長牡蠣干擾素調(diào)節(jié)因子(CgIRF-1和CgIRF-8)對干擾素系統(tǒng)調(diào)控機(jī)制的初步研究
發(fā)布時間:2020-08-28 04:00
【摘要】:干擾素調(diào)節(jié)因子(Interferon regulatory factor,IRFs)是一類具有多種生物學(xué)功能的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,在調(diào)節(jié)抗病毒免疫反應(yīng)、免疫細(xì)胞的生長和分化以及腫瘤的形成中發(fā)揮重要的作用。目前,對脊椎動物干擾素調(diào)節(jié)因子及其介導(dǎo)的干擾素抗病毒免疫通路的研究已經(jīng)比較透徹,但是在海洋無脊椎動物中的研究還處于起步階段。本研究以長牡蠣(Crassostrea gigas)為研究對象,利用分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)和生物信息學(xué)等相關(guān)技術(shù),對長牡蠣IRF-1(命名為CgIRF-1)和IRF-8(命名為CgIRF-8)在干擾素系統(tǒng)中的調(diào)控功能進(jìn)行了初步研究。CgIRF-1和CgIRF-8基因的開放閱讀框全長分別為990 bp和1425 bp,分別編碼229和473個氨基酸。CgIRF-1和CgIRF-8的氨基端高度保守,均包含典型的DBD結(jié)構(gòu)域。對于羧基端,CgIRF-8含有典型的IAD1結(jié)構(gòu)域;CgIRF-1與其他IRF-1/2家族中的分子一樣,不具有IAD結(jié)構(gòu)域并且序列相似性比較低,含有并不保守的轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域。值得指出的是,CgIRF-1的后100個氨基酸中包含一些酪氨酸、絲氨酸和蘇氨酸,這些氨基酸被磷酸化后,IRF-1的轉(zhuǎn)錄活性增強(qiáng)。CgIRF-1和CgIRF-8 mRNA在各組織中均呈組成型表達(dá),且都在血淋巴細(xì)胞中表達(dá)量最高。細(xì)胞內(nèi)定位顯示,CgIRF-1在長牡蠣血細(xì)胞的細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中均有分布,而CgIRF-8主要分布于細(xì)胞質(zhì)中。Poly(I:C)處理48小時后,長牡蠣血淋巴細(xì)胞中CgIRF-1 mRNA表達(dá)量顯著增加(p0.05)。原核重組表達(dá)蛋白CgIRF-1(rCgIRF-1)能夠在體外結(jié)合ISRE經(jīng)典基序。雙熒光素酶報告基因?qū)嶒?yàn)顯示,CgIRF-1能夠顯著增強(qiáng)CgIFNLP的啟動子活性(p0.05),而CgIRF-8能夠顯著抑制CgIFNLP的啟動子活性(p0.05);共轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)表明,CgIRF-1和CgIRF-8能夠協(xié)同抑制CgIFNLP的啟動子活性(p0.01)。以上研究結(jié)果表明,與脊椎動物相比,長牡蠣的干擾素因子家族成員CgIRF-1和CgIRF-8分子在結(jié)構(gòu)上高度保守;CgIRF-1能夠響應(yīng)poly(I:C)刺激引起的免疫應(yīng)答,通過激活長牡蠣中干擾素系統(tǒng)調(diào)節(jié)抗病毒免疫應(yīng)答反應(yīng);CgIRF-8則與CgIRF-1協(xié)同抑制干擾素系統(tǒng)防止機(jī)體出現(xiàn)過免疫反應(yīng)。本研究為進(jìn)一步研究長牡蠣干擾素調(diào)節(jié)因子家族成員的結(jié)構(gòu)和功能奠定了重要的理論基礎(chǔ),同時也為研究無脊椎動物干擾素系統(tǒng)的抗病毒免疫調(diào)節(jié)機(jī)制提供了參考。
【學(xué)位授予單位】:大連海洋大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S917.4
【圖文】:
圖 1-1 識別 RNA 病毒的模式識別受體[4]Fig 1-1 Pattern-recognition receptors (PRRs) for RNA virus recognitions 被誘導(dǎo)產(chǎn)生、分泌到胞外后,與分布于細(xì)胞表面的受體結(jié)合,激活 janus 激和轉(zhuǎn)錄激活因子 (janus kinase signal transducer and activator of transcription, 信號通路,進(jìn)而發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng)。I 型 IFNs 與受體 IFNAR1 和 IFNAR2 結(jié)合,段 Tyr被 Tyk 2和 Jak磷酸化,募集信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和激活轉(zhuǎn)錄因子 1 (signal transvator of transcription, STAT1) 和 STAT2。STAT1 和 STAT2 形成異源二聚體并被與 IRF-9 形成三聚體轉(zhuǎn)移進(jìn)入核內(nèi)作用于干擾素刺激基因 (interferon stimuISGs) 啟動子區(qū)的干擾素刺激反應(yīng)元件 (IFN-stimulated response element,ISR下游基因轉(zhuǎn)錄[32, 33]。 型 IFN 與受體 IFNGR1 和 IFNGR2 相結(jié)合,受體胞活的 JAK1 和 JAK2 磷酸化后招募 STAT1,STAT1 形成同源二聚體,被磷酸核內(nèi),結(jié)合到 IFN-γ激活位點(diǎn) (gamma-interferon-activation sites, GAS),最終的表達(dá)[34]。 型 IFNs 結(jié)合受體后,STAT1 和 STAT2 發(fā)生磷酸化,與 IRF-9錄復(fù)合體,誘導(dǎo)下游基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá),最終發(fā)揮抗病毒、抗增殖和免疫調(diào)節(jié),效應(yīng)分子通過 3 種途徑發(fā)揮抗病毒作用分別是:Mx (Myxovirus-resistant)白激酶 PKR (Double-stranded RNA-activated protein kinase) 通路,2′-5′-寡聚
N、ISG 和其它密切相關(guān)基因的表達(dá)而發(fā)揮多種生物學(xué)效應(yīng)[38]。目前 經(jīng) 鑒 定 出 了 11 種 IRFs, 分 別 是 IRF-1 、IRF-2 、IRF-/ICSAT、IRF-5 、IRF-6 、IRF-7 、IRF-8/ICSBP 和 IRF-9/ISGF3γ/p48其中 IRF11 只在硬骨魚中發(fā)現(xiàn)[39]。所有的 IRFs 成員在其氨基端都含角-螺旋型的 IRF 結(jié)構(gòu)域,又稱為 DNA 錨定結(jié)構(gòu)域 (DBD),它可以反應(yīng)原件 (ISRE:A/GNGAAANNGAAACT) 的 DNA 序列 (如圖 4-6 個保守的色氨酸殘基 (Trp),這 5 個保守的殘基對識別含有 5’-GADNA 序列具有重要作用[40]。除了 IRF-1 和 IRF-2,脊椎動物 IRFs 的 結(jié)構(gòu)域 (IAD1),這是一個與 Smad 家族的 MH2 結(jié)構(gòu)域相似的結(jié)構(gòu)域F 成員或其他的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子發(fā)生同源或異源二聚化[29] [41]。IRF-1 和個 IAD2 結(jié)構(gòu)域,是由 PEST 結(jié)構(gòu)域(富含脯氨酸,谷氨酸,絲氨外,IRF-1 的羧基端還具有保守性很低的激活結(jié)構(gòu)域(在 IRF-1 的多個酪氨酸);IRF-2 的羧基端具有抑制結(jié)構(gòu)域(在 IRF-2 的最后 2酸,精氨酸和賴氨酸)[42, 43]。IRFs 蛋白結(jié)構(gòu)中的 DBD 和 IAD 決定因調(diào)節(jié)中所發(fā)揮的不同作用。
圖 3-3 CgIRF-8 與其他脊椎動物 IRF-8 的多序列比對MART 預(yù)測長牡蠣 CgIRF-8 的蛋白結(jié)構(gòu)。(B) 脊椎動物和無脊椎動物 IRF-8比對。方框內(nèi)分別為 IRF結(jié)構(gòu)域 (DBD)和 IRF-3 結(jié)構(gòu)域 (IAD1)。)Fig. 3-3 Multiple sequence alignment of CgIRF-8 with other IRF-8 from inverteprotein structure of CgIRF-8 from C. gigas predicted by SMART. (B) Comparisoes of the IRF-8 from invertebrates. Inside the box are the amino acid sequence o(DBD) and IRF-3domain (IAD1).)EGA6.0 軟件,應(yīng)用 neighbour-joining (NJ) 算法對 CgIRF-1和 Cg以及 NCBI 上已知的其它物種的 IRFs 家族序列構(gòu)建進(jìn)化樹。有 建進(jìn)化樹,結(jié)果顯示所有構(gòu)建進(jìn)化樹的 IRFs 分子除了分成了 4 個一些特異性的分支(如圖 3-4)。結(jié)果顯示,CgIRF-1 首先與一支,然后與 CgIRF2-binding protein-like 聚到一起。而 CgIRF-1 與不同的亞支,但是與 IRF-1 家族中的其他 IRFs 聚為一群。CgIR,沒有與脊椎動物中的 IRF-4 家族聚為一支,而是被分出來單獨(dú)形
本文編號:2807075
【學(xué)位授予單位】:大連海洋大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S917.4
【圖文】:
圖 1-1 識別 RNA 病毒的模式識別受體[4]Fig 1-1 Pattern-recognition receptors (PRRs) for RNA virus recognitions 被誘導(dǎo)產(chǎn)生、分泌到胞外后,與分布于細(xì)胞表面的受體結(jié)合,激活 janus 激和轉(zhuǎn)錄激活因子 (janus kinase signal transducer and activator of transcription, 信號通路,進(jìn)而發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng)。I 型 IFNs 與受體 IFNAR1 和 IFNAR2 結(jié)合,段 Tyr被 Tyk 2和 Jak磷酸化,募集信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和激活轉(zhuǎn)錄因子 1 (signal transvator of transcription, STAT1) 和 STAT2。STAT1 和 STAT2 形成異源二聚體并被與 IRF-9 形成三聚體轉(zhuǎn)移進(jìn)入核內(nèi)作用于干擾素刺激基因 (interferon stimuISGs) 啟動子區(qū)的干擾素刺激反應(yīng)元件 (IFN-stimulated response element,ISR下游基因轉(zhuǎn)錄[32, 33]。 型 IFN 與受體 IFNGR1 和 IFNGR2 相結(jié)合,受體胞活的 JAK1 和 JAK2 磷酸化后招募 STAT1,STAT1 形成同源二聚體,被磷酸核內(nèi),結(jié)合到 IFN-γ激活位點(diǎn) (gamma-interferon-activation sites, GAS),最終的表達(dá)[34]。 型 IFNs 結(jié)合受體后,STAT1 和 STAT2 發(fā)生磷酸化,與 IRF-9錄復(fù)合體,誘導(dǎo)下游基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá),最終發(fā)揮抗病毒、抗增殖和免疫調(diào)節(jié),效應(yīng)分子通過 3 種途徑發(fā)揮抗病毒作用分別是:Mx (Myxovirus-resistant)白激酶 PKR (Double-stranded RNA-activated protein kinase) 通路,2′-5′-寡聚
N、ISG 和其它密切相關(guān)基因的表達(dá)而發(fā)揮多種生物學(xué)效應(yīng)[38]。目前 經(jīng) 鑒 定 出 了 11 種 IRFs, 分 別 是 IRF-1 、IRF-2 、IRF-/ICSAT、IRF-5 、IRF-6 、IRF-7 、IRF-8/ICSBP 和 IRF-9/ISGF3γ/p48其中 IRF11 只在硬骨魚中發(fā)現(xiàn)[39]。所有的 IRFs 成員在其氨基端都含角-螺旋型的 IRF 結(jié)構(gòu)域,又稱為 DNA 錨定結(jié)構(gòu)域 (DBD),它可以反應(yīng)原件 (ISRE:A/GNGAAANNGAAACT) 的 DNA 序列 (如圖 4-6 個保守的色氨酸殘基 (Trp),這 5 個保守的殘基對識別含有 5’-GADNA 序列具有重要作用[40]。除了 IRF-1 和 IRF-2,脊椎動物 IRFs 的 結(jié)構(gòu)域 (IAD1),這是一個與 Smad 家族的 MH2 結(jié)構(gòu)域相似的結(jié)構(gòu)域F 成員或其他的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子發(fā)生同源或異源二聚化[29] [41]。IRF-1 和個 IAD2 結(jié)構(gòu)域,是由 PEST 結(jié)構(gòu)域(富含脯氨酸,谷氨酸,絲氨外,IRF-1 的羧基端還具有保守性很低的激活結(jié)構(gòu)域(在 IRF-1 的多個酪氨酸);IRF-2 的羧基端具有抑制結(jié)構(gòu)域(在 IRF-2 的最后 2酸,精氨酸和賴氨酸)[42, 43]。IRFs 蛋白結(jié)構(gòu)中的 DBD 和 IAD 決定因調(diào)節(jié)中所發(fā)揮的不同作用。
圖 3-3 CgIRF-8 與其他脊椎動物 IRF-8 的多序列比對MART 預(yù)測長牡蠣 CgIRF-8 的蛋白結(jié)構(gòu)。(B) 脊椎動物和無脊椎動物 IRF-8比對。方框內(nèi)分別為 IRF結(jié)構(gòu)域 (DBD)和 IRF-3 結(jié)構(gòu)域 (IAD1)。)Fig. 3-3 Multiple sequence alignment of CgIRF-8 with other IRF-8 from inverteprotein structure of CgIRF-8 from C. gigas predicted by SMART. (B) Comparisoes of the IRF-8 from invertebrates. Inside the box are the amino acid sequence o(DBD) and IRF-3domain (IAD1).)EGA6.0 軟件,應(yīng)用 neighbour-joining (NJ) 算法對 CgIRF-1和 Cg以及 NCBI 上已知的其它物種的 IRFs 家族序列構(gòu)建進(jìn)化樹。有 建進(jìn)化樹,結(jié)果顯示所有構(gòu)建進(jìn)化樹的 IRFs 分子除了分成了 4 個一些特異性的分支(如圖 3-4)。結(jié)果顯示,CgIRF-1 首先與一支,然后與 CgIRF2-binding protein-like 聚到一起。而 CgIRF-1 與不同的亞支,但是與 IRF-1 家族中的其他 IRFs 聚為一群。CgIR,沒有與脊椎動物中的 IRF-4 家族聚為一支,而是被分出來單獨(dú)形
【參考文獻(xiàn)】
相關(guān)博士學(xué)位論文 前1條
1 辛魯生;長牡蠣白介素17及其信號通路分子的作用機(jī)制[D];中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所);2016年
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前1條
1 孫穎;長牡蠣腫瘤壞死因子(CgTNF-1)免疫調(diào)節(jié)機(jī)制的初步研究[D];中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所);2014年
本文編號:2807075
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