東北林蛙是東北地區(qū)兩棲動(dòng)物的優(yōu)勢物種之一,也是名貴的經(jīng)濟(jì)蛙種。東北林蛙易患病,對(duì)養(yǎng)殖業(yè)來說,林蛙疾病的預(yù)防和治療是養(yǎng)殖能否成功獲利的關(guān)鍵因素。東北林蛙的皮膚上寄居著大量細(xì)菌,這些細(xì)菌與林蛙的健康息息相關(guān),本實(shí)驗(yàn)采用高通量測序技術(shù)檢測了野生和養(yǎng)殖東北林蛙皮膚的菌群結(jié)構(gòu),旨在全面了解東北林蛙皮膚細(xì)菌的種類和豐度及不同環(huán)境中東北林蛙皮膚菌群結(jié)構(gòu)和潛在致病菌屬的差異;由于東北林蛙患病后注射和飼喂的給藥方式較難實(shí)現(xiàn),所以考慮林蛙皮膚的特殊結(jié)構(gòu)和功能,用藥浴方式使藥物透皮吸收。本實(shí)驗(yàn)通過對(duì)東北林蛙進(jìn)行藥浴,探索藥物藥浴后東北林蛙皮膚的菌群結(jié)構(gòu)和潛在致病菌屬的變化,進(jìn)而了解藥浴對(duì)菌群結(jié)構(gòu)及潛在致病菌屬的影響。實(shí)驗(yàn)進(jìn)行了野生與養(yǎng)殖東北林蛙皮膚菌群結(jié)構(gòu)檢測及對(duì)比分析(野生組n=7,養(yǎng)殖組n=7);抗生素(慶大霉素)、益生菌(枯草芽孢桿菌)和中藥(大黃粉水煎液)藥浴對(duì)養(yǎng)殖東北林蛙皮膚菌群結(jié)構(gòu)的影響分析(對(duì)照組n=7,抗生素組n=14,益生菌組n=7,中藥組n=7)。分別取野生和養(yǎng)殖東北林蛙的皮膚樣本和不同藥物藥浴后的皮膚樣本,測序分析后得到樣本菌群的物種組成和豐度信息。通過Alpha多樣性分析、Beta多... 

【文章來源】：東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：64 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

實(shí)驗(yàn)動(dòng)物分組Fig.2-1Experimentalanimalsgrouping藥浴液配制：將40mg慶大霉素溶于2L蒸餾水中，慶大霉素濃度20mg/L；將0.4g枯

3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果3.1 野生組與養(yǎng)殖組細(xì)菌群落分析3.1.1 數(shù)據(jù)信息與 Alpha 多樣性分析兩個(gè)實(shí)驗(yàn)組共 14 個(gè)樣本（野生組 n=7，養(yǎng)殖組 n=7），通過序列過濾及雙端拼接，獲得有效序列 524852 條，序列平均長度 446 bp，總堿基數(shù) 233963272。經(jīng)過序列相似性大于 97%水平上的 OTU 聚類，共得到的 OTU 的數(shù)目為 1023 個(gè)，分屬 700 個(gè)種，471 個(gè)屬，218 個(gè)科，113 個(gè)目，52 個(gè)綱，26 個(gè)門。野生組序列豐度大于 1%的 OTUs 包括 8 個(gè)，養(yǎng)殖組序列豐度大于 1%的 OTUs 包括 13 個(gè)。稀釋曲線均趨于平坦，見圖 3-1，表明取樣數(shù)量合理，足夠體現(xiàn)樣本中絕大多數(shù)菌群物種的信息。Alpha 多樣性分析的 Sobs 指數(shù)是豐富度的實(shí)際觀測值，結(jié)果顯示在養(yǎng)殖組中的 OTU 數(shù)量更多；Coverage 指數(shù)均在 99%以上，表明測序結(jié)果可信，見表 3-1。Chao 指數(shù)和 Ace 指數(shù)用來估計(jì)物種總數(shù)，反映了菌群豐度，結(jié)果顯示養(yǎng)殖組的 Chao 指數(shù)和 Ace 指數(shù)均高于野生組，差異極顯著。養(yǎng)殖組的群落多樣性顯著高于野生組。養(yǎng)殖東北林蛙和野生東北林蛙的皮膚菌群多樣性差異顯著，見表 3-2，養(yǎng)殖組中 OTU 豐度和多樣性顯著高于野生組。

門水平細(xì)菌相對(duì)豐度Fig.3-2Bacteriarelativeabundanceonphylumlevel

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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本文編號(hào)：2910292