【摘要】：為了恢復(fù)和保護(hù)漁業(yè)資源種群,維護(hù)生態(tài)系統(tǒng)穩(wěn)定,實(shí)現(xiàn)漁業(yè)的可持續(xù)發(fā)展,近年來(lái)我國(guó)開(kāi)展了大量的海洋生物增殖放流活動(dòng)。在一些大規(guī)模放流活動(dòng)中,仍然缺乏有效的跟蹤監(jiān)測(cè),如何準(zhǔn)確識(shí)別放流個(gè)體與野生個(gè)體,依然是該項(xiàng)活動(dòng)的重點(diǎn)與難點(diǎn)。傳統(tǒng)的標(biāo)記放流個(gè)體的方法存在很多不足,分子標(biāo)記方法能有效彌補(bǔ)傳統(tǒng)方法的缺點(diǎn),適應(yīng)于目前的大規(guī)模的增殖放流活動(dòng)。目前,分子標(biāo)記已成為增殖放流個(gè)體識(shí)別中最有效的方法。本研究基于微衛(wèi)星標(biāo)記,利用“親緣分析技術(shù)”,以我國(guó)東南沿海的重要經(jīng)濟(jì)種點(diǎn)斑籃子魚(yú)(Siganus guttatus)和黃斑籃子魚(yú)(Siganus oramin)為研究對(duì)象,分別建立放流個(gè)體分子判別方法,并從多方面驗(yàn)證方法的可行性。以期應(yīng)用于實(shí)際的增殖放流活動(dòng)中,同時(shí)也為點(diǎn)斑籃子魚(yú)和黃斑籃子魚(yú)的種群遺傳學(xué)研究提供科學(xué)基礎(chǔ)。本研究主要包括3部分:點(diǎn)斑籃子魚(yú)和黃斑籃子魚(yú)微衛(wèi)星分子判別標(biāo)記組的建立、點(diǎn)斑籃子魚(yú)放流個(gè)體分子識(shí)別方法的建立、黃斑籃子魚(yú)放流個(gè)體分子判別方法的建立。(1)微衛(wèi)星分子判別標(biāo)記組的建立使用“高通量測(cè)序法”分別開(kāi)發(fā)點(diǎn)斑籃子魚(yú)和黃斑籃子魚(yú)的微衛(wèi)星標(biāo)記。測(cè)序共獲得點(diǎn)斑籃子魚(yú)微衛(wèi)星序列1116條,利用PRIMER PREMIER 5軟件設(shè)計(jì)微衛(wèi)星PCR引物167對(duì)。使用一個(gè)海南野生點(diǎn)斑籃子魚(yú)群體篩選后,共獲得點(diǎn)斑籃子魚(yú)高多態(tài)性微衛(wèi)星引物20對(duì),根據(jù)各標(biāo)記的遺傳學(xué)屬性選出14個(gè)標(biāo)記,建立“微衛(wèi)星分子標(biāo)記組”。此標(biāo)記組擁有較高的遺傳多樣性水平,等位基因數(shù)(A)平均值為9.5,表觀雜合度(H_O)與期望雜合度(H_E)平均值均為0.803,多態(tài)信息含量(PIC)平均值為0.767,所有標(biāo)記通過(guò)“哈迪-溫伯格”平衡檢驗(yàn),各標(biāo)記間不存在連鎖不平衡現(xiàn)象。高通量測(cè)序共獲得黃斑籃子魚(yú)微衛(wèi)星序列2700條,按照引物設(shè)計(jì)條件共設(shè)計(jì)PCR引物220對(duì)。使用一個(gè)大亞灣野生黃斑籃子魚(yú)群體篩選引物,有19個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記顯示出高多態(tài)性,從中精選出12個(gè)標(biāo)記,組成黃斑籃子魚(yú)微衛(wèi)星標(biāo)記組。此標(biāo)記組擁有較高的遺傳多樣性水平,等位基因數(shù)(A)平均值為10.33,表觀雜合度(H_O)平均值為0.715,期望雜合度(H_E)平均值為0.790,多態(tài)信息含量(PIC)平均值為0.755,所有標(biāo)記通過(guò)“哈迪-溫伯格”平衡檢驗(yàn),各標(biāo)記間不存在連鎖不平衡現(xiàn)象。(2)點(diǎn)斑籃子魚(yú)放流個(gè)體分子判別方法的建立在海南陵水對(duì)38尾點(diǎn)斑籃子魚(yú)進(jìn)行人工繁育,孵化受精卵至幼魚(yú)階段,采集親本群體(N=38)和子代群體(N=100)的魚(yú)樣,同時(shí)出海采集一個(gè)點(diǎn)斑籃子魚(yú)野生群體(N=92)樣品。使用“分子標(biāo)記組”分別對(duì)3個(gè)群體進(jìn)行PCR擴(kuò)增,讀取基因分型數(shù)據(jù),分析遺傳多樣性水平。將親本群體的基因型數(shù)據(jù)輸入Cervus軟件進(jìn)行模擬親緣分析,經(jīng)過(guò)一系列參數(shù)調(diào)整,最終確定該親本群體親緣分析的最優(yōu)參數(shù)組合:分型錯(cuò)誤率4%,置信度98%,LOD決斷值為4.75。在模擬分析中模擬子代的分配率為96.61%。將“LOD=4.75”分別應(yīng)用于3種識(shí)別驗(yàn)證:子代群體識(shí)別驗(yàn)證、野生群體識(shí)別驗(yàn)證和混合模擬放流群體識(shí)別驗(yàn)證。結(jié)果顯示,子代群體的識(shí)別率為92%,野生群體無(wú)識(shí)別個(gè)體,混合模擬放流群體識(shí)別準(zhǔn)確率均值為95.3%。在3種驗(yàn)證條件下,此微衛(wèi)星分子標(biāo)記組均能準(zhǔn)確識(shí)別出真實(shí)子代,表明此標(biāo)記組在親權(quán)鑒定上有著準(zhǔn)確的識(shí)別能力,可以應(yīng)用于實(shí)際的增殖放流活動(dòng)。(3)黃斑籃子魚(yú)放流個(gè)體分子判別方法的建立采集4個(gè)不同地理群體的黃斑籃子魚(yú),使用“分子標(biāo)記組”對(duì)其進(jìn)行遺傳多樣性檢測(cè)。結(jié)果顯示,各群體內(nèi)部都具有較高的遺傳多態(tài)性,各群體間遺傳多態(tài)性程度沒(méi)有明顯差異。綜合各群體的F_(ST)值顯著性檢驗(yàn)和個(gè)體分配分析的結(jié)果,將大亞灣、東山灣和陽(yáng)江群體混合作為模擬親緣分析的親本群體(N=157)。經(jīng)過(guò)Cervus軟件模擬100 000個(gè)子代進(jìn)行識(shí)別分析,最終確定LOD決斷值為8.19,模擬子代分配率為98.85%。為判定此“分子標(biāo)記組”的最大可容納親本數(shù)壓力,結(jié)果顯示,當(dāng)親本個(gè)數(shù)增加到800時(shí),模擬子代分配率低于95%。由此說(shuō)明,該標(biāo)記組的識(shí)別水平足夠應(yīng)用于當(dāng)前大規(guī)模增殖放流活動(dòng)中大量親本的情況,且具有充足的判別能力。
【圖文】：

口小，前下位。體被細(xì)小圓鱗。側(cè)線完全，位高，向后40~142。體側(cè)許多不規(guī)則金黃色斑點(diǎn)，腹部呈銀色，最突黃色斑點(diǎn)。體色在不同環(huán)境下為金色或深黑色，受驚嚇或籃子魚(yú)較其他籃子魚(yú)具有體型較大、繁殖量大、生長(zhǎng)速度部沿海分布廣泛等特點(diǎn)，是一種很有研究?jī)r(jià)值的經(jīng)濟(jì)魚(yú)

圖 1-2 黃斑籃子魚(yú)（Siganus oramin）Fig.1-2 Siganus oramin魚(yú)研究進(jìn)展]早在 1999 年就對(duì)黃斑籃子魚(yú)的生物學(xué)和池塘養(yǎng)殖進(jìn)打下科學(xué)基礎(chǔ)。之后幾年內(nèi)，，黃斑籃子魚(yú)的高位池養(yǎng)養(yǎng)[65]等多種養(yǎng)殖模式相繼報(bào)道。目前，國(guó)內(nèi)學(xué)者已對(duì)食習(xí)性[66, 67]、營(yíng)養(yǎng)需求[68-70]、代謝生理[71, 72]、關(guān)鍵基研究較少。Liu 等[76]于 2015 年首次開(kāi)發(fā)了 9 個(gè)黃斑的遺傳多樣性分析，標(biāo)記數(shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)不足。本研究開(kāi)發(fā)記，以充實(shí)黃斑籃子魚(yú)的遺傳信息庫(kù)。目的和意義保護(hù)漁業(yè)資源種群，維護(hù)生態(tài)系統(tǒng)穩(wěn)定，實(shí)現(xiàn)漁業(yè)的的增殖放流活動(dòng)，但是在一些大規(guī)模放流工作中，如而有效評(píng)價(jià)放流效果，目前依然是該項(xiàng)活動(dòng)的重點(diǎn)與
【學(xué)位授予單位】：浙江海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類(lèi)號(hào)】：S917.4

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 鄭新慶;楊小舟;林榮澄;陳章群;牛文濤;黃丁勇;;盾形陀螺珊瑚與根枝藻和點(diǎn)斑籃子魚(yú)之間相互作用的實(shí)驗(yàn)研究[J];應(yīng)用海洋學(xué)學(xué)報(bào);2014年01期

2 周林艷;萬(wàn)美珍;劉永萍;陳玉芳;;免疫組織化學(xué)與聚合酶鏈反應(yīng)在結(jié)腸癌微衛(wèi)星狀態(tài)篩選中的比較[J];腫瘤防治研究;2015年12期

3 魏琦琦;林青;賈寶光;吳煉;李承想;張琳;;棗轉(zhuǎn)錄組序列的微衛(wèi)星特征分析[J];中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報(bào);2015年06期

4 王琳;梁旭方;林群;李光照;胡永樂(lè);;黃斑籃子魚(yú)去毒相關(guān)基因的克隆與肝臟組成型表達(dá)分析[J];熱帶海洋學(xué)報(bào);2009年06期

5 鄧玉營(yíng);徐立安;張博;諸葛強(qiáng);黃敏仁;王明庥;;黃花柳基因組微衛(wèi)星分離及多態(tài)性位點(diǎn)檢測(cè)[J];分子植物育種;2008年01期

6 肖擇;;NASA將發(fā)射三顆太空技術(shù)5微衛(wèi)星[J];上海航天;2006年01期

7 謝萬(wàn)木;肺癌中的微衛(wèi)星異�，F(xiàn)象及其臨床意義[J];醫(yī)學(xué)綜述;2003年12期

8 景露,李凌,高燕寧;微衛(wèi)星異常與肺癌的診斷[J];中國(guó)肺癌雜志;2001年06期

9 龔炎長(zhǎng),師守坤,彭中鎮(zhèn);畜禽微衛(wèi)星的特性[J];江西畜牧獸醫(yī)雜志;1998年03期

10 周蘭;吳曉龍;付永卓;趙相艷;陳禹保;譚鐘揚(yáng);;有尾噬菌體目中微衛(wèi)星和復(fù)合型微衛(wèi)星的發(fā)生及分析(英文)[J];中國(guó)生物工程雜志;2014年11期

相關(guān)會(huì)議論文 前10條

1 汪國(guó)平;胡開(kāi)林;梁樹(shù)南;吳定華;;番茄微衛(wèi)星研究進(jìn)展[A];中國(guó)園藝學(xué)會(huì)第五屆青年學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2002年

2 畢可紅;郭桂月;劉秀蘭;張玉昆;任海全;唐天華;馬慶恒;真剛;張偉;王俊偉;任青華;姜楓勤;趙良玉;姜國(guó)勝;;MDS相關(guān)基因檢測(cè)及其臨床意義的研究[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第八次全國(guó)血液學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2004年

3 ;四川省金沙江溪洛渡向家壩水電站珍稀特有魚(yú)類(lèi)增殖放流站會(huì)議交流材料[A];西南地區(qū)全國(guó)科普教育基地經(jīng)驗(yàn)交流會(huì)交流材料[C];2010年

4 陳丕茂;賈曉平;李純厚;余景;唐振朝;李輝權(quán);王宏;陶峰;張偉;方良;;大亞灣真鯛增殖放流效果評(píng)估[A];2007年中國(guó)水產(chǎn)學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)暨水產(chǎn)微生態(tài)調(diào)控技術(shù)論壇論文摘要匯編[C];2007年

5 葉寧;楊峰;吳曉東;;高橋紅樹(shù)林海區(qū)漁業(yè)增殖放流初步研究[A];2008年中國(guó)水產(chǎn)學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要集[C];2008年

6 蔡小彥;劉方;周忠麗;王星星;王春英;王玉紅;王坤波;;棉花葉綠體基因組全序列微衛(wèi)星分布規(guī)律研究[A];中國(guó)棉花學(xué)會(huì)2015年年會(huì)論文匯編[C];2015年

7 朱毅麟;;發(fā)展小衛(wèi)星 展望微衛(wèi)星[A];中國(guó)空間科學(xué)學(xué)會(huì)空間探測(cè)專(zhuān)業(yè)委員會(huì)第十次學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];1997年

8 徐永濤;張修月;岳碧松;;川金絲猴和東非狒狒基因組微衛(wèi)星分布特征比較分析[A];四川省動(dòng)物學(xué)會(huì)第十屆會(huì)員代表大會(huì)暨第十一次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要集[C];2015年

9 孫天琳;李鵬;杜聯(lián)名;邱實(shí);岳碧松;李靜;;兩種獼猴和川金絲猴全基因組微衛(wèi)星特征分析[A];四川省動(dòng)物學(xué)會(huì)第十屆會(huì)員代表大會(huì)暨第十一次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要集[C];2015年

10 王晨;杜聯(lián)明;張修月;岳碧松;;德國(guó)小蠊基因組微衛(wèi)星統(tǒng)計(jì)分析[A];四川省動(dòng)物學(xué)會(huì)第十屆會(huì)員代表大會(huì)暨第十一次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要集[C];2015年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前10條

1 記者 趙洪波 張士英;哈工大微衛(wèi)星獨(dú)立完成地月轉(zhuǎn)移、近月制動(dòng)、環(huán)月飛行[N];光明日?qǐng)?bào);2018年

2 張未 楊璐 記者 付毅飛;“龍江二號(hào)”微衛(wèi)星傳回地月合影[N];科技日?qǐng)?bào);2018年

3 本報(bào)記者 王越;哈工大微衛(wèi)星團(tuán)隊(duì)解析“龍江二號(hào)”[N];哈爾濱日?qǐng)?bào);2018年

4 記者 張夢(mèng)然;NASA首次以微衛(wèi)星發(fā)射納衛(wèi)星[N];科技日?qǐng)?bào);2010年

5 于軒;白洋淀增殖放流2000余萬(wàn)尾苗種[N];中國(guó)漁業(yè)報(bào);2016年

6 記者 周桂清;威遠(yuǎn)島增殖放流臺(tái) 每年吸引10萬(wàn)人觀景休閑[N];東莞日?qǐng)?bào);2017年

7 徐博龍;舟山連續(xù)36年增殖放流迎來(lái)利好變化[N];中國(guó)海洋報(bào);2017年

8 記者 徐博龍;我市堅(jiān)持36年增殖放流顯成效[N];舟山日?qǐng)?bào);2017年

9 記者 袁琳 通訊員 李鵬 楊曉佼;中越聯(lián)合增殖放流促魚(yú)類(lèi)產(chǎn)量增長(zhǎng)[N];廣西日?qǐng)?bào);2018年

10 本報(bào)記者 李飛;全國(guó)多地舉辦“放魚(yú)日”增殖放流活動(dòng)[N];農(nóng)民日?qǐng)?bào);2018年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前5條

1 郭文久;微衛(wèi)星在基因組上的分布與功能及其計(jì)算方法初步研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

2 蔡毅然;肝局灶性結(jié)節(jié)性增生、肝細(xì)胞腺瘤及肝細(xì)胞癌中微衛(wèi)星雜合性丟失研究[D];中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2008年

3 張樹(shù)鵬;健脾養(yǎng)胃法為主的個(gè)體化治療胃癌術(shù)后復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移的微衛(wèi)星狀態(tài)預(yù)測(cè)意義研究[D];南京中醫(yī)藥大學(xué);2011年

4 高國(guó)慶;花生微衛(wèi)星DNA的分離與多態(tài)性研究[D];福建農(nóng)林大學(xué);2002年

5 李建科;意大利蜜蜂產(chǎn)漿量性狀的微衛(wèi)星DNA和數(shù)量遺傳研究[D];浙江大學(xué);2003年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 謝志超;點(diǎn)斑籃子魚(yú)和黃斑籃子魚(yú)放流個(gè)體分子判別方法的建立[D];浙江海洋大學(xué);2018年

2 陳鳳;微衛(wèi)星不穩(wěn)定與卵巢上皮性癌易感性的臨床病例分析[D];吉林大學(xué);2009年

3 王培戈;結(jié)直腸癌患者8號(hào)染色體微衛(wèi)星改變的研究[D];青島大學(xué);2002年

4 陳穎;山東省漁業(yè)資源增殖放流現(xiàn)狀及前景分析[D];煙臺(tái)大學(xué);2017年

5 付華輝;中國(guó)人肝細(xì)胞腺瘤基因組微衛(wèi)星變異特征及其臨床病理學(xué)意義的研究[D];蘇州大學(xué);2012年

6 劉瑾;三角帆蚌微衛(wèi)星的分離及其遺傳多樣性分析[D];浙江大學(xué);2007年

7 蔣彥波;苧麻微衛(wèi)星的分離與鑒定及其在苧麻組親緣關(guān)系研究中的應(yīng)用[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2005年

8 鄧玉營(yíng);黃花柳微衛(wèi)星富集文庫(kù)構(gòu)建及標(biāo)記篩選[D];南京林業(yè)大學(xué);2005年

9 謝萬(wàn)木;17號(hào)染色體微衛(wèi)星異常與肺癌相關(guān)性的研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2004年

10 呂海波;分子標(biāo)記在三疣梭子蟹增殖放流中的應(yīng)用研究[D];大連海洋大學(xué);2016年

本文編號(hào)：2707323