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液相芯片技術(shù)和LAMP技術(shù)檢測(cè)致病性弧菌的研究

發(fā)布時(shí)間:2020-06-05 18:17
【摘要】:弧菌(Vibrio)廣泛分布在海洋、江河和湖泊的水體中,從兩極的極冷環(huán)境到赤道的熱帶環(huán)境的水域中都有分布,隨著人們生活水平的提高,對(duì)海產(chǎn)品的需求量越來(lái)越大,弧菌已然成為了威脅水產(chǎn)養(yǎng)殖和人們的身體健康的重要病原菌,但是弧菌的種類(lèi)繁多,使在檢測(cè)和防治方面受到了巨大的挑戰(zhàn),所以建立弧菌的多重檢測(cè)和基層檢測(cè)是非常必要的。副溶血弧菌是弧菌中威脅水產(chǎn)養(yǎng)殖的重要病原弧菌,每年都會(huì)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失,副溶血弧菌有兩條染色體,每條染色體上各有一個(gè)不同的外膜蛋白o(hù)mpA的編碼基因,分別為VP0764和VPA1186兩段基因,取這兩段基因分別設(shè)計(jì)兩對(duì)引物,F/R引物上分別具有BamH和Sacl酶切位點(diǎn),用BL21載體進(jìn)行蛋白表達(dá),純化鑒定之后用來(lái)制備多抗,然后進(jìn)行免疫磁珠的制備進(jìn)行菌體捕捉。以副溶血弧菌的毒力因子基因(vptdh)和特異性基因(vptox)、霍亂弧菌的腸毒素基(vcctx)和外膜蛋白基因(vcomp)和溶血素基因(vchly)、擬態(tài)弧菌的溶血素基因(vmha)和特異性基因(vmtox)、創(chuàng)傷弧菌的溶血素基因(vvha)和創(chuàng)傷弧菌多重毒素基因(vvrtx)、溶藻弧菌的膠原蛋白酶基因(vacol)為目的基因設(shè)計(jì)引物和特異性微球探針,進(jìn)行液相芯片技術(shù)實(shí)驗(yàn)研究。設(shè)計(jì)的引物與五種弧菌以及大腸桿菌、沙門(mén)氏菌進(jìn)行PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物與特異性探針雜交讀數(shù),證明得到液相芯片技術(shù)具有很好的特異性;特異性探針與不同菌濃度的PCR產(chǎn)物進(jìn)行雜交,證明得到其具有很高的靈敏度;十種特異性探針?lè)謩e與單一PCR產(chǎn)物和混合PCR產(chǎn)物進(jìn)行雜交,證實(shí)液相芯片技術(shù)多重檢測(cè)的可操作性。搜索創(chuàng)傷弧菌溶血素A基因(hemolysin gene A,HA)和多重毒素(repeats in toxin,RTX)毒力基因的并設(shè)計(jì)兩種基因的內(nèi)、外引物,進(jìn)行LAMP檢測(cè)目的基因和人工模擬樣品,通過(guò)肉眼觀察白色沉淀,初步判斷檢測(cè)結(jié)果,再通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)一步確認(rèn)檢測(cè)結(jié)果。LAMP檢測(cè)兩種目的基因靈敏度達(dá)到10 CFU/ml,人工模擬樣品檢測(cè)的靈敏度分別為1×102CFU/g(VV-RTX)和1×104CFU/g(VV-HA),與普通PCR比較,具有較高的靈敏度,同時(shí)具有用時(shí)短,成本低,適合用于基層等優(yōu)點(diǎn)。
【圖文】:

液相,技術(shù),聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),方法學(xué)


>邐黎yU?h邋S邋、、邐>_邋'V邋'邐^邐,逡逑圖1-1液相芯片檢測(cè)原理逡逑Fig.邋1-1邋Liquid邋chip邋detection邋principle逡逑式反應(yīng)(PCR)技術(shù)逡逑應(yīng)(polymerase邋chain邋reaction,邋PCR)技術(shù)在方法學(xué)上是

條帶,引物,菌液,引物擴(kuò)增


液相芯片技術(shù)和LAMP技術(shù)檢n,致病性孤菌的研究逡逑3.1目的基因擴(kuò)增結(jié)果逡逑兩個(gè)引物以提取的目的基因?yàn)槟康钠芜M(jìn)行擴(kuò)增,結(jié)果如圖2-1中A、B逡逑所示,經(jīng)過(guò)測(cè)序后證明,VP0764引物出現(xiàn)了一條與大小約為903邋bp的條帶,而逡逑陰性對(duì)照組沒(méi)有條帶,VPA1186引物也出現(xiàn)一條大小約為933邋bp的條帶,而陰逡逑性對(duì)照組沒(méi)有出現(xiàn)條帶。逡逑bp邋1邐2邐3邐bp邋1邐2邐3逡逑:塞姦’邋'逡逑::卜邋-逡逑(A)邐(B)逡逑圖2-1基因片段擴(kuò)增結(jié)果逡逑Fig.2-1邋Gene邋amplification邋results逡逑注:A、\T0764PCR擴(kuò)增結(jié)果;B、VPA1186PCR擴(kuò)增結(jié)果逡逑1、MarkerDL15000;邋2、陽(yáng)性組;3、陰性組逡逑1邋.Marker邋DL15000;邋2.The邋positive邋group;邋3.The邋negative邋groups逡逑3.2質(zhì)粒構(gòu)建鑒定逡逑3.2.1菌液PCR鑒定逡逑將VP0764和VPA1186兩種外膜的慘敗連接轉(zhuǎn)化之后的BL21大腸桿菌進(jìn)行逡逑培養(yǎng)之后,進(jìn)行菌液PCR鑒定,結(jié)果如圖2-2,邋VP0764的引物擴(kuò)增的條帶大小逡逑和目的基因大。梗埃冲澹猓鹣嘟,VPA1186的引物擴(kuò)增的條帶大小和目的基因條帶逡逑大。梗常冲澹猓鹣嘟,,陰性對(duì)照組都沒(méi)有條帶。逡逑27逡逑
【學(xué)位授予單位】:廣西大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類(lèi)號(hào)】:S941.4

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2698427

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