【摘要】：Micro RNA(微小RNA)是廣泛存在于真核生物中的一類長(zhǎng)約22 nt的內(nèi)源性非編碼單鏈RNA,在細(xì)胞凋亡、細(xì)胞增殖和分化及DNA修復(fù)等多種生理過(guò)程中都發(fā)揮著重要調(diào)節(jié)作用。大量研究表明,mi RNA還與病毒感染后引起細(xì)胞內(nèi)一系列生理變化相關(guān)。鯉春病毒血癥病毒(Spring Viremia of Carp Virus,SVCV)能引起鯉春病毒血癥(Spring Viremia of Carp,SVC)爆發(fā),給世界水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。目前,該病毒感染的致病機(jī)理還不清楚。為了研究mi RNA在SVCV感染過(guò)程中的作用,本研究采用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)SVCV感染前后EPC細(xì)胞中的小RNA文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序。具體研究?jī)?nèi)容如下:1.構(gòu)建了病毒感染組小RNA文庫(kù)(E)和病毒未感染組小RNA文庫(kù)(M),通過(guò)solexa測(cè)序技術(shù)和后續(xù)的生物信息學(xué)分析,對(duì)每一條小RNA序列進(jìn)行分類注釋,鑒定出161個(gè)保守性mi RNA和26個(gè)新的mi RNA。2.將M組和E組mi RNA表達(dá)水平進(jìn)行了比較,發(fā)現(xiàn)SVCV感染導(dǎo)致10個(gè)mi RNA表達(dá)上調(diào)和4個(gè)mi RNA表達(dá)下調(diào)。3.為了驗(yàn)證高通量測(cè)序結(jié)果的準(zhǔn)確性,通過(guò)q RT-PCR對(duì)部分mi RNA表達(dá)水平進(jìn)行了驗(yàn)證。4.利用生物學(xué)軟件對(duì)14個(gè)顯著性差異表達(dá)mi RNA的靶基因進(jìn)行了預(yù)測(cè),還預(yù)測(cè)了可以直接靶向SVCV基因組的mi RNA。5.通過(guò)轉(zhuǎn)染mi RNA抑制劑或模擬物,TCID50和q RT-PCR等實(shí)驗(yàn)對(duì)mi R-15a-5p與SVCV復(fù)制的關(guān)系進(jìn)行了初步探討。目前,尚無(wú)魚類彈狀病毒感染相關(guān)mi RNA表達(dá)譜研究的報(bào)道。本研究為從mi RNA角度深入探討SVCV致病的分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：S941.41
【圖文】：

圖 1-1 SVCV 病毒結(jié)構(gòu) (Ahne et al 2002)(A) 病毒粒子的結(jié)構(gòu)，(B) 基因組的結(jié)構(gòu)Fig 1-1 Spring vir emia of carp virus (Ahne et al 2002)(A) Virion structure, (B) Genomic organization

1.2.2 miRNA 的功能和作用方式圖 1-2 miRNA 的產(chǎn)生 (Mack, 2007)Fig 1-2 miRNA biogenesis (Mack, 2007)

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 付峰;劉葒;黃P";蔡生力;;鯉春病毒血癥病毒(SVCV)的研究進(jìn)展[J];中國(guó)水產(chǎn)科學(xué);2006年02期

本文編號(hào)：2726569