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牙鲆家系數(shù)量遺傳分析及變態(tài)期偏轉(zhuǎn)方向的QTL定位

發(fā)布時(shí)間:2020-07-13 13:56
【摘要】:牙鲆是我國(guó)重要的海水養(yǎng)殖魚類,廣泛分布于我國(guó)沿海地區(qū),為廣大養(yǎng)殖戶帶來(lái)了巨大的經(jīng)濟(jì)效益。對(duì)牙鲆進(jìn)行遺傳改良有助于實(shí)現(xiàn)牙鲆種質(zhì)資源的優(yōu)化和保護(hù),推動(dòng)牙鲆養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展。本研究中,分析了幼魚期和成魚期牙鲆多形態(tài)性狀與體質(zhì)量的關(guān)系,對(duì)牙鲆不同發(fā)育時(shí)期的生長(zhǎng)性狀進(jìn)行數(shù)量遺傳分析,另外還對(duì)牙鲆變態(tài)時(shí)期的偏轉(zhuǎn)相關(guān)QTL進(jìn)行了初級(jí)定位和精細(xì)定位,取得了如下研究結(jié)果:1.統(tǒng)計(jì)牙鲆在8月齡與14月齡的22個(gè)形態(tài)性狀和體質(zhì)量(Y),包括全長(zhǎng)(X1)、體長(zhǎng)(X2)、尾鰭長(zhǎng)(X3)、體寬(X4)、體厚(X5)、頭長(zhǎng)(X6)、吻長(zhǎng)(X7)、口斜裂長(zhǎng)(X8)、尾柄長(zhǎng)(X9)、背鰭起點(diǎn)到胸鰭基部的直線距離(X10)、背鰭起點(diǎn)到臀鰭起點(diǎn)的直線距離(X11)、背鰭起點(diǎn)到背鰭終點(diǎn)的直線距離(X12)、背鰭起點(diǎn)到臀鰭終點(diǎn)的直線距離(X13)、背鰭終點(diǎn)到臀鰭終點(diǎn)的直線距離(X14)、胸鰭基部到背鰭終點(diǎn)的直線距離(X15)、臀鰭起點(diǎn)到臀鰭終點(diǎn)的直線距離(X16)、腹鰭基部到背鰭起點(diǎn)的直線距離(X17)、腹鰭基部到背鰭終點(diǎn)的直線距離(X18)、腹鰭基部到臀鰭起點(diǎn)的直線距離(X19)、腹鰭基部到臀鰭終點(diǎn)的直線距離(X20)、眼間距(X21)以及眼徑(X22)。對(duì)各形態(tài)性狀與體質(zhì)量進(jìn)行相關(guān)分析,篩選出與體質(zhì)量高度相關(guān)的形態(tài)性狀,通過(guò)回歸分析研究形態(tài)性狀與體質(zhì)量的直接與間接通徑系數(shù),建立不同生長(zhǎng)時(shí)期牙鲆主要形態(tài)性狀對(duì)體質(zhì)量的多元回歸方程,方程分別為:Y=-119.541+7.191 X18+10.135 X4+7.197 X11(8月齡);Y=-484.931+31.959 X18+81.928 X14-17.889 X9(14月齡)。結(jié)果表明,不同發(fā)育階段影響體質(zhì)量的主要形態(tài)性狀不同,篩選出X18在兩個(gè)發(fā)育階段中均進(jìn)入回歸方程。通過(guò)對(duì)兩個(gè)階段的主要形態(tài)性狀與體質(zhì)量進(jìn)行模型擬合,發(fā)現(xiàn)8月齡階段的最優(yōu)擬合模型均為線性模型,模型等式分別為:Y=-117.866+15.724 X18;Y=-94.579+24.763 X4;Y=-100.602+33.184 X11;而14月齡階段的最優(yōu)擬合模型均為冪函數(shù)模型,模型等式分別為:Y=0.036X183.063;Y=0.095X142.587;Y=62.249X91.584。本次研究表明,在牙鲆的不同生長(zhǎng)時(shí)期,影響體質(zhì)量的主要形態(tài)性狀存在一些差別,兩個(gè)生長(zhǎng)時(shí)期適用的最優(yōu)擬合模型也不同,這為牙鲆不同時(shí)期的選擇育種工作提供了理論指導(dǎo)。2.通過(guò)對(duì)93日齡、141日齡和203日齡牙鲆的全長(zhǎng)、體寬和體質(zhì)量數(shù)據(jù)進(jìn)行非條件遺傳分析與條件遺傳分析,研究加性效應(yīng)、顯性效應(yīng)、加性與環(huán)境互作效應(yīng)、顯性與環(huán)境互作效應(yīng)在不同發(fā)育階段的作用效果,以及相關(guān)基因的作用規(guī)律。結(jié)果表明:在早期發(fā)育階段和后期發(fā)育階段,環(huán)境效應(yīng)對(duì)牙鲆經(jīng)濟(jì)性狀的影響較大。條件加性方差在203日齡皆下降至0,說(shuō)明在該發(fā)育階段加性效應(yīng)相關(guān)基因關(guān)閉表達(dá)。三個(gè)性狀在三個(gè)監(jiān)測(cè)點(diǎn)均未表現(xiàn)出明顯的雜種優(yōu)勢(shì)。在牙鲆個(gè)體發(fā)育的后期,體長(zhǎng)的增長(zhǎng)與體寬、體質(zhì)量的增長(zhǎng)并不同步,這可能是由于發(fā)育后期體長(zhǎng)達(dá)到一定規(guī)格,生長(zhǎng)速度逐漸減慢,而此時(shí)體寬的增長(zhǎng)對(duì)體質(zhì)量的影響較大,與上一部分中通徑分析結(jié)果相符合。研究結(jié)果表明,常規(guī)檢測(cè)的三個(gè)時(shí)段間隔過(guò)長(zhǎng),因而不能確定檢測(cè)間隔期相關(guān)基因的作用方向是否發(fā)生變化,需要縮短檢測(cè)間隔進(jìn)行深入研究。3.對(duì)牙鲆變態(tài)過(guò)程中,眼睛偏轉(zhuǎn)方向不同(左偏和右偏)的現(xiàn)象進(jìn)行初級(jí)和精細(xì)QTL定位。成功構(gòu)建24個(gè)連鎖群,與牙鲆的染色體數(shù)相符,標(biāo)記覆蓋率達(dá)到了64%。通過(guò)初級(jí)定位發(fā)現(xiàn),1號(hào)連鎖群中的標(biāo)記與數(shù)量性狀基因座表現(xiàn)出極顯著相關(guān),得到22c M的QTL區(qū)間。通過(guò)對(duì)1號(hào)連鎖群中的標(biāo)記進(jìn)行加密,重新構(gòu)建1號(hào)連鎖群整合圖譜、雌性圖譜和雄性圖譜。整合圖譜共42個(gè)標(biāo)記連鎖,覆蓋率達(dá)到95.4%,總長(zhǎng)度為55.3c M;雌性圖譜共37個(gè)標(biāo)記連鎖,覆蓋率達(dá)到94.7%,總長(zhǎng)度為59.2c M;雄性圖譜共28個(gè)標(biāo)記連鎖,覆蓋率達(dá)到93.1%,總長(zhǎng)度為59.2c M。使用整合圖譜進(jìn)行精細(xì)定位后得到四個(gè)QTL區(qū)間,長(zhǎng)度依次為0.9c M、2.6c M、0.2c M、0.3c M;使用雌性圖譜得到兩個(gè)QTL區(qū)間,長(zhǎng)度均為1.8c M;使用雄性圖譜得到兩個(gè)QTL區(qū)間,長(zhǎng)度依次為0.2c M和2.7c M。研究結(jié)果為進(jìn)一步探索牙鲆變態(tài)過(guò)程中眼睛移動(dòng)的機(jī)理和相關(guān)基因提供了參考區(qū)間。
【學(xué)位授予單位】:上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S917.4
【圖文】:

方差分量,體寬,體質(zhì)量,分量


圖 3-1.全長(zhǎng)、體寬和體質(zhì)量的非條件方差分量Fig.3-1. Unconditional variance components for total length, body width and body weight.注:VA 表示加性方差分量;VD 表示顯性方差分量;VAE 表示加性與環(huán)境互作方差分量;VDE 表示顯性與環(huán)境互作方差分量Notes: VA is additive variance component, VD is dominant variance component, VAE is additive-environmental interaction variance component, VDE isdominant-environmental interaction variance component.

方差分量,體寬,體質(zhì)量,分量


圖 3-2.全長(zhǎng)、體寬和體質(zhì)量的條件方差分量Fig. 3-2. Conditional variance components for total length, body width and body weight.注:VA(t/k)表示條件加性方差分量;VD(t/k)表示條件顯性方差分量;VAE(t/k)表示條件加性與環(huán)境互作方差分量;VDE(t/k)表示條件顯性與環(huán)境互作方差分量。Notes: VA(t/k) is conditional additive variance component, VD(t/k) is conditional dominant variance component, VAE(t/k) is conditional

眼睛,牙鲆,身體


眼睛在身體左側(cè)的牙鲆(正常)

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前9條

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相關(guān)碩士學(xué)位論文 前1條

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本文編號(hào):2753553

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