紅毛菜核糖體RNA基因全長(zhǎng)序列及不同地理群間的系統(tǒng)發(fā)育分析研究
發(fā)布時(shí)間:2020-05-14 20:54
【摘要】:紅毛菜具有較高的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值和藥用價(jià)值,.是新興的重要栽培紅藻,然而目前對(duì)我國(guó)紅毛菜屬植物的種類、分布,淡水紅毛菜與海水紅毛菜的親緣關(guān)系等研究不足。本文通過克隆測(cè)序核糖體RNA基因全長(zhǎng)序列,對(duì)我國(guó)沿海地區(qū)及內(nèi)陸地區(qū)采集到的紅毛菜植物的種屬關(guān)系及親緣關(guān)系進(jìn)行研究。核糖體RNA基因由編碼區(qū)和非編碼區(qū)構(gòu)成,編碼區(qū)序列包括18S rDNA、5.8S rDNA和28S rDNA,非編碼區(qū)包括ITS1、ITS2和IGS區(qū)域,編碼區(qū)序列比較保守,而非編碼區(qū)序列進(jìn)化速率則較快,不同的進(jìn)化速率讓核糖體RNA基因適用于不同分類水平。通過基因克隆和測(cè)序技術(shù),對(duì)福建莆田的海水紅毛菜進(jìn)行核糖體RNA基因全長(zhǎng)測(cè)序研究。結(jié)果顯示,莆田的海水紅毛菜18S rDNA的全長(zhǎng)序列為2942bp,5.8S rDNA的序列長(zhǎng)度為158bp,28S rDNA全長(zhǎng)序列為3751bp, ITS1序列長(zhǎng)度為699bp, ITS2序列長(zhǎng)度為397bp, IGS序列長(zhǎng)度為4613bp,因此,莆田的海水紅毛菜核糖體RNA基因序列全長(zhǎng)為12530bp。本文對(duì)采自山東威海(WH)、江蘇連云港(LYG)和南通(NT)、福建莆田(PT)和南日島1-2 (NRD1-2)和深圳南澳1-3(NA1-3)的9個(gè)海水紅毛菜以及甘肅蘭州興隆山(XLS)、山西陽(yáng)泉娘子關(guān)(NZG)的2個(gè)淡水紅毛菜進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育研究?寺〔⑶曳治銎18S rDNA、5.8S rDNA及ITS區(qū)域序列、28S rDNA部分序列和IGS部分序列,結(jié)果顯示:11個(gè)地理群的紅毛菜分成三個(gè)進(jìn)化分支,2個(gè)淡水紅毛菜與世界其他地方的淡水紅毛菜分為一支,獨(dú)立于海水紅毛菜;而9個(gè)海水紅毛菜中分為兩個(gè)分支,威海(WH)的海水紅毛菜分為一個(gè)獨(dú)立分支,其他8個(gè)海水紅毛菜分為一個(gè)分支。根據(jù)國(guó)際上最新修訂的紅毛菜科15個(gè)屬的分類,本文中的2個(gè)淡水紅毛菜聚類在Bangia中,威海的海水紅毛菜聚類在"Bangia" 1中,其他8個(gè)海水紅毛菜聚類在"Bangia"2中。對(duì)不同地理群紅毛菜核糖體RNA基因的不同區(qū)域序列進(jìn)行分析,結(jié)果顯示:不同物種間18S rDNA的序列相似性為89.0%-93.2%,5.8S rDNA的序列相似性為86.7%-90.5%,28S rDNA的部分序列相似性為80.1%-86.2%,而紅毛菜種內(nèi)相似性極高,幾乎沒有差異,因此,各編碼區(qū)序列適合于紅毛菜種間及種以上水平的分類鑒定。雖然不同物種間ITS區(qū)序列相似性極低,但在種內(nèi)相似性卻極高,故而不適合用于紅毛菜種下水平的遺傳分析,可結(jié)合5.8S rDNA序列用于種間及其以上水平的分類研究。聚類在同一進(jìn)化分支上的8個(gè)海水紅毛菜的部分IGS序列幾乎沒有差別,因此推測(cè)這8個(gè)海水紅毛菜可能為同一個(gè)種。
【圖文】:
(絲狀體)兩個(gè)世代(汪文俊等2008)。此類型包括有性繁殖和無性繁殖兩種繁逡逑殖方式。紅毛菜的有性繁殖過程中,雌雄配子體分別形成果胞和精子,受精后形逡逑成果抱子囊,并放散果抱子(圖1)。Drew邋(1949)報(bào)道了擠形紫菜逡逑M/M占?jí)揽诠茫┑墓勺樱ǎ纾锘螅穑铮颍澹┟劝l(fā)后穿過貝殼內(nèi)層生長(zhǎng),形成一種殼斑藻,逡逑并確定此為絲狀體時(shí)期。我國(guó)藻類學(xué)家曾呈奎和張德瑞(1954)對(duì)甘紫菜(化W炒ra逡逑tenem)的絲狀體發(fā)育成配子體過程進(jìn)一步研究,發(fā)現(xiàn)絲狀體發(fā)育成抱子囊,進(jìn)而逡逑放散抱子,此抱子直接發(fā)育成配子體,同時(shí)命名此抱子為殼袍子(conchosopore)。逡逑紅毛菜的果拖子萌發(fā)穿過貝殼內(nèi)層形成抱子體,抱子體中的袍子囊枝放散殼袍子,逡逑殼跑子直接發(fā)育成紅毛菜配子體。相比于有性繁殖,紅毛菜的無性繁殖更為普遍,逡逑其雌雄配子體幼苗直接發(fā)散大量單跑子,單抱子繼而發(fā)育成新的配子體,無性繁逡逑殖方式為紅毛菜群體數(shù)量的擴(kuò)增有巨大貢獻(xiàn)。無性繁殖除了通過單抱子進(jìn)行W外,逡逑還通過休眠抱子和藻體斷裂形成新個(gè)體。休眠抱子是紅毛菜原葉體在生長(zhǎng)過程中逡逑部分細(xì)胞壞死
3.結(jié)果逡逑3.1海水紅毛萊基因組DNA的提取逡逑采自福建甫田的栽培海水紅毛菜基因組DNA的瓊脂糖凝膠電泳圖如圖4所逡逑示。根據(jù)凝膠電泳圖,我們可W看出海水紅毛菜基因組DNA的大小約為25此,符逡逑合其基因組分子量大小。逡逑WOObp逡逑3000bp逡逑-腳卿逡逑1500bp逡逑lOOObp逡逑 ̄50bp逡逑500bp逡逑*邐三邋00邋bp逡逑100邸逡逑圖4海水紅私菜基因組DNA電泳圖逡逑Ml:邋TaKa民a邋X-Hind邋III邋出gestDNAmarker;邋1-5:海水}毛萊基因組DNA;邋M2:逡逑TaKaRaDL5000DNAmarker;邋6:空白對(duì)照逡逑Fig.邋4邋Electrophoresis邋image邋of邋genomic邋DNA邋extracted邋from邋度幻巧各/a邋collected邋from逡逑Putian逡逑Ml:邋TaKa民邋a邋入-Hind邋in邋digest邋DNA邋marker;邋1-5:邋Genomic邋DNA邋of邋Ba打gia邋collected逡逑from邋Putian;邋M2:邋TaKaRa邋DNA邋marker邋DI^-5000;邋6:邋Black邋control逡逑3.2邋"海水紅毛萊基因組DNA為模板的PC民擴(kuò)增逡逑PC民擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)W海水紅毛菜基因組DNA為模板,結(jié)合表4中的引物進(jìn)行PC民逡逑反應(yīng)。擴(kuò)增產(chǎn)物凝膠電泳圖如圖5所示。固5邋(a)為18S邋rDNA的凝膠電泳圖,逡逑從圖中可W看出,WSSUF和SSUR為引物的PCR成功擴(kuò)增出單一明亮條帶,且逡逑電泳條帶的大小約為3000bp
【學(xué)位授予單位】:蘇州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S968.43
本文編號(hào):2663922
【圖文】:
(絲狀體)兩個(gè)世代(汪文俊等2008)。此類型包括有性繁殖和無性繁殖兩種繁逡逑殖方式。紅毛菜的有性繁殖過程中,雌雄配子體分別形成果胞和精子,受精后形逡逑成果抱子囊,并放散果抱子(圖1)。Drew邋(1949)報(bào)道了擠形紫菜逡逑M/M占?jí)揽诠茫┑墓勺樱ǎ纾锘螅穑铮颍澹┟劝l(fā)后穿過貝殼內(nèi)層生長(zhǎng),形成一種殼斑藻,逡逑并確定此為絲狀體時(shí)期。我國(guó)藻類學(xué)家曾呈奎和張德瑞(1954)對(duì)甘紫菜(化W炒ra逡逑tenem)的絲狀體發(fā)育成配子體過程進(jìn)一步研究,發(fā)現(xiàn)絲狀體發(fā)育成抱子囊,進(jìn)而逡逑放散抱子,此抱子直接發(fā)育成配子體,同時(shí)命名此抱子為殼袍子(conchosopore)。逡逑紅毛菜的果拖子萌發(fā)穿過貝殼內(nèi)層形成抱子體,抱子體中的袍子囊枝放散殼袍子,逡逑殼跑子直接發(fā)育成紅毛菜配子體。相比于有性繁殖,紅毛菜的無性繁殖更為普遍,逡逑其雌雄配子體幼苗直接發(fā)散大量單跑子,單抱子繼而發(fā)育成新的配子體,無性繁逡逑殖方式為紅毛菜群體數(shù)量的擴(kuò)增有巨大貢獻(xiàn)。無性繁殖除了通過單抱子進(jìn)行W外,逡逑還通過休眠抱子和藻體斷裂形成新個(gè)體。休眠抱子是紅毛菜原葉體在生長(zhǎng)過程中逡逑部分細(xì)胞壞死
3.結(jié)果逡逑3.1海水紅毛萊基因組DNA的提取逡逑采自福建甫田的栽培海水紅毛菜基因組DNA的瓊脂糖凝膠電泳圖如圖4所逡逑示。根據(jù)凝膠電泳圖,我們可W看出海水紅毛菜基因組DNA的大小約為25此,符逡逑合其基因組分子量大小。逡逑WOObp逡逑3000bp逡逑-腳卿逡逑1500bp逡逑lOOObp逡逑 ̄50bp逡逑500bp逡逑*邐三邋00邋bp逡逑100邸逡逑圖4海水紅私菜基因組DNA電泳圖逡逑Ml:邋TaKa民a邋X-Hind邋III邋出gestDNAmarker;邋1-5:海水}毛萊基因組DNA;邋M2:逡逑TaKaRaDL5000DNAmarker;邋6:空白對(duì)照逡逑Fig.邋4邋Electrophoresis邋image邋of邋genomic邋DNA邋extracted邋from邋度幻巧各/a邋collected邋from逡逑Putian逡逑Ml:邋TaKa民邋a邋入-Hind邋in邋digest邋DNA邋marker;邋1-5:邋Genomic邋DNA邋of邋Ba打gia邋collected逡逑from邋Putian;邋M2:邋TaKaRa邋DNA邋marker邋DI^-5000;邋6:邋Black邋control逡逑3.2邋"海水紅毛萊基因組DNA為模板的PC民擴(kuò)增逡逑PC民擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)W海水紅毛菜基因組DNA為模板,結(jié)合表4中的引物進(jìn)行PC民逡逑反應(yīng)。擴(kuò)增產(chǎn)物凝膠電泳圖如圖5所示。固5邋(a)為18S邋rDNA的凝膠電泳圖,逡逑從圖中可W看出,WSSUF和SSUR為引物的PCR成功擴(kuò)增出單一明亮條帶,且逡逑電泳條帶的大小約為3000bp
【學(xué)位授予單位】:蘇州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S968.43
【參考文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前1條
1 黃文鳳,黃建明,董飛強(qiáng),陳啟發(fā);紅毛菜的營(yíng)養(yǎng)成分特征和價(jià)值[J];海洋水產(chǎn)研究;1998年02期
,本文編號(hào):2663922
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/2663922.html
最近更新
教材專著