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MnMats,MnTaiman及一種高變C-型凝集素在日本沼蝦先天免疫中的功能研究

發(fā)布時間:2020-09-09 18:15
   日本沼蝦(Macrobrachium nipponense)俗稱河蝦或青蝦,是一種重要的淡水養(yǎng)殖蝦類。其適應能力強,食性雜,繁殖力強,廣泛分布于我國大小水域,是我國重要的養(yǎng)殖蝦類之一。河蝦肉質鮮美,營養(yǎng)豐富,在我國水產(chǎn)品市場廣受歡迎。但隨著現(xiàn)代工業(yè)化進程的迅速發(fā)展,各地水域水質均受到不同程度破壞,加上養(yǎng)殖業(yè)自身發(fā)展的不健康和不規(guī)范,進一步加劇了養(yǎng)殖水域水環(huán)境的惡化,導致包括河蝦在內(nèi)的咸淡水經(jīng)濟蝦類養(yǎng)殖受多種疾病困擾,而研究河蝦先天免疫防御機制,可以對生產(chǎn)實踐中的疾病防控進行有效指導。模式識別受體和免疫信號途徑作為無脊椎動物先天免疫系統(tǒng)的重要組成部分,在無脊椎動物對抗病原微生物感染過程發(fā)揮重要作用。本論文首先對日本沼蝦Hippo信號通路中Mats基因進行了研究。Yorkie是Hippo信號通路的轉錄因子,促進Cactus基因(Toll信號通路)的表達。而Yorkie作為轉錄因子,行使功能時,需要與其它蛋白進行互作,Taiman是Yokie的一種互作蛋白,在該論文中,我們對Taiman基因的選擇性剪切以及在免疫防御中的功能進行了初步研究。最后,我們對發(fā)現(xiàn)的一種高變C-型凝集素(在編碼區(qū),通過含有不同數(shù)目的重復單元,增加凝集素多樣性)的功能進行了初步研究。1.MnMats基因在日本沼蝦先天免疫中的功能在本研究中,我們發(fā)現(xiàn)并命名了MnMats基因,獲得了其cDNA序列,cDNA全長為1127bp,開放閱讀框(ORF)大小為651bp,編碼217個氨基酸長度的蛋白,含有一個Mob1_phocein結構域。我們研究了其在日本沼蝦中的組織分布情況,發(fā)現(xiàn)其在各個組織中均有分布,肝胰腺中表達量最大,而血細胞中最低。我們進一步研究了其在金黃色葡萄球菌/副溶血弧菌刺激時的表達模式,發(fā)現(xiàn)金黃色葡萄球菌刺激時,除血細胞和胃以外,各個組織MnMats均呈上調(diào)趨勢。而當機體面對副溶血弧菌刺激時,除胃以外其他組織中MnMats也均上調(diào)。RNAi敲低MnMats后,發(fā)現(xiàn)多種抗菌肽表達受到了抑制。這些研究結果表明,作為Hippo信號通路中的重要組件,MnMats基因可能通過抑制Cactus基因的表達,促進抗菌肽的表達,從而參與了日本沼蝦先天免疫防御。2.MnTaiman基因在日本沼蝦先天免疫中的功能我們在日本沼蝦中發(fā)現(xiàn)并命名了MnTaiman基因。日本沼蝦Taiman基因存在四種不同的轉錄本。其中最長的轉錄本cDNA全長為6894 bp,開放閱讀框(ORF)全長為4998 bp,編碼長度為1666個氨基酸的蛋白。含有一個PAS結構域、一個HLH結構域和一個PAS_11結構域。半定量進行組織分布研究時,發(fā)現(xiàn)MnTaiman基因C末端存在選擇性剪切,產(chǎn)生四種不同的剪切本,命名為TaiA、TaiB、TaiC、TaiD。qRT-PCR結果表明,MnTai-Total(TaiT)、TaiA、TaiB、及TaiD的組織分布相似,在各個組織中均有分布,并且在肝胰腺中高表達。但TaiC在胃組織中高表達。金黃色葡萄球菌/副溶血弧菌刺激下的表達模式實驗,結果表明,除血細胞之外,在其他組織中TaiT及四種轉錄本呈現(xiàn)不同的表達模式。在血細胞中,病原刺激后基因均呈下調(diào)趨勢。在河蝦血細胞中,RNA干擾敲低MnTaiman,金葡萄球菌刺激后24h,ALF1表達顯著增高。MnTaiman敲低后,副溶血弧菌刺激后24h,ALF1表達也明顯上調(diào)。根據(jù)已有文獻,Taiman和Yorkie互作,而Yorkie調(diào)節(jié)Cactus的表達。所以我們推測,MnTaiman通過調(diào)控Cactus的表達,負調(diào)控Toll信號通路,從而抑制抗菌肽基因的表達。3.一種高變C-型凝集素功能研究我們在日本沼蝦中發(fā)現(xiàn)一種C-型凝集素,由于其編碼區(qū)含有不同數(shù)目的重復單元,因此,我們命名為repeat lectin-MnRlec。該蛋白含有一個信號肽、一個CLECT結構域,在這兩個結構域之間包含一個含有不同數(shù)目重復單元的區(qū)域,該區(qū)域含有的串聯(lián)重復可以高達9個,最少含有一個串聯(lián)重復。在基因組上,我們也發(fā)現(xiàn)了含有不同數(shù)目重復單元的序列,因此我們推測,含有不同數(shù)目重復單元的凝集素,在基因組復制過程中,發(fā)生了滑動錯配,導致基因多樣性的產(chǎn)生。我們表達和純化了三種分別含有1個、2個、3個串聯(lián)重復單元的MnRlec蛋白,命名為MnRlec1、MnRlec2、MnRlec3。對這三種蛋白進行細菌結合實驗,結果發(fā)現(xiàn)MnRlec1對副溶血弧菌的結合呈現(xiàn)出鈣離子依賴的特征,MnRlec2和MnRlec3對副溶血弧菌的結合能力減弱。此外,MnRlec1、MnRlec2以及MnRlec3均表現(xiàn)出對大腸桿菌的結合能力,且這種結合不依賴于鈣離子。通過我們的研究發(fā)現(xiàn),MnRlec隨著重復單元的增加,結合副溶血弧菌的能力減弱,這可能是病原和宿主在進化過程中進行博弈的結果。
【學位單位】:南京師范大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2019
【中圖分類】:S917.4
【部分圖文】:

電泳圖,日本沼蝦,電泳圖,模板


設計特異引物,以日本沼蝦的各個組織 cDNA(血、心、為模板,使用常規(guī) PCR 擴增獲得的四種剪切本的電泳圖。ith gene-specific primers, we gain the four different splicing trTaiA-TaiD) using RT-PCR methods. The cDNA from hemocyts, gills, stomach and intestine of M. nipponense were used as an 的四種剪切體(TaiA、TaiB 、TaiC 和 TaiD)模式圖。五個外顯子的長度。

模式圖,剪切體,模式圖,日本沼蝦


圖 3.2. 通過設計特異引物,以日本沼蝦的各個組織 cDNA(血、心、肝、鰓、胃和腸)為模板,使用常規(guī) PCR 擴增獲得的四種剪切本的電泳圖。Fig.3.2. With gene-specific primers, we gain the four different splicing transcripts ofMnTaiman (TaiA-TaiD) using RT-PCR methods. The cDNA from hemocytes, heart,hepatopancreas, gills, stomach and intestine of M. nipponense were used as templates.

氨基酸序列,日本沼蝦,氨基酸序列,cDNA序列


atgattgatcaggagatatataaataaaatttgactcagttaaattacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa圖.4.1. (A) 日本沼蝦 MnRlec 的 cDNA 序列和預測的氨基酸序列。圖中灰色陰影部分為 CLEC 結構域,劃線部分為信號肽(Signal peptide),彩色陰影表示 6 個短串聯(lián)重復單元

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本文編號:2815303

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