【摘要】：中華烏塘済(Bostrychus sinensis)隸屬于脊椎動(dòng)物門(Vertebrata),輻鰭魚綱(Actinopterygii),鱸形目(Perciformes),塘氃科(Eleotridae),烏塘氃屬(Bostrychus)。本研究采用了三種分子標(biāo)記:微衛(wèi)星標(biāo)記(SSR)、線粒體DNA(mtDNA)基因序列、核基因RyR3序列檢測(cè)和分析了閩浙沿海6個(gè)地理群體共計(jì)534尾中華烏塘鱧樣本的雜交帶遺傳結(jié)構(gòu)及雜交漸滲情況。目前有多種因素可以促進(jìn)雜交帶形成并維持雜交帶的穩(wěn)定,如雜種的性質(zhì)、雜交帶的組成成分及其適應(yīng)性。因此研究雜交帶的遺傳結(jié)構(gòu)及漸滲現(xiàn)象對(duì)于理解雜交帶的適應(yīng)性具有重要意義。通過研究得到如下結(jié)論:1、在微衛(wèi)星數(shù)據(jù)(SSR)分析中,篩選了 15個(gè)高度多態(tài)的微衛(wèi)星座位,各個(gè)座位的等位基因數(shù)范圍為7～44,觀測(cè)雜合度(Ho)的范圍為0.1546～0.9600,期望雜合度(HE)的范圍為0.4357～0.9602,各微衛(wèi)星座位的多態(tài)信息含量(PIC)值為0.2780～0.9523,表明中華烏塘鱧種群具有較高的多態(tài)性水平。近交系數(shù)(Fis)為-0.3136～0.4487,除少數(shù)微衛(wèi)星座位Fis為負(fù)數(shù)外,多數(shù)座位的Fis均為正數(shù),表明在中華烏塘鱧群體中出現(xiàn)了雜合子缺失的現(xiàn)象。2、在本研究中,中華烏塘鱧Cytb基因序列長(zhǎng)度為1141bp,總共檢測(cè)到可變位點(diǎn)122個(gè),其中簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)79個(gè),并定義了122個(gè)單倍型。6個(gè)地理群體的單倍型指數(shù)在0.765～0.895之間,核苷酸多態(tài)性在0.00157～0.002102之間,出現(xiàn)了高單倍型多樣性(Hd)低核苷酸多樣性(π)的情況,其中玉環(huán)的遺傳多樣性最高,廈門的遺傳多樣性最低。在核基因RyR3的分析中,長(zhǎng)度為820bp的序列包含可變位點(diǎn)28個(gè),其中有26個(gè)簡(jiǎn)約信息位點(diǎn),單倍型多樣性在0.612～0.799之間。核苷酸多態(tài)性在0.00330～0.00612之間,與Cytb基因序列分析結(jié)果一致,也出現(xiàn)了高單倍型多樣性與低核苷酸多樣性的現(xiàn)象。3、由群體間遺傳距離矩陣構(gòu)建的NJ樹及Structure聚類分析表明,中華烏塘鱧可分為南北兩個(gè)譜系(N譜系和S譜系),遺傳距離與地理距離具有顯著的相關(guān)性。群體間遺傳分化(FST)程度處于中高水平,相鄰種群間的基因流(Nm)值較大、交流頻繁,而N譜系與S譜系之間基因流值較小,可能是與地理隔離因素和中華烏塘鱧特殊的生物特性有關(guān)。4、基于Cytb基因序列及RyR3構(gòu)建的單倍型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖顯示,中華烏塘鱧群體明顯分為南北兩支。Tajima'D(D),Fu'Fs(Fs)檢驗(yàn)及核苷酸不配對(duì)分布檢驗(yàn)也表明,除廈門群體存在近期的群體擴(kuò)張外,其他群體均未發(fā)生擴(kuò)張。5、臺(tái)灣海峽北部(霞浦至舟山)的五個(gè)地理樣本均由N譜系、S譜系和雜交種群組成,證實(shí)了東海區(qū)域可能為中華烏塘鱧產(chǎn)生雜交的二次接觸區(qū)。中華烏塘鱧群體在閩浙沿海的二次接觸區(qū)域形成的雜交帶符合張力帶模型。在張力帶中,與親本種相比雜種的適應(yīng)性相對(duì)較低,雜交帶被限制在兩個(gè)親本種之間的狹窄區(qū)域,主要是由雜種的擴(kuò)散和選擇之間的平衡性來維持。在雜交帶中,等位基因的丟失導(dǎo)致雜交種存活力下降,當(dāng)夏季產(chǎn)卵季節(jié)時(shí),中華烏塘鱧種群從二次接觸區(qū)域的南部向北部擴(kuò)散,平衡了等位基因缺失現(xiàn)象。從整體來看,兩個(gè)系統(tǒng)的地理譜系處于物種形成過程的初期階段。
【學(xué)位授予單位】：廈門大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：S917.4
【圖文】：

圖１．１邋一個(gè)典型含ＡＣ微衛(wèi)星位點(diǎn)的序列逡逑Ｆｉｇ．１．１邋Ｓｅｑｕｅｎｃｅ邋ｏｆ邋ａ邋ｔｙｐｉｃａｌ邋ＡＣ邋ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅ邋ｌｏｃｕｓ逡逑１．３．１．２微衛(wèi)星的結(jié)構(gòu)分類逡逑

邐ｇｅｎｏｍｅ逡逑Ｕ＼邐魚類ｉｔ粒體￥因組邋＾邋ｗ／？／逡逑圖１．２海水魚類線粒體基因組結(jié)構(gòu)圖１６５］逡逑Ｆｉｇｌ．２邋Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ邋ｏｆ邋ｍｔＤＮＡ邋ｉｎ邋ｍａｒｉｎｅ邋ｆｉｓｈ逡逑注：ＯＨ為重鏈（Ｈ鏈）的復(fù)制起點(diǎn)，ＯＬ為輕鏈（Ｌ鏈）的復(fù)制起點(diǎn)。ｔＲＮＡ基因如圖中陰影部分所示，其中Ｌ逡逑鏈編碼的ｔＲＮＡ基因標(biāo)于外側(cè)，Ｈ鏈編碼的ｔＲＮＡ基因標(biāo)于內(nèi)側(cè)。箭頭表示ＰＣＲ引物的方向和大致位]。逡逑Ｎｏｔｅ：邋ＯＨ邋ａｎｄ邋ＯＬ邋ａｒｅ邋ｉｎｄｉｃａｔｅｄ邋ａｓ邋ｔｈｅ邋ｏｒｉｇｉｎｓ邋ｏｆ邋Ｈ－ａｎｄ邋Ｌ－ｓｔｒａｎｄ邋ｒｅｐｌｉｃａｔｉｃａｉ．邋Ｔｒａｎｓｆｅｒ邋ＲＮＡ邋ｇｅｎｅｓ邋ａｒｅ邋ｓｈｏ＾ｄ邋ｉｎ逡逑ｓｈａｄｅｄ邋ｂｏｘｅｓ．邋Ｔｈｅ邋ｔＲＮＡ邋ｇｅｎｅｓ邋ｃｏｄｅｄ邋ｂｙ邋ｄｉｅ邋Ｌ－ｓｔｒａｎｄ邋ａｒｅ邋ｌａｂｅｌｅｄ邋ｏｕｔｓｉｄｅ邋ｔｉｉｅ邋ｃｉｒｃｌｅ．，邋ｗｈｉｌｅ邋ｔｈｅ邋ｔＲＮＡ邋ｇｅｎｅｓ邋ｃｏｄｅｄ逡逑ｂｙ邋ｔｈｅ邋Ｈ－ｓｔｉａｎｄ邋ａｒｅ邋ｌａｂｅｌｅｄ邋ｉｎｓｉｄｅ．邋Ｔｈｅ邋ａｒｒｏｗｓ邋ｉｎｄｉｃａｔｅ邋ｔｈｅ邋ｄｉｒｅｃｔｉｏｎ邋ａｎｄ邋ａｐｐｒｏｘｉｍａｔｅｌｙ邋ｒｅｌａｔｉｖｅ邋ｐｏｓｉｔｉｏｎｓ邋ｏｆ邋ＰＣＲ逡逑ｐｒｉｍｅｒｓ．逡逑Ｃｙｔｂ基因廣泛存在在真核生物及部分原核生物的細(xì)胞中，在種、屬間都具逡逑有多樣性。Ｃｙｔｂ基因位于線粒體功能區(qū)，是編碼細(xì)胞色素氧化酶基因的一個(gè)亞逡逑基，同時(shí)也是參與氧化磷酸化合成過程中的重要物質(zhì)之一。其核昔酸序列總長(zhǎng)逡逑約為１１４０ｂｐ，不同物種間的Ｃｙｔｂ基因序列長(zhǎng)度沒有明顯差異。堿基置換在多逡逑數(shù)情況下是沉默的

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2739227