【摘要】：中國對(duì)蝦亦稱中國明對(duì)蝦(Fenneropenaeus chinensis),由于其適應(yīng)能力強(qiáng)、生長速度快、耐低溫、品質(zhì)好等優(yōu)點(diǎn),曾是我國重要的漁業(yè)資源之一。1987年-1992年是中國對(duì)蝦養(yǎng)殖的鼎盛時(shí)期,最高年產(chǎn)量曾達(dá)到20萬噸。然而,高速發(fā)展的中國對(duì)蝦養(yǎng)殖業(yè)遇到諸多問題的挑戰(zhàn),尤其是1993年以后白斑綜合癥病毒(White Spot Syndrome Virus,WSSV)的出現(xiàn),對(duì)中國對(duì)蝦的養(yǎng)殖造成嚴(yán)重?fù)p失。從1996年開始實(shí)施的中國對(duì)蝦良種選育計(jì)劃,旨在培育生長快、抗病能力強(qiáng)的養(yǎng)殖新品種,被視為有望解決對(duì)蝦養(yǎng)殖病害困擾的有效途徑之一。本文以累代選育10代的中國對(duì)蝦“黃海2號(hào)”選育群體和捕自朝鮮半島西海岸的野生群體為材料,采用微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù),對(duì)中國對(duì)蝦抗WSSV性狀的遺傳參數(shù)進(jìn)行估計(jì),并對(duì)累代選育10代的選育群體進(jìn)行遺傳多樣性分析,以期為進(jìn)一步的選育工作提供理論支持和技術(shù)參數(shù)。遺傳多樣性是生物適應(yīng)環(huán)境和遺傳變異的關(guān)鍵指標(biāo)之一,高遺傳多樣性的群體也是進(jìn)行遺傳選育的基礎(chǔ)。累代人工選育是否會(huì)降低中國對(duì)蝦的遺傳多樣性,影響中國對(duì)蝦的選育效果,尚缺少實(shí)際檢測數(shù)據(jù)的支撐。因此,十分有必要對(duì)中國對(duì)蝦選育群體進(jìn)行遺傳多樣性分析,從而制定更加科學(xué)的育種計(jì)劃。中國對(duì)蝦遺傳參數(shù)估計(jì)中個(gè)體間親緣關(guān)系的確定主要還是利用人為記錄的物理系譜,然而微衛(wèi)星等分子標(biāo)記的發(fā)展為遺傳參數(shù)估計(jì)提供了新的思路。利用微衛(wèi)星等分子標(biāo)記對(duì)子代進(jìn)行基因分析,通過對(duì)基因型的分析確定研究個(gè)體間的分子相關(guān)度,從而確定個(gè)體間的親緣關(guān)系。本研究中,我們分別利用物理系譜和分子相關(guān)度的方法,估計(jì)中國對(duì)蝦抗WSSV感染存活性狀的遺傳力,并通過交叉驗(yàn)證的方法檢驗(yàn)分子相關(guān)度在估計(jì)中國對(duì)蝦遺傳力上的預(yù)測能力和準(zhǔn)確性,以期為中國對(duì)蝦遺傳參數(shù)的估計(jì)提供一種新的方法。本研究取得的主要結(jié)果如下:1.中國對(duì)蝦人工選育群體與野生群體遺傳多樣性的SSR分析利用微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)分析了中國對(duì)蝦野生群體(Wild Population,WP)和“黃海2號(hào)”第10代選育群體(Breeding Population,BP)的遺傳多樣性,以檢測累代人工選育對(duì)中國對(duì)蝦群體遺傳結(jié)構(gòu)的影響。結(jié)果顯示,15個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)共檢測到462個(gè)等位基因,微衛(wèi)星位點(diǎn)等位基因數(shù)(Na)和有效等位基因數(shù)(Ne)分別為3-44個(gè)和2-29個(gè),多態(tài)信息含量(PIC)為0.518-0.964。野生群體和選育群體的平均觀測雜合度分別為0.852和0.810,15個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因頻率在兩個(gè)群體發(fā)生了顯著的變化。通過計(jì)算P值確定位點(diǎn)Hardy-Weinberg平衡偏離情況,Fis結(jié)果顯示共有11個(gè)群體位點(diǎn)表現(xiàn)為雜合子過剩,Shannon指數(shù)(H)分別為2.786和2.399。兩群體的Nei’s無偏遺傳距離(uD)和無偏遺傳相似度(uI)分別為0.177和0.838,遺傳分化指數(shù)為0.017(P=0.001),表明群體發(fā)生了弱的遺傳分化。遺傳變異來源分析顯示,只有7.50%的變異來自于群體間,其余遺傳變異均來自于個(gè)體間。表明人工選育的中國對(duì)蝦“黃海2號(hào)”第10代群體具有高的遺傳多樣性,仍具有很大的選育潛力,可以繼續(xù)作為選育的材料。2.利用物理系譜估計(jì)中國對(duì)蝦“黃海2號(hào)”抗WSSV性狀的遺傳參數(shù)采用人工受精技術(shù),2015和2016年共構(gòu)建了181個(gè)中國對(duì)蝦“黃海2號(hào)”家系,本研究共采用4302尾個(gè)體。對(duì)培育的中國對(duì)蝦成蝦進(jìn)行抗WSSV感染測試,利用動(dòng)物模型和限制性最大似然法并結(jié)合11代物理系譜信息,估計(jì)中國對(duì)蝦抗WSSV感染存活性狀的遺傳力和遺傳進(jìn)展。結(jié)果顯示,中國對(duì)蝦“黃海2號(hào)”抗WSSV感染存活性狀的遺傳力為0.012±0.022,共同環(huán)境效應(yīng)為0.04±0.01;預(yù)測遺傳增量為0.036,預(yù)測遺傳進(jìn)展為0.017%,現(xiàn)實(shí)遺傳進(jìn)展增量為-137.84。本研究結(jié)果可為進(jìn)一步開展中國對(duì)蝦抗WSSV性狀遺傳選育提供參考。3.利用微衛(wèi)星標(biāo)記估計(jì)中國對(duì)蝦“黃海2號(hào)”抗WSSV性狀的遺傳力中國對(duì)蝦是中國重要的養(yǎng)殖品種,然而利用物理系譜估計(jì)中國對(duì)蝦的遺傳參數(shù)會(huì)有一些不足。本研究的目的是評(píng)價(jià)利用分子相關(guān)度的方法估計(jì)中國對(duì)蝦抗WSSV性狀遺傳力的可靠性。實(shí)驗(yàn)包含2015年構(gòu)建的31個(gè)家系和2016年構(gòu)建的36個(gè)家系,每個(gè)家系隨機(jī)取10尾對(duì)蝦,共670尾。利用15對(duì)經(jīng)熒光標(biāo)記的微衛(wèi)星引物分別對(duì)所有樣品進(jìn)行基因分型,利用限制性約束最大似然法并結(jié)合分子相關(guān)度和系譜相關(guān)度構(gòu)建加性遺傳矩陣,分別估計(jì)中國對(duì)蝦抗WSSV性狀的遺傳力,最后利用交叉驗(yàn)證的方法檢驗(yàn)物理系譜和分子相關(guān)度的預(yù)測能力和估計(jì)育種值的準(zhǔn)確性。結(jié)果顯示:分子相關(guān)度和系譜估計(jì)的親緣相關(guān)系數(shù)的皮爾遜相關(guān)度為0.412,根據(jù)相同的動(dòng)物模型和限制性最大似然法,利用分子相關(guān)度和系譜估計(jì)得到的中國對(duì)蝦抗WSSV性狀的遺傳力分別為0.064±0.048和0.050±0.044,兩者無顯著性差異。交叉驗(yàn)證結(jié)果顯示,分子相關(guān)度和系譜的預(yù)測能力分別為0.7277和0.7270,育種值估計(jì)的準(zhǔn)確度分別為0.8530和0.8526。研究結(jié)果表明利用微衛(wèi)星標(biāo)記估計(jì)中國對(duì)蝦的遺傳力是一種有效的方法。
【學(xué)位授予單位】：上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：S945.4

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2743556