河南省黃顙魚和鲇自然居群遺傳多樣性分析
發(fā)布時間:2020-12-14 17:29
遺傳多樣性是指種群內(nèi)不同群體或同一群體內(nèi)不同個體的遺傳變異的總和,是保護(hù)生物學(xué)研究的核心之一。ISSR分子標(biāo)記技術(shù)可以快速、高效和靈敏地檢測出基因組DNA的多態(tài)性,是研究遺傳多樣性的較好方法之一。本文以河南省境內(nèi)黃顙魚(Pelteobagrus fulvidraco)和鲇(Silurus asotus)的自然居群為研究對象,標(biāo)本分別采于淇河、信陽南灣水庫和丹江口水庫,利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對其遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,旨在為其資源保護(hù)與開發(fā)利用提供理論依據(jù)和數(shù)據(jù)參考。用4種方法對保存于95%乙醇的黃顙魚和鲇的肌肉組織樣本進(jìn)行預(yù)處理,比較其基因組DNA的提取效果。結(jié)果表明,用STE緩沖液預(yù)處理的樣品,基因組DNA條帶清晰、整齊,無降解現(xiàn)象,A260/A280值正常,在1.82.0之間,DNA完整性較好,是提取乙醇保存的肌肉組織DNA前較為理想的預(yù)處理方法。利用文獻(xiàn)法,參考同種和近緣物種,初選引物,再通過實(shí)驗(yàn)篩選,最后確定ISSR標(biāo)記用于分析黃顙魚和鲇遺傳多樣性的共用引物15個。利用正交設(shè)計,優(yōu)化了黃顙魚和鲇的ISSR-PCR反應(yīng)體系,即25μL最佳的反應(yīng)體系為...
【文章來源】:河南師范大學(xué)河南省
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
四種預(yù)處理黃顙魚DNA的電泳圖譜
圖 3-2 黃顙魚和鲇基因組 DNA 的電泳圖譜:分子量標(biāo)記(圖中第一條帶為 23kb),1~9 為黃顙魚個體,10~17 為鲇個-2 The electrophoresis patterns of DNA of Pelteobagrus fulvidraco and SilurusM:molecular marker(λ-Hind Ⅲ digest DNAMarker),1~9:Pelteobagrus fulvidraco individuals,10~17:Silurus asotus individual 引物篩選結(jié)果
圖 3-3 ISSR-PCR 反應(yīng)體系的 L25(56)正交試驗(yàn)設(shè)計電泳圖譜1~25 代表表 2-4 中編號Fig.3-3 The electrophoresis patterns of orthogonal experimental design for ISSR-PCR system1~25 represent the number in tab.2-4.2 ISSR-PCR 最佳反應(yīng)體系
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同提取方法和不同組織對中華絨螯蟹DNA提取效果的比較研究[J]. 劉皓,劉青,吳旭干,何杰,董鵬生,李彤,成永旭. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(24)
[2]野生和養(yǎng)殖黃顙魚遺傳結(jié)構(gòu)的TRAP分析[J]. 薛淑群,孫源,孫中武,盧建國. 水產(chǎn)學(xué)雜志. 2014(06)
[3]黃顙魚屬SSR分子鑒定及其遺傳多樣性[J]. 趙哲霞,蔣珊,王濱花,舒漢鼎,龔瑞玥,毛慧玲. 南昌大學(xué)學(xué)報(理科版). 2014(05)
[4]生物多樣性喪失機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 魏輔文,聶永剛,苗海霞,路浩,胡義波. 科學(xué)通報. 2014(06)
[5]淮河野生鲇魚線粒體Cytb基因的序列變異與遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 肖明松,崔峰,康健,張曉紅. 動物學(xué)雜志. 2013(01)
[6]苦瓜基因組DNA的提取及ISSR擴(kuò)增體系的優(yōu)化[J]. 田麗波,谷幸幸,商桑,楊衍. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2013(04)
[7]百合屬ISSR反應(yīng)條件優(yōu)化的研究[J]. 陳名紅,李玉,劉多,熊華斌,李成云. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2013(04)
[8]鄱陽湖黃顙魚染色體核型分析及進(jìn)化地位探討[J]. 毛慧玲,葛欣琦,劉佳麗,舒漢鼎,陳婷婷. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2012(06)
[9]云斑尖塘鱧遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 姚俊偉,許愛娛,潘淦,龍程. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(22)
[10]5個尼羅羅非魚群體遺傳關(guān)系的ISSR分析[J]. 鐘建興,李金秋,鐘然,黃洪貴,楊盛昌. 福建水產(chǎn). 2012(05)
碩士論文
[1]河南省3種鱸形目魚類自然居群的遺傳多樣性分析[D]. 劉芳.河南師范大學(xué) 2015
[2]基于微衛(wèi)星標(biāo)記和線粒體cytb基因序列的鲇遺傳多樣性研究[D]. 徐丹丹.西南大學(xué) 2013
[3]信陽南灣水庫翹嘴紅鲌和青梢紅鲌遺傳多樣性研究[D]. 馬云霞.河南師范大學(xué) 2013
[4]長江中下游五個地理種群黃顙魚遺傳多樣性的分析以及MSTN多態(tài)性的研究[D]. 劉朋朋.南京師范大學(xué) 2013
[5]丹江口水庫鳡魚野生和養(yǎng)殖群體遺傳多樣性的ISSR分析[D]. 溫樹紅.河南師范大學(xué) 2012
[6]鄱陽湖水系四大家魚ISSR研究[D]. 鄧夢穎.南昌大學(xué) 2011
[7]黃顙魚(Pelteobagrus fulvidraco)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析及性別特異性分子標(biāo)記的篩選[D]. 孫源.東北林業(yè)大學(xué) 2011
[8]淇河鯽ISSR和Cytb分子遺傳特征的研究[D]. 高麗霞.河南師范大學(xué) 2011
[9]贛江贛州江段四大家魚生物學(xué)特性及其遺傳多樣性研究[D]. 朱日財.南昌大學(xué) 2010
[10]長江上游兩種銅魚屬魚類種間特異性ISSR分子標(biāo)記及遺傳多樣性研究[D]. 孔焰.西南大學(xué) 2010
本文編號:2916734
【文章來源】:河南師范大學(xué)河南省
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
四種預(yù)處理黃顙魚DNA的電泳圖譜
圖 3-2 黃顙魚和鲇基因組 DNA 的電泳圖譜:分子量標(biāo)記(圖中第一條帶為 23kb),1~9 為黃顙魚個體,10~17 為鲇個-2 The electrophoresis patterns of DNA of Pelteobagrus fulvidraco and SilurusM:molecular marker(λ-Hind Ⅲ digest DNAMarker),1~9:Pelteobagrus fulvidraco individuals,10~17:Silurus asotus individual 引物篩選結(jié)果
圖 3-3 ISSR-PCR 反應(yīng)體系的 L25(56)正交試驗(yàn)設(shè)計電泳圖譜1~25 代表表 2-4 中編號Fig.3-3 The electrophoresis patterns of orthogonal experimental design for ISSR-PCR system1~25 represent the number in tab.2-4.2 ISSR-PCR 最佳反應(yīng)體系
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同提取方法和不同組織對中華絨螯蟹DNA提取效果的比較研究[J]. 劉皓,劉青,吳旭干,何杰,董鵬生,李彤,成永旭. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(24)
[2]野生和養(yǎng)殖黃顙魚遺傳結(jié)構(gòu)的TRAP分析[J]. 薛淑群,孫源,孫中武,盧建國. 水產(chǎn)學(xué)雜志. 2014(06)
[3]黃顙魚屬SSR分子鑒定及其遺傳多樣性[J]. 趙哲霞,蔣珊,王濱花,舒漢鼎,龔瑞玥,毛慧玲. 南昌大學(xué)學(xué)報(理科版). 2014(05)
[4]生物多樣性喪失機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 魏輔文,聶永剛,苗海霞,路浩,胡義波. 科學(xué)通報. 2014(06)
[5]淮河野生鲇魚線粒體Cytb基因的序列變異與遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 肖明松,崔峰,康健,張曉紅. 動物學(xué)雜志. 2013(01)
[6]苦瓜基因組DNA的提取及ISSR擴(kuò)增體系的優(yōu)化[J]. 田麗波,谷幸幸,商桑,楊衍. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2013(04)
[7]百合屬ISSR反應(yīng)條件優(yōu)化的研究[J]. 陳名紅,李玉,劉多,熊華斌,李成云. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2013(04)
[8]鄱陽湖黃顙魚染色體核型分析及進(jìn)化地位探討[J]. 毛慧玲,葛欣琦,劉佳麗,舒漢鼎,陳婷婷. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2012(06)
[9]云斑尖塘鱧遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 姚俊偉,許愛娛,潘淦,龍程. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(22)
[10]5個尼羅羅非魚群體遺傳關(guān)系的ISSR分析[J]. 鐘建興,李金秋,鐘然,黃洪貴,楊盛昌. 福建水產(chǎn). 2012(05)
碩士論文
[1]河南省3種鱸形目魚類自然居群的遺傳多樣性分析[D]. 劉芳.河南師范大學(xué) 2015
[2]基于微衛(wèi)星標(biāo)記和線粒體cytb基因序列的鲇遺傳多樣性研究[D]. 徐丹丹.西南大學(xué) 2013
[3]信陽南灣水庫翹嘴紅鲌和青梢紅鲌遺傳多樣性研究[D]. 馬云霞.河南師范大學(xué) 2013
[4]長江中下游五個地理種群黃顙魚遺傳多樣性的分析以及MSTN多態(tài)性的研究[D]. 劉朋朋.南京師范大學(xué) 2013
[5]丹江口水庫鳡魚野生和養(yǎng)殖群體遺傳多樣性的ISSR分析[D]. 溫樹紅.河南師范大學(xué) 2012
[6]鄱陽湖水系四大家魚ISSR研究[D]. 鄧夢穎.南昌大學(xué) 2011
[7]黃顙魚(Pelteobagrus fulvidraco)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析及性別特異性分子標(biāo)記的篩選[D]. 孫源.東北林業(yè)大學(xué) 2011
[8]淇河鯽ISSR和Cytb分子遺傳特征的研究[D]. 高麗霞.河南師范大學(xué) 2011
[9]贛江贛州江段四大家魚生物學(xué)特性及其遺傳多樣性研究[D]. 朱日財.南昌大學(xué) 2010
[10]長江上游兩種銅魚屬魚類種間特異性ISSR分子標(biāo)記及遺傳多樣性研究[D]. 孔焰.西南大學(xué) 2010
本文編號:2916734
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