【摘要】：Micro RNA(微小RNA)是廣泛存在于真核生物中的一類長約22 nt的內(nèi)源性非編碼單鏈RNA,在細胞凋亡、細胞增殖和分化及DNA修復(fù)等多種生理過程中都發(fā)揮著重要調(diào)節(jié)作用。大量研究表明,mi RNA還與病毒感染后引起細胞內(nèi)一系列生理變化相關(guān)。鯉春病毒血癥病毒(Spring Viremia of Carp Virus,SVCV)能引起鯉春病毒血癥(Spring Viremia of Carp,SVC)爆發(fā),給世界水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)造成巨大的經(jīng)濟損失。目前,該病毒感染的致病機理還不清楚。為了研究mi RNA在SVCV感染過程中的作用,本研究采用高通量測序技術(shù)對SVCV感染前后EPC細胞中的小RNA文庫進行測序。具體研究內(nèi)容如下:1.構(gòu)建了病毒感染組小RNA文庫(E)和病毒未感染組小RNA文庫(M),通過solexa測序技術(shù)和后續(xù)的生物信息學(xué)分析,對每一條小RNA序列進行分類注釋,鑒定出161個保守性mi RNA和26個新的mi RNA。2.將M組和E組mi RNA表達水平進行了比較,發(fā)現(xiàn)SVCV感染導(dǎo)致10個mi RNA表達上調(diào)和4個mi RNA表達下調(diào)。3.為了驗證高通量測序結(jié)果的準確性,通過q RT-PCR對部分mi RNA表達水平進行了驗證。4.利用生物學(xué)軟件對14個顯著性差異表達mi RNA的靶基因進行了預(yù)測,還預(yù)測了可以直接靶向SVCV基因組的mi RNA。5.通過轉(zhuǎn)染mi RNA抑制劑或模擬物,TCID50和q RT-PCR等實驗對mi R-15a-5p與SVCV復(fù)制的關(guān)系進行了初步探討。目前,尚無魚類彈狀病毒感染相關(guān)mi RNA表達譜研究的報道。本研究為從mi RNA角度深入探討SVCV致病的分子機制奠定了基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：S941.41
【圖文】：

圖 1-1 SVCV 病毒結(jié)構(gòu) (Ahne et al 2002)(A) 病毒粒子的結(jié)構(gòu)，(B) 基因組的結(jié)構(gòu)Fig 1-1 Spring vir emia of carp virus (Ahne et al 2002)(A) Virion structure, (B) Genomic organization

1.2.2 miRNA 的功能和作用方式圖 1-2 miRNA 的產(chǎn)生 (Mack, 2007)Fig 1-2 miRNA biogenesis (Mack, 2007)

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 付峰;劉葒;黃P";蔡生力;;鯉春病毒血癥病毒(SVCV)的研究進展[J];中國水產(chǎn)科學(xué);2006年02期

本文編號：2726569