【摘要】：未折疊蛋白反應(yīng)(unfolded protein reaction,UPR),是內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫下細(xì)胞生存所需的一組通路,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激發(fā)生后,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白未充分折疊或者錯(cuò)誤折疊,或者未折疊蛋白發(fā)生聚集時(shí),可激活未折疊蛋白反應(yīng)(unfolded protein reaction,UPR),啟動(dòng)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑。內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi)腔中的未折疊蛋白積累時(shí),UPR通過(guò)增加細(xì)胞蛋白質(zhì)折疊和降解能力,或降低蛋白質(zhì)合成速率來(lái)維持細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)。由于其在細(xì)胞脅迫應(yīng)答和蛋白質(zhì)折疊過(guò)程中的重要性,UPR信號(hào)通路得到了越來(lái)越多的關(guān)注,其組成和多功能調(diào)節(jié)作用在哺乳動(dòng)物,果蠅,線蟲和酵母等中已經(jīng)得到了很好的闡釋。軟體動(dòng)物(含貝類)廣泛分布在多種環(huán)境下,具有較高的物種多樣性,并在不同的脅迫下展現(xiàn)出非凡的適應(yīng)和存活能力。因此研究軟體動(dòng)物UPR在響應(yīng)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫下維持內(nèi)穩(wěn)態(tài)的機(jī)制,對(duì)于理解軟體動(dòng)物的廣泛分布,生活習(xí)性,環(huán)境適應(yīng)性具有極其重要的意義。本研究以軟體動(dòng)物中的典型生物長(zhǎng)牡蠣為研究對(duì)象,通過(guò)深入挖掘和比較6,12,24小時(shí)熱脅迫刺激后牡蠣血淋巴細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),重點(diǎn)解析長(zhǎng)牡蠣UPR參與熱脅迫響應(yīng)的具體作用機(jī)制,包括(1)揭示了長(zhǎng)牡蠣UPR通路的組成及其在不同熱刺激處理時(shí)間后的響應(yīng)模式,從不同時(shí)長(zhǎng)熱脅迫處理的角度看,UPR通路總體上呈現(xiàn)出積極的響應(yīng)。通過(guò)對(duì)不同時(shí)長(zhǎng)熱脅迫后的共表達(dá)基因分析表明,PERK支路響應(yīng)最為迅速;同時(shí)發(fā)現(xiàn)相較于PERK支路,IRE1和ATF6支路的元件表達(dá)情況更為復(fù)雜,機(jī)體傾向于通過(guò)IRE1支路恢復(fù)細(xì)胞的活力;(2)探究了長(zhǎng)牡蠣重要免疫通路及其與UPR通路的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系。通過(guò)在Kappa矩陣的基礎(chǔ)上構(gòu)建共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)在熱刺激后的長(zhǎng)牡蠣中,與UPR關(guān)系最密切的是MAPK通路。本研究將有助于更好地理解熱脅迫下軟體動(dòng)物中UPR的調(diào)控機(jī)制,并且為研究特定UPR通路及其與機(jī)體免疫應(yīng)答之間的關(guān)系提供了參考,豐富了軟體動(dòng)物應(yīng)答環(huán)境脅迫響應(yīng)的相關(guān)內(nèi)容。
【學(xué)位授予單位】：大連海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號(hào)】：S917.4
【圖文】：

珠富集采用 SOLiD EZ BeadTM體系 (Life Technologies)模板磁珠的質(zhì)量，以及密度。每個(gè)樣本大約含 120，000，上。采用 SOLiD4 平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序，并且輸出相應(yīng)的顏色長(zhǎng)文件序列號(hào)為：SRP034885。LifeScopeTM軟件用于讀長(zhǎng)和空白對(duì)照組之間差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄本的識(shí)別 (DTs)。錯(cuò)誤發(fā)倍數(shù) ≥ 1 用于確定顯著差異表達(dá)基因 DEGs[9, 93]。還在基化因子; Dusp19, 雙特異性蛋白磷酸酶 19; PDIA6, 蛋菌的 IAP 重復(fù)含蛋白 7-A; HSP20, 應(yīng)激蛋白 1; GRP78, 7AT, 犬尿氨酸/α-氨基乙二酸轉(zhuǎn)氨酶; SMCT1, 偶聯(lián)單羧酸酶;ECE1, 內(nèi)皮素轉(zhuǎn)換酶 1）上進(jìn)行了 qRT-PCR(實(shí)時(shí)熒

圖 3-1 a) 熱處理 B_6H 比較組中與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白質(zhì)處理過(guò)程共表達(dá)的免疫通路Figure 3-1 a) Immunity pathways that co-expressed with ER protein processing in B_6H heat treatmentcomparison group

圖 3-1 a) 熱處理 B_6H 比較組中與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白質(zhì)處理過(guò)程共表達(dá)的免疫通路Figure 3-1 a) Immunity pathways that co-expressed with ER protein processing in B_6H heat treatmentcomparison group

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 Caroline B A;;研究揭示章魚的進(jìn)化[J];生物技術(shù)進(jìn)展;2015年05期

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1 程功;Docker生物云計(jì)算平臺(tái)分析松材線蟲高通量測(cè)序數(shù)據(jù)的應(yīng)用研究[D];東北林業(yè)大學(xué);2015年

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1 劉欣;基于日本沼蝦轉(zhuǎn)錄組的免疫基因發(fā)掘[D];河北大學(xué);2016年

2 石浩然;基于二代測(cè)序的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析方法的比較研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

本文編號(hào)：2747620