白氏文昌魚Amphip38基因克隆及免疫功能的分析
發(fā)布時間:2020-08-19 08:22
【摘要】:絲裂酶原活化蛋白激酶(mitogen- activated protein kinases, MAPKs)級聯(lián)反應(yīng)是細胞內(nèi)重要的信號傳導系統(tǒng)之一。p38MAPKs是MAPK家族中的重要成員,被認為是細胞眾多信號轉(zhuǎn)導通路的中轉(zhuǎn)站。MAPK的激活需要雙位點磷酸化,p38亞家族的所有成員都具有“T-G-Y”雙位點磷酸化模塊。通過上游的MKK3和MKK6磷酸化TGY模塊而激活p38蛋白。磷酸化的P38再激活一些轉(zhuǎn)錄因子和其他的蛋白酶后可導致許多生物學效應(yīng)的發(fā)生,參與細胞存活、分化和凋亡等過程,在炎癥、應(yīng)激反應(yīng)中也有重要作用。文昌魚是脊索動物中的基底生物,是研究無脊椎動物過渡到脊椎動物的模式動物,文昌魚在生物進化中的特殊地位,能夠為研究脊椎動物p38MAPKs信號通路以及免疫系統(tǒng)的進化提供關(guān)鍵的證據(jù)。本論文以白氏文昌魚p38為研究對象,通過基因克隆、實時定量PCR、免疫印跡、生物信息分析等技術(shù)手段得到以下的研究結(jié)果:(1)本研究采用RACE技術(shù)克隆了白氏文昌魚p38基因全長,命名為Amphip38。其cDNA序列全長為1329bp,其中5’UTR為88bp,3'UTR為131bp,ORF長為1110bp。Amphip38的ORF編碼了369個氨基酸,包含一個高度保守的STK(絲氨酸/蘇氨酸激酶)結(jié)構(gòu)域。預(yù)測蛋白分子量為42 kDa,等電點為5.52。(2) 通過蛋白序列的同源性分析,Amphip38與其他物種的p38蛋白氨基酸序列有較高的相似性(80.5%-84%)和一致性(67.2%-72.5%)。Amphip38與脊椎動物鱸魚(Dicentrarchus labrax)的Mapkl4有最高一致性為72.5%。由此可以確認Amphip38是脊椎動物p38的同源基因。(3) 同源性分析可見p38蛋白在動物中較保守,通過p38蛋白一級結(jié)構(gòu)氨基酸序列的分析,在p38蛋白中STK結(jié)構(gòu)域是非常保守的。TGY模塊、CD模塊,ATP結(jié)合環(huán)(ATP binding loop)、ED位點、底物結(jié)合位點(substrate binding site),這些保守的位點對p38蛋白行使功能有重要的作用。我們進一步預(yù)測了p38蛋白的三級結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)Amphip38與其他物種的p38蛋白結(jié)構(gòu)非常相似,呈馬鞍形狀,蛋白表面有一個重要的凹槽,凹槽中有p38蛋白重要的結(jié)構(gòu)-“磷酸化唇”,TGY motif就在這個區(qū)域,是p38的激活位點。Docking site, CD site, ED site在Amphip38蛋白空間結(jié)構(gòu)中都位于蛋白三維結(jié)構(gòu)表面,這可能與p38蛋白與底物的結(jié)合有關(guān)。(4) 將白氏文昌魚Amphip38蛋白和其他物種p38蛋白進行比對并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹,結(jié)果表明:白氏文昌魚Amphip38基因的進化地位位于無脊椎動物與脊椎動物之間,與脊椎動物更為親近。另外,p38家族在從無脊椎動物到脊椎動物進化過程中可能發(fā)生了基因重復(fù)或分化,導致生成了四個亞型(p38α、p38β、 p38γ和p38δ)。(5)利用實時熒光定量PCR檢測發(fā)現(xiàn),Amphip38在五個組織中都廣泛表達,但表達量有差異:Amphip38在脊索與肌肉中表達量豐富,在肝盲囊表達量適中,在腸與鰓中較低。在脊索和肌肉中的高表達量可能與p38的組織特異性功能有關(guān),在肌肉和脊索中可能主要參與細胞的增值、分化的調(diào)控,由于肝盲囊是脊椎動物肝臟的前體組織,在肝盲囊中較高的表達可能與文昌魚的免疫炎癥反應(yīng)有關(guān)。(6) 采用實時熒光定量PCR檢測LPS刺激后在不同時間點(2 h,4 h,6 h,8 h,12 h,24 h)文昌魚Amphip38基因的表達量變化,在4h和6h出現(xiàn)了顯著升高,并且在6h上升到最高。此變化初步證明了白氏文昌魚Amphip38基因參與先天免疫應(yīng)答。(7) 利用western blot技術(shù)檢測LPS注射后0.5h和lh,p38蛋白的磷酸化水平明顯增多,而在注射后的3h和6h下降。在蛋白水平上進一步證實了Amphip38蛋白與哺乳動物p38蛋白有相同的功能機制,通過磷酸化激活參與文昌魚的先天免疫應(yīng)答?傊,我們首次克隆了Amphip38基因并研究分析了Amphip38蛋白的結(jié)構(gòu)與功能。我們的結(jié)果表明,Amphip38在白氏文昌魚中參與先天免疫應(yīng)激反應(yīng)的調(diào)節(jié)。Amphip38基因是脊椎動物的祖先基因。我們當前的研究可為先天免疫機制的研究以及p38家族的進化提供有價值的信息。
【學位授予單位】:南京師范大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:S917.4
【圖文】:
圖1.1文昌魚的解剖圖逡逑Figure邋1.1邋Dissectio打邋of邋amphioxus逡逑
圖1.2邋MAPK激酶級聯(lián)反應(yīng)信號傳導逡逑Figure邋1.2邋MARK邋signal邋transduction邋pathway逡逑1.2.3邋p3邋8研究近況逡逑相比于其他MAPKs,邋p38a沒有檢測到核定位信號。在沒有刺激的細胞中,逡逑在細胞核和細胞質(zhì)中都可W檢測到p38a[i6]。一些證據(jù)表明,激活后,p38a從細逡逑胞質(zhì)轉(zhuǎn)移到核,但是,送樣通過刺激的亞細胞定位是有爭議的,也有證據(jù)表明,逡逑在響應(yīng)特定的刺激中p38a優(yōu)先在細胞質(zhì)積累口2]。這種差異可能是由于不同的逡逑p38a分子位于不同亞細胞的隔間及綁定不同的合作伙伴,例如易位激活的逡逑p38a從細胞質(zhì)易位到細胞核歸因于在核出口與底物MK2z1合[氣最近的一項研逡逑究認為p38a核易位可能與G2邋/邋M細胞周期調(diào)控的逮捕和促進DNA修復(fù)有關(guān)。逡逑因為激活的p38a易位到細胞核誘導了邋DNA雙螺旋的削弱,但沒有其他刺激P2]。逡逑這樣的易位不需要p38a的催化活性,由Thrl80和Tyrl82x鎪嶧緯傻墓瓜蟮膩義媳浠,因为7w常稿澹岬膞鎪嶧嵌裕模危了鶘說姆從,而不蕷J攵云淥碳ぃ俳義蝦嘶郟乇鶚牽模危了鶘艘鸕,7w常福岷艘孜灰彩嗆俠淼模虼搜≡裥院嗽隋義
本文編號:2796846
【學位授予單位】:南京師范大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:S917.4
【圖文】:
圖1.1文昌魚的解剖圖逡逑Figure邋1.1邋Dissectio打邋of邋amphioxus逡逑
圖1.2邋MAPK激酶級聯(lián)反應(yīng)信號傳導逡逑Figure邋1.2邋MARK邋signal邋transduction邋pathway逡逑1.2.3邋p3邋8研究近況逡逑相比于其他MAPKs,邋p38a沒有檢測到核定位信號。在沒有刺激的細胞中,逡逑在細胞核和細胞質(zhì)中都可W檢測到p38a[i6]。一些證據(jù)表明,激活后,p38a從細逡逑胞質(zhì)轉(zhuǎn)移到核,但是,送樣通過刺激的亞細胞定位是有爭議的,也有證據(jù)表明,逡逑在響應(yīng)特定的刺激中p38a優(yōu)先在細胞質(zhì)積累口2]。這種差異可能是由于不同的逡逑p38a分子位于不同亞細胞的隔間及綁定不同的合作伙伴,例如易位激活的逡逑p38a從細胞質(zhì)易位到細胞核歸因于在核出口與底物MK2z1合[氣最近的一項研逡逑究認為p38a核易位可能與G2邋/邋M細胞周期調(diào)控的逮捕和促進DNA修復(fù)有關(guān)。逡逑因為激活的p38a易位到細胞核誘導了邋DNA雙螺旋的削弱,但沒有其他刺激P2]。逡逑這樣的易位不需要p38a的催化活性,由Thrl80和Tyrl82x鎪嶧緯傻墓瓜蟮膩義媳浠,因为7w常稿澹岬膞鎪嶧嵌裕模危了鶘說姆從,而不蕷J攵云淥碳ぃ俳義蝦嘶郟乇鶚牽模危了鶘艘鸕,7w常福岷艘孜灰彩嗆俠淼模虼搜≡裥院嗽隋義
本文編號:2796846
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