fus在斑馬魚生長發(fā)育中的功能研究
發(fā)布時間:2020-07-09 22:15
【摘要】:隨著生物基礎研究的深入,對基因的功能探究一向是生命科學研究的重要課題之一,不單單是在了解生物發(fā)育的現象上具有重要的理論意義,也會影響到生產實踐的應用。脂肪肉瘤轉運/肉瘤融合蛋白(Fus)是一種參與轉錄調控與前體mRNA剪切的一種RNA結合蛋白。據先前的實驗報道,在哺乳動物中突變FUS會導致神經退行性疾病,包括肌肉萎縮性脊髓側索硬化癥(amyotrophic lateral sclerosis,ALS)。然而,關于fus的功能在魚類中的報道卻很少。本研究中,我們以斑馬魚(Danio rerio)作為模式生物,探究fus在魚類中的功能。斑馬魚fus定位于第3號染色體上,由14059 bp個堿基組成,cDNA長度為1626 bp,共編碼541個氨基酸,其編碼序列包含RNA超家族識別結構域(RRM superfamily)和鋅指家族與包含鋅指區(qū)的RNA結合蛋白結構(ZnF_-RBZ)的兩個結構域;谠摶虻墓δ芙Y構域,我們選取基因組上盡量靠近翻譯起始密碼子的合適的靶位點,利用近年來廣泛使用的CRISPR/Cas9技術在斑馬魚中對fus產生可遺傳的等位基因移碼突變,通過子代雜交的方式獲得純合的fus突變體。研究結果發(fā)現,在斑馬魚幼魚與成魚軀體的發(fā)育過程中,通過測量fus~(-/-)純合突變體與對照組的體長與體重,相對于對照組(wide type,WT)野生型斑馬魚來看,發(fā)現突變體斑馬魚的體長與體重均有顯著減小,但身體發(fā)育卻無明顯異常并且完全可育。除此之外,在野生型斑馬魚中常見的雌魚身體比例大于雄魚的性別異形現象在fus~(-/-)純合突變體中被消除了。進一步研究生長發(fā)育信號通路中較為關鍵的幾種生長相關基因,發(fā)現gh1,ghra,igf1,igf2a,stat5.1和socs6基因的表達水平在突變體斑馬魚的早期幼魚發(fā)育階段顯著低于野生型斑馬魚。然而,相對于WT,在fus~(-/-)純合突變體斑馬魚中,其運動能力并未受到影響。本研究表明,不同于它在哺乳動物中的功能,fus在斑馬魚中與運動神經元的發(fā)育不相關但在調節(jié)魚類軀體生長發(fā)育與兩性生長異形方面有著不同的功能。
【學位授予單位】:華中農業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S917.4
【圖文】:
華中農業(yè)大學 2018 屆碩士研究生學位論文蛋白與 mRNA 通過有限的模式化的 RNA 結合結構域(RBDs)相構的不同排列呈現的這些 RBD 的多個拷貝來擴增底物的結構多蛋白質的功能。其中包括 RNA 識別結構域(RRM),異質核 RKH),鋅指結構域(Znf)等等(Lunde et al 2007)。常見的 RNA別 RNA 如圖 1-1(Fig.1-1)所示。
30圖 3-1 斑馬魚 fus 的時空表達(A)斑馬魚胚胎發(fā)育各時期 fus 的表達;(B)斑馬魚各組織 fus 的表達Fig. 3-1 Space-time expression of zebrafish fus(A) Expression of fus during embryonic development; (B) Diffferent tissue expression of zebrafish fus3.3 斑馬魚 fus CRISPR/Cas9 系統(tǒng)構建3.3.1 斑馬魚 fus CRISPR/Cas9 敲除靶位點的設計根據 Ensembl 中斑馬魚 fus 的信息(ENSDARG00000037968),本試驗選擇斑馬魚最完整的轉錄本來作為 CDS 序列通過 CRISPR/Cas9 進行靶位點的篩選。依照CRISPR/Cas9 基 因 靶 位 點 的 設 計 原 則 , 選 擇 靶 位 點 的 序 列 為 :
fus 在斑馬魚生長發(fā)育中的功能研究ATGGAGGACAGTC。將選取的靶位點在 Ensembl 數據庫與斑馬,顯示靶位點位于斑馬魚 3 號染色體 fus 上(圖 3-2A 和圖 3-2B組上特異性較高。選取的靶位點在 CDS 序列上對應的位置為 4應在第 14-21 個氨基酸上,位于 RRM 結構域與鋅指結構域之前as9 基因敲除靶位點設計的基本要求。A
本文編號:2748052
【學位授予單位】:華中農業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S917.4
【圖文】:
華中農業(yè)大學 2018 屆碩士研究生學位論文蛋白與 mRNA 通過有限的模式化的 RNA 結合結構域(RBDs)相構的不同排列呈現的這些 RBD 的多個拷貝來擴增底物的結構多蛋白質的功能。其中包括 RNA 識別結構域(RRM),異質核 RKH),鋅指結構域(Znf)等等(Lunde et al 2007)。常見的 RNA別 RNA 如圖 1-1(Fig.1-1)所示。
30圖 3-1 斑馬魚 fus 的時空表達(A)斑馬魚胚胎發(fā)育各時期 fus 的表達;(B)斑馬魚各組織 fus 的表達Fig. 3-1 Space-time expression of zebrafish fus(A) Expression of fus during embryonic development; (B) Diffferent tissue expression of zebrafish fus3.3 斑馬魚 fus CRISPR/Cas9 系統(tǒng)構建3.3.1 斑馬魚 fus CRISPR/Cas9 敲除靶位點的設計根據 Ensembl 中斑馬魚 fus 的信息(ENSDARG00000037968),本試驗選擇斑馬魚最完整的轉錄本來作為 CDS 序列通過 CRISPR/Cas9 進行靶位點的篩選。依照CRISPR/Cas9 基 因 靶 位 點 的 設 計 原 則 , 選 擇 靶 位 點 的 序 列 為 :
fus 在斑馬魚生長發(fā)育中的功能研究ATGGAGGACAGTC。將選取的靶位點在 Ensembl 數據庫與斑馬,顯示靶位點位于斑馬魚 3 號染色體 fus 上(圖 3-2A 和圖 3-2B組上特異性較高。選取的靶位點在 CDS 序列上對應的位置為 4應在第 14-21 個氨基酸上,位于 RRM 結構域與鋅指結構域之前as9 基因敲除靶位點設計的基本要求。A
【參考文獻】
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1 梅潔;桂建芳;;魚類性別異形和性別決定的遺傳基礎及其生物技術操控[J];中國科學:生命科學;2014年12期
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本文編號:2748052
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