發(fā)布時(shí)間：2020-10-29 17:42

　　 線粒體DNA作為核外遺傳物質(zhì),被廣泛的應(yīng)用于系統(tǒng)發(fā)育分析以及種群基因交流、遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)評(píng)估上。本文首次測(cè)定了大鱗副泥鰍和臺(tái)灣泥鰍的線粒體基因組全序列,并分析了其結(jié)構(gòu)單元,結(jié)合NCBI中已公布的鰍科其他魚類的線粒體基因組全序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,分析了鰍科相關(guān)物種的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,主要研究結(jié)果如下:1.從外部形態(tài)觀察中,臺(tái)灣泥鰍、大鱗副泥鰍的尾柄長(zhǎng)和尾柄高約相等;臺(tái)灣泥鰍的雌雄差異不明顯,這一結(jié)果與其他學(xué)者提出的一致;臺(tái)灣泥鰍的雄鰍還有一個(gè)明顯的特征,在其背鰭后左右側(cè)線鱗上面有長(zhǎng)2cm左右肉質(zhì)突出,這在泥鰍和大鱗副泥鰍中都沒(méi)有發(fā)現(xiàn)。2.大鱗副泥鰍線粒體基因組全長(zhǎng)為16 570 bp,臺(tái)灣泥鰍為16 568 bp,均包含22個(gè)t RNA基因、13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、2個(gè)r RN A基因;兩種鰍線粒體均存在基因間隔與基因重疊區(qū)域,基因間隔總長(zhǎng)分別為33bp和34 bp,基因重疊總長(zhǎng)皆為28bp。在堿基使用方面,大鱗副泥鰍和臺(tái)灣泥鰍都表現(xiàn)出明顯的AT偏向性,這與鰍科其它已測(cè)物種線粒體基因組的特征相吻合;13種蛋白質(zhì)中,除了COX1和ND6分別以GTG和TTA為起始密碼子,其余的都以ATG做為起始密碼子。終止密碼子使用情況較為復(fù)雜包括完全密碼子(TAA,TAG,CAT)和一些不完全密碼子(T-,TA-)。大鱗副泥鰍和臺(tái)灣泥鰍基因組中12Sr RNA和16Sr RNA基因分別長(zhǎng)954bp,1678bp和954bp,1676bp。3.通過(guò)ML法、NJ法來(lái)構(gòu)建15種鰍科的系統(tǒng)發(fā)生樹。結(jié)果顯示,本研究中15種鰍科的分支分類情況與傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)分類基本一致,花鰍亞科位于系統(tǒng)進(jìn)化樹的頂部,證明是最為進(jìn)化的類群;其次為條鰍亞科,沙鰍亞科最原始。且大鱗副泥鰍和臺(tái)灣泥鰍聚成一支(pp=100)。故我們大膽推測(cè)臺(tái)灣泥鰍可能為大鱗副泥鰍的一個(gè)亞種。
【學(xué)位單位】：浙江海洋學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位年份】：2015
【中圖分類】：S917.4
【部分圖文】：

圖2-3臺(tái)灣泥鰍樣本

35圖 3-3. 大鱗副泥鰍線粒體基因組環(huán)狀圖Fig 3-3. Circular map of the mitogenome sequence of Paramisgurnus dabryanus

42圖 3-4. 臺(tái)灣泥鰍線粒體基因組環(huán)狀圖Fig 3-4. Circular map of the mitogenome sequence of Paramisgurnus dabryanus ssp
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本文編號(hào)：2861240