(biāo)記距離范圍在1.75c...
【文章來源】:大連海洋大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
p53介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡信號(hào)通路[75]
.4 研究目的及意義大菱鲆原產(chǎn)于歐洲沿海,由“大菱鲆之父”雷霽霖于 1992 年引入我國,在我國北海城市大規(guī)模推廣養(yǎng)殖。時(shí)至今日,我國大菱鲆養(yǎng)殖、育苗等產(chǎn)業(yè)遍布北方沿海各大市,給這些城市的經(jīng)濟(jì)發(fā)展帶來重大效益。我國大菱鲆產(chǎn)業(yè)的國際地位也變得舉足輕。隨著大菱鲆養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)規(guī)模的不斷擴(kuò)大,養(yǎng)殖區(qū)域不斷擴(kuò)展,溫度對(duì)其在生長(zhǎng)、繁、抗病等方面的問題逐漸顯現(xiàn)。因此,開展大菱鲆耐高溫新品種的選育對(duì)大菱鲆產(chǎn)業(yè)持續(xù)、快速發(fā)展具有重要意義。在平穩(wěn)推進(jìn)選育新品種的工作中,分子選育成為針對(duì)較強(qiáng)的新方法。故本研究積極探索與大菱鲆耐高溫性狀相關(guān)聯(lián)的候選基因,并探究關(guān)基因及其分子機(jī)制,以揭示大菱鲆耐高溫應(yīng)激響應(yīng)中的生命機(jī)理。圖 1-1 p53 介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡信號(hào)通路[75].1-1 p53-dependeng cell apoptosis signaling pathway圖 1-2 Tap73 介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡信號(hào)通路Fig.1-2 Tap73-dependeng cell apoptosis signaling
表 2-1 耐高溫性狀 QTL 分析結(jié)果Tab.2-1 QTL analysis results of high temperature resistanceLinkage group Peak position (cM) Length No. of markers VAR(%)LG17 0 25.07 15 21.2%-36.3%LG17 69.304 1.75 10 22.2%-23.8%LG17 81.113 7.83 27 21.3%-26.1%LG20 165.38 0.00 2 22.8LG21 7.02 18.67 8 22.9%-27.3%LG4 108.16 8.78 24 21.4%-26.7%LG6 25.905 0.00 4 23.2
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國大菱鲆產(chǎn)業(yè)發(fā)展演進(jìn)與趨勢(shì)分析[J]. 劉龍騰,朱雪梅,趙明軍. 農(nóng)業(yè)展望. 2018(09)
[2]大黃魚MIPS基因克隆及低溫脅迫下的表達(dá)分析[J]. 李明云,苗亮,陳瑩瑩,侯紅紅,陳炯. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2018(02)
[3]團(tuán)頭魴(Megalobrama amblycephala)caspase3基因克隆及其在高溫脅迫中的表達(dá)分析[J]. 孫盛明,朱健,戈賢平,石連玉,程磊,張武肖,蘇艷莉. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(10)
[4]微衛(wèi)星技術(shù)篩選大黃魚耐低溫標(biāo)記[J]. 穆方申,苗亮,李明云,胡謀,陳炯,張浩. 生物學(xué)雜志. 2017(01)
[5]P53基因的生物信息學(xué)分析[J]. 王貞超,楊開迆. 世界最新醫(yī)學(xué)信息文摘. 2017(02)
[6]高溫刺激導(dǎo)致蝦夷扇貝死亡因素的探究[J]. 劉超,吳富村,林思恒,闕華勇,張國范. 海洋科學(xué). 2016(11)
[7]泛素、泛素鏈和蛋白質(zhì)泛素化研究進(jìn)展[J]. 蘭秋艷,高媛,李衍常,洪學(xué)傳,徐平. 生物工程學(xué)報(bào). 2016(01)
[8]熱應(yīng)激對(duì)虹鱒部分非特異性免疫指標(biāo)的影響[J]. 王艷妮,劉哲,康玉軍,李珍,施海娜,張久盤,王建福,蔣麗,黃進(jìn)強(qiáng). 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2015(05)
[9]低溫脅迫對(duì)尼羅羅非魚水通道蛋白基因(AQP1)表達(dá)的影響[J]. 朱華平,劉玉姣,劉志剛,盧邁新,高風(fēng)英,可小麗,黃樟翰. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2014(06)
[10]大黃魚群體遺傳多樣性分析及耐低溫性狀相關(guān)微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選[J]. 王惠儒,柳敏海,油九菊,羅海忠,許益銨,傅榮兵. 浙江海洋學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(01)
博士論文
[1]大菱鲆耐高溫性狀選育及遺傳機(jī)理研究[D]. 黃智慧.中國海洋大學(xué) 2014
[2]p53蛋白在細(xì)胞凋亡中的作用機(jī)制研究[D]. 杜文靜.中國科學(xué)技術(shù)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]低溫脅迫誘導(dǎo)羅非魚和斑馬魚魚鰓差異凋亡的分子機(jī)制[D]. 王金鳳.上海海洋大學(xué) 2016
[2]刺參候選耐寒基因的克隆與表達(dá)分析[D]. 李成澤.大連海洋大學(xué) 2014
[3]大菱鲆在不同溫度、鹽度及其交互作用下機(jī)體生理生化指標(biāo)[D]. 郭黎.上海海洋大學(xué) 2012
[4]熱應(yīng)激對(duì)三個(gè)品系錦鯉非特異性免疫及HSP70基因表達(dá)的影響[D]. 張崇英.西南大學(xué) 2012
[5]養(yǎng)殖牙鲆腫瘤抑制基因p53的克隆及與淋巴囊腫病關(guān)系的研究[D]. 昝金東.國家海洋局第一海洋研究所 2007
本文編號(hào):2924279
【文章來源】:大連海洋大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
p53介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡信號(hào)通路[75]
.4 研究目的及意義大菱鲆原產(chǎn)于歐洲沿海,由“大菱鲆之父”雷霽霖于 1992 年引入我國,在我國北海城市大規(guī)模推廣養(yǎng)殖。時(shí)至今日,我國大菱鲆養(yǎng)殖、育苗等產(chǎn)業(yè)遍布北方沿海各大市,給這些城市的經(jīng)濟(jì)發(fā)展帶來重大效益。我國大菱鲆產(chǎn)業(yè)的國際地位也變得舉足輕。隨著大菱鲆養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)規(guī)模的不斷擴(kuò)大,養(yǎng)殖區(qū)域不斷擴(kuò)展,溫度對(duì)其在生長(zhǎng)、繁、抗病等方面的問題逐漸顯現(xiàn)。因此,開展大菱鲆耐高溫新品種的選育對(duì)大菱鲆產(chǎn)業(yè)持續(xù)、快速發(fā)展具有重要意義。在平穩(wěn)推進(jìn)選育新品種的工作中,分子選育成為針對(duì)較強(qiáng)的新方法。故本研究積極探索與大菱鲆耐高溫性狀相關(guān)聯(lián)的候選基因,并探究關(guān)基因及其分子機(jī)制,以揭示大菱鲆耐高溫應(yīng)激響應(yīng)中的生命機(jī)理。圖 1-1 p53 介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡信號(hào)通路[75].1-1 p53-dependeng cell apoptosis signaling pathway圖 1-2 Tap73 介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡信號(hào)通路Fig.1-2 Tap73-dependeng cell apoptosis signaling
表 2-1 耐高溫性狀 QTL 分析結(jié)果Tab.2-1 QTL analysis results of high temperature resistanceLinkage group Peak position (cM) Length No. of markers VAR(%)LG17 0 25.07 15 21.2%-36.3%LG17 69.304 1.75 10 22.2%-23.8%LG17 81.113 7.83 27 21.3%-26.1%LG20 165.38 0.00 2 22.8LG21 7.02 18.67 8 22.9%-27.3%LG4 108.16 8.78 24 21.4%-26.7%LG6 25.905 0.00 4 23.2
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國大菱鲆產(chǎn)業(yè)發(fā)展演進(jìn)與趨勢(shì)分析[J]. 劉龍騰,朱雪梅,趙明軍. 農(nóng)業(yè)展望. 2018(09)
[2]大黃魚MIPS基因克隆及低溫脅迫下的表達(dá)分析[J]. 李明云,苗亮,陳瑩瑩,侯紅紅,陳炯. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2018(02)
[3]團(tuán)頭魴(Megalobrama amblycephala)caspase3基因克隆及其在高溫脅迫中的表達(dá)分析[J]. 孫盛明,朱健,戈賢平,石連玉,程磊,張武肖,蘇艷莉. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(10)
[4]微衛(wèi)星技術(shù)篩選大黃魚耐低溫標(biāo)記[J]. 穆方申,苗亮,李明云,胡謀,陳炯,張浩. 生物學(xué)雜志. 2017(01)
[5]P53基因的生物信息學(xué)分析[J]. 王貞超,楊開迆. 世界最新醫(yī)學(xué)信息文摘. 2017(02)
[6]高溫刺激導(dǎo)致蝦夷扇貝死亡因素的探究[J]. 劉超,吳富村,林思恒,闕華勇,張國范. 海洋科學(xué). 2016(11)
[7]泛素、泛素鏈和蛋白質(zhì)泛素化研究進(jìn)展[J]. 蘭秋艷,高媛,李衍常,洪學(xué)傳,徐平. 生物工程學(xué)報(bào). 2016(01)
[8]熱應(yīng)激對(duì)虹鱒部分非特異性免疫指標(biāo)的影響[J]. 王艷妮,劉哲,康玉軍,李珍,施海娜,張久盤,王建福,蔣麗,黃進(jìn)強(qiáng). 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2015(05)
[9]低溫脅迫對(duì)尼羅羅非魚水通道蛋白基因(AQP1)表達(dá)的影響[J]. 朱華平,劉玉姣,劉志剛,盧邁新,高風(fēng)英,可小麗,黃樟翰. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2014(06)
[10]大黃魚群體遺傳多樣性分析及耐低溫性狀相關(guān)微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選[J]. 王惠儒,柳敏海,油九菊,羅海忠,許益銨,傅榮兵. 浙江海洋學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(01)
博士論文
[1]大菱鲆耐高溫性狀選育及遺傳機(jī)理研究[D]. 黃智慧.中國海洋大學(xué) 2014
[2]p53蛋白在細(xì)胞凋亡中的作用機(jī)制研究[D]. 杜文靜.中國科學(xué)技術(shù)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]低溫脅迫誘導(dǎo)羅非魚和斑馬魚魚鰓差異凋亡的分子機(jī)制[D]. 王金鳳.上海海洋大學(xué) 2016
[2]刺參候選耐寒基因的克隆與表達(dá)分析[D]. 李成澤.大連海洋大學(xué) 2014
[3]大菱鲆在不同溫度、鹽度及其交互作用下機(jī)體生理生化指標(biāo)[D]. 郭黎.上海海洋大學(xué) 2012
[4]熱應(yīng)激對(duì)三個(gè)品系錦鯉非特異性免疫及HSP70基因表達(dá)的影響[D]. 張崇英.西南大學(xué) 2012
[5]養(yǎng)殖牙鲆腫瘤抑制基因p53的克隆及與淋巴囊腫病關(guān)系的研究[D]. 昝金東.國家海洋局第一海洋研究所 2007
本文編號(hào):2924279
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