線粒體DNA作為核外遺傳物質(zhì),被廣泛的應(yīng)用于系統(tǒng)發(fā)育分析以及種群基因交流、遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)評估上。本文首次測定了大鱗副泥鰍和臺灣泥鰍的線粒體基因組全序列,并分析了其結(jié)構(gòu)單元,結(jié)合NCBI中已公布的鰍科其他魚類的線粒體基因組全序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,分析了鰍科相關(guān)物種的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,主要研究結(jié)果如下:1.從外部形態(tài)觀察中,臺灣泥鰍、大鱗副泥鰍的尾柄長和尾柄高約相等;臺灣泥鰍的雌雄差異不明顯,這一結(jié)果與其他學(xué)者提出的一致;臺灣泥鰍的雄鰍還有一個(gè)明顯的特征,在其背鰭后左右側(cè)線鱗上面有長2cm左右肉質(zhì)突出,這在泥鰍和大鱗副泥鰍中都沒有發(fā)現(xiàn)。2.大鱗副泥鰍線粒體基因組全長為16 570 bp,臺灣泥鰍為16 568 bp,均包含22個(gè)t RNA基因、13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、2個(gè)r RN A基因;兩種鰍線粒體均存在基因間隔與基因重疊區(qū)域,基因間隔總長分別為33bp和34 bp,基因重疊總長皆為28bp。在堿基使用方面,大鱗副泥鰍和臺灣泥鰍都表現(xiàn)出明顯的AT偏向性,這與鰍科其它已測物種線粒體基因組的特征相吻合;13種蛋白質(zhì)中,除了COX1和ND6分別以GTG和TTA為起始密碼子,其余的都以ATG做為起始密碼子。終止密碼子使用情況較為復(fù)雜包括完全密碼子(TAA,TAG,CAT)和一些不完全密碼子(T-,TA-)。大鱗副泥鰍和臺灣泥鰍基因組中12Sr RNA和16Sr RNA基因分別長954bp,1678bp和954bp,1676bp。3.通過ML法、NJ法來構(gòu)建15種鰍科的系統(tǒng)發(fā)生樹。結(jié)果顯示,本研究中15種鰍科的分支分類情況與傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)分類基本一致,花鰍亞科位于系統(tǒng)進(jìn)化樹的頂部,證明是最為進(jìn)化的類群;其次為條鰍亞科,沙鰍亞科最原始。且大鱗副泥鰍和臺灣泥鰍聚成一支(pp=100)。故我們大膽推測臺灣泥鰍可能為大鱗副泥鰍的一個(gè)亞種。
【學(xué)位單位】：浙江海洋學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位年份】：2015
【中圖分類】：S917.4
【部分圖文】：

圖2-3臺灣泥鰍樣本

35圖 3-3. 大鱗副泥鰍線粒體基因組環(huán)狀圖Fig 3-3. Circular map of the mitogenome sequence of Paramisgurnus dabryanus

42圖 3-4. 臺灣泥鰍線粒體基因組環(huán)狀圖Fig 3-4. Circular map of the mitogenome sequence of Paramisgurnus dabryanus ssp
【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 吳焱;時(shí)月;凌去非;汪務(wù)誠;喬宗禮;;蘇州地區(qū)泥鰍與大鱗副泥鰍肌肉微量元素含量比較[J];水產(chǎn)養(yǎng)殖;2011年10期

2 常重杰,杜啟艷;人工誘導(dǎo)四倍體大鱗副泥鰍的研究[J];河南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2002年04期

3 王元軍,李殿香;南四湖大鱗副泥鰍生態(tài)特征的初步研究[J];水利漁業(yè);2005年01期

4 印杰;熊傳喜;李圣華;張紅云;朱勇夫;;四倍體和二倍體泥鰍及大鱗副泥鰍營養(yǎng)成分分析[J];水生態(tài)學(xué)雜志;2008年06期

5 常重杰;杜啟艷;楊煬;吳小華;;強(qiáng)力型油煙機(jī)清潔劑對大鱗副泥鰍的毒性研究[J];湖北農(nóng)業(yè)科學(xué);2011年03期

6 孫守旗;劉連祥;肖娟;鄭世雄;;稻田健康養(yǎng)殖大鱗副泥鰍試驗(yàn)[J];科學(xué)養(yǎng)魚;2012年06期

7 盧國興;儲(chǔ)張杰;胡廷尖;王惠儒;謝裕達(dá);王慧娟;;舟山群島大鱗副泥鰍與真泥鰍形態(tài)特征比較研究[J];淡水漁業(yè);2012年04期

8 郝小鳳;凌去非;李彩娟;葛辰;;日糧中不同硒水平對大鱗副泥鰍肌肉品質(zhì)的影響[J];飼料工業(yè);2013年02期

9 宋光泉;陳清泉;胡良成;歐陽靜仁;;泥鰍和大鱗副泥鰍體表粘液特性的研究初報(bào)[J];水生生物學(xué)報(bào);1990年03期

10 宋平,宿兵;雌性大鱗副泥鰍血清睪酮和雌二醇的晝夜變化[J];四川動(dòng)物;1992年04期

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前9條

1 郝小鳳;日糧中不同硒水平對大鱗副泥鰍生理生化指標(biāo)及肌肉品質(zhì)的影響[D];蘇州大學(xué);2013年

2 陳鋼銘;微衛(wèi)星標(biāo)記輔助大鱗副泥鰍育種研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

3 趙旭;黃河流域大鱗副泥鰍遺傳多樣性分析[D];河南師范大學(xué);2012年

4 李彩娟;基于第二代測序的大鱗副泥鰍微衛(wèi)星分子標(biāo)記的開發(fā)與應(yīng)用[D];蘇州大學(xué);2014年

5 胡建華;大鱗副泥鰍遺傳多樣性研究[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

6 葛辰;大鱗副泥鰍轉(zhuǎn)錄組分析、SNP開發(fā)及生長相關(guān)分子標(biāo)記的篩選[D];蘇州大學(xué);2014年

7 戴璐怡;大鱗副泥鰍和臺灣泥鰍的形態(tài)學(xué)研究和線粒體基因組全序列分析[D];浙江海洋學(xué)院;2015年

8 楊煬;蘇丹紅Ⅳ對大鱗副泥鰍和泥鰍的毒性研究[D];河南師范大學(xué);2012年

9 章霞;大鱗副泥鰍GPR30基因的克隆及EE2暴露對其表達(dá)的影響[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2013年

本文編號：2861240