【摘要】：東方墨頭魚(Garra orientalis)屬鯉形目(Cypriniformes),鯉科(Cyprinidae),野鯪亞科(Labeoninae),墨頭魚屬(Garra)。東方墨頭魚廣泛分布于我國南方珠江、閩江、九龍江、韓江、元江、海南島等水系。紋唇魚(Osteochilus salsburyi)屬鯉形目(Cypriniformes),鯉科(Cyprinidae),野鯪亞科(Labeoninae),紋唇魚屬(Osteochilus)。紋唇魚分布于珠江、閩江、九龍江、元江等水系及海南島,國外見于越南。本研究采用核基因分子標(biāo)記(S7和Rag2)對八個東方墨頭魚種群和十二個紋唇魚種群進行親緣地理關(guān)系及種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究。結(jié)果如下:1.設(shè)計適用于擴增東方墨頭魚和紋唇魚S7和Rag2基因的引物,獲得墨頭魚8個種群的S7和Rag2序列各103條,其中S7片段長度為635 bp,Rag2片段長度為990 bp;獲得紋唇魚12個種群的S7和Rag2基因各213條,其中S7片段長度為762 bp,Rag2片段長度為814 bp。2.對S7和Rag2進行序列差異分析,將S7和Rag2的堿基組成進行了對比,墨頭魚S7基因包含27個變異位點,總變異率為4.25%,其中簡約信息位點26個,占比4.09%;墨頭魚Rag2基因包含34個變異位點,總變異率為3.43%,其中簡約信息位點20個,占比2.02%。紋唇魚S7基因包含37個變異位點,總變異率為4.86%,其中簡約信息位點36個,占比4.72%;紋唇魚Rag2基因包含15個變異位點,總變異率為1.84%,其中簡約信息位點10個,占比1.23%。顯示S7比Rag2擁有更高的變異率,東方墨頭魚的S7加Rag2比紋唇魚擁有更高的總變異率。3.對東方墨頭魚和紋唇魚進行遺傳多樣性分析,東方墨頭魚的單倍型多樣性范圍為0.2222~1.0000,平均單倍型多樣性為0.95793;核苷酸多樣性范圍從0.000684到0.006051,平均核苷酸多樣性為0.006256。紋唇魚單倍型多樣性范圍為0.9670~1.0000,平均單倍型多樣性為0.99889;核苷酸多樣性范圍為0.004096到0.007369,平均核苷酸多樣性為0.006835。東方墨頭魚和紋唇魚均具有高單倍型多樣性和低核苷酸多樣性。4.親緣地理關(guān)系分析。我們用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,顯示八個種群的東方墨頭魚樣本分為兩支a,b,其中b包含三個分支b1、b2、b3。a主要包括建甌(jo)金秀(jx),華安(ha),河源(hy)和春溪(cx)五個種群,b1包含瓊海(qh)、白沙(bs)、河源(hy)和春溪(cx)種群的少數(shù)個體。b2包含瓊海(qh)和白沙(bs)種群的絕大部分個體。b3包括樂東(ld)種群的所有個體,瓊海(qh)和白沙(bs)種群的部分個體。單倍型網(wǎng)絡(luò)圖將其樣本分為三支,東方墨頭魚在以鄰接法建立的系統(tǒng)發(fā)育樹和單倍型網(wǎng)絡(luò)圖中均表現(xiàn)出了明顯的地理種群相關(guān)的聚類現(xiàn)象。用鄰接法構(gòu)建的十二個種群的紋唇魚樣本的系統(tǒng)發(fā)育樹分可以分為六支,分別命名為a,b,c、d、e、f。a主要包括樂東(ld),饒平(rp),信宜(xy)三個種群的大部分個體和河源(hy),華安(ha),揭西(jh),四會(sh),海豐(hf),春溪(cx),金秀(jx)七個種群的部分個體,b主要由瓊海(qh),春溪(cx),揭西(jh),海豐(hf)四個種群的個體組成,也包含白沙(bs),樂東(ld),華安(ha),金秀(jx)四個種群的部分個體。c由瓊海(qh),白沙(bs),樂東(ld),春溪(cx)4個種群的少部分個體組成。d主要包括瓊海(qh),白沙(bs),樂東(ld)三個種群的部分個體。e由瓊海(qh),白沙(bs),華安(ha),金秀(jx)的少部分個體組成。f主要包含白沙(bs),樂東(ld),華安(ha),河源(hy),四會(sh),海豐(hf)6個種群的部分個體,紋唇魚的單倍型網(wǎng)絡(luò)圖顯示的結(jié)構(gòu)與nj樹基本一致。nj樹和網(wǎng)絡(luò)圖均顯示紋唇魚的十二個種群也出現(xiàn)了一定程度上的聚類現(xiàn)象,但不如東方墨頭魚顯著。5.遺傳分化和種群遺傳結(jié)構(gòu)分析。東方墨頭魚種群的遺傳分化指數(shù)(fst)為-0.049到0.7376之間,遺傳分化指數(shù)較高;各種群間的遺傳距離范圍為0.001~0.010,有一個較大的變化區(qū)間。amova和samova分析結(jié)果顯示,東方墨頭魚種群可以分為三個組群,組間的變異為43.18%,種群內(nèi)部的變異為52.54%。紋唇魚fst值的范圍在0.01470到0.33744之間,遺傳分化指數(shù)較低;各種群間的遺傳距離范圍為0.005~0.008,處于比較平均的狀態(tài),變化區(qū)間小。amova和samova分析結(jié)果顯示,紋唇魚種群可以分為五個組群,組間的變異為10.43%,種群內(nèi)部的變異為83.85%。6.種群歷史動態(tài)分析。用中性檢驗(tajima’sd和fu’sfs檢驗)和單核苷酸錯配分布(mismatchdistribution)來檢測東方墨頭魚和紋唇魚的種群是否發(fā)生過擴張。結(jié)果顯示東方墨頭魚中的瓊海(qh)、白沙(bs)、河源(hy)和春溪(cx)四個種群可能在近期歷史上發(fā)生過擴張。紋唇魚的大部分種群可能在近期歷史上發(fā)生過擴張。此前針對華南地區(qū)的初級淡水魚類進行親緣地理研究主要采用線粒體基因。本研究采用純核基因分子標(biāo)記對該區(qū)域同域分布的兩種初級淡水魚的種群遺傳結(jié)構(gòu)進行了分析和比較,進一步了解了此區(qū)淡水魚類的遺傳分化與地理分布的相關(guān)性。同時也是對以往研究的有益補充。
【學(xué)位授予單位】：上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S917.4
【圖文】：

a東方墨頭魚Fig.1-1aGarraorientalis

圖 1-1b 紋唇魚Fig. 1-1b Osteochilus salsburyi現(xiàn)狀，關(guān)于東方墨頭魚的生物學(xué)研究資料較少[1~3,4~7]。田輝伍等[8]研究頭魚的年齡結(jié)構(gòu)與生長特性。他們通過耳石輪紋對 136 尾東方墨頭進行估算，發(fā)現(xiàn)怒江東方墨頭魚總共包含了 10 個年齡組；繪制的體速度曲線顯示：東方墨頭魚的體長生長速度與年齡成反比，隨著年

圖 2-1 8 個東方墨頭魚和 12 個紋唇魚種群采樣點Fig2-1 8 sampling sites of G. orientalis and 12 sampling sites of O. salsburyi表 2-1-a 東方墨頭魚的樣本信息Table 2-1-a Sampling information of G. orientalis in this study地理種群 經(jīng)緯度 所屬水系 樣本量Population coordinates River system Sample size金秀（JX） E110°18′N24°14′ 珠江西江 19建甌（JO） E118°31′N26°98′ 閩江 9瓊海（QH） E110°41′ N19°23′ 萬泉河 13白沙（BS） E109°45′ N19°22′ 南渡江 16樂東（LD） E108°96′ N18°98′ 昌化江 11華安（HA） E117°52′ N24°99′ 九龍江 15河源（HY） E114°69′ N23°74′ 珠江東江 8春溪（CX） E111°77′ N22°17′ 漠陽江 12

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本文編號：2779936