基于核糖體序列的眼點(diǎn)淀粉卵甲藻和刺激隱核蟲的分類學(xué)分析與檢測(cè)
發(fā)布時(shí)間:2020-05-02 16:11
【摘要】:眼點(diǎn)淀粉卵甲藻和刺激隱核蟲是大黃魚養(yǎng)殖過(guò)程中常見的寄生蟲病,常常引起疾病的爆發(fā)并造成大量的經(jīng)濟(jì)損失。本文以大黃魚為實(shí)驗(yàn)對(duì)象,確定了獲取成熟眼點(diǎn)淀粉卵甲藻營(yíng)養(yǎng)體的實(shí)驗(yàn)方法。在觀察眼點(diǎn)淀粉卵甲藻生活史過(guò)程中,厘清了眼點(diǎn)淀粉卵甲藻在大黃魚上的生活史過(guò)程,同時(shí)確定了眼點(diǎn)淀粉卵甲藻胞囊直徑與子細(xì)胞數(shù)量以及與渦孢子之間的數(shù)量關(guān)系并進(jìn)一步確定了渦孢子的壽命。將大黃魚分18.14±5.21g、72.14±16.64g兩種體重,分別確定兩種魚的致死量。確定了 18.14±5.21g大黃魚的半數(shù)致死量,同時(shí)估測(cè)眼點(diǎn)淀粉卵甲藻渦孢子對(duì)72.14±16.64g大黃魚的成功感染并發(fā)育成胞囊比例。初步確定了眼點(diǎn)淀粉卵甲藻對(duì)大黃魚的毒力。因兩種寄生蟲分類學(xué)位置發(fā)生多次改變,至今仍有疑問(wèn),同時(shí)兩種寄生蟲的防控仍難以有效解決。本文克隆了眼點(diǎn)淀粉卵甲藻18S/ITS1/5.8S/ITS2/28S全長(zhǎng)基因并通過(guò)18S,28S序列對(duì)其親緣性進(jìn)行了分析?寺×舜碳る[核蟲18S/ITS1/5.8S/ITS2/28S/IGS全長(zhǎng)基因并通過(guò)18S,28S序列對(duì)其親緣性進(jìn)行了分析。同時(shí)通過(guò)IGS序列對(duì)4株刺激隱核蟲的親緣性進(jìn)行了分析。為了便于檢測(cè)眼點(diǎn)淀粉卵甲藻和刺激隱核蟲,本文分別在在核糖體不同基因區(qū)域設(shè)計(jì)兩對(duì)引物。在眼點(diǎn)淀粉卵甲藻18S序列的上游的5'ETS序列中以及ITS2序列中,設(shè)計(jì)特異性引物檢測(cè)眼點(diǎn)淀粉卵甲藻渦孢子和營(yíng)養(yǎng)體。2對(duì)引物對(duì)渦孢子的靈敏度為32個(gè)。而25-40μm的營(yíng)養(yǎng)體靈敏度為1個(gè),難以檢測(cè)直徑超過(guò)60μm的營(yíng)養(yǎng)體。在刺激隱核蟲28S序以及IGS序列中,設(shè)計(jì)特異性引物檢測(cè)刺激隱核蟲幼蟲和滋養(yǎng)體。2對(duì)引物對(duì)幼蟲和滋養(yǎng)體高度靈敏,1個(gè)幼蟲可以通過(guò)PCR方法得到檢測(cè)。不同大小的滋養(yǎng)體(80-420μm)RCR檢測(cè)的靈敏度與幼蟲檢測(cè)結(jié)果相同,都為1個(gè)蟲體。兩對(duì)引物具有種屬特異性,適合做PCR檢測(cè)引物。
【圖文】:
逡逑圖1-1邋AlgaeBase數(shù)據(jù)庫(kù)中眼點(diǎn)淀粉卵甲藻分類學(xué)位置逡逑Fig,邋1-1邋taxonomic邋status邋of邋Amyloodinium邋ocellatum邋in邋AlgaeBase逡逑Biota邋+逡逑Chromista邋+逡逑Harosa邋+逡逑Alveo邋lata邋Cavalier-Smith邋+逡逑Myzozoa邋Cavalier-Smith邋&邋Chao邋+逡逑Dinozoa邋+逡逑Dinoflagellata邋+逡逑Dinophyceae邋Fritsch,邋1927邋+逡逑Blastodiniales邋Chatton-i-逡逑Oodiniaceae邋+逡逑Amyloodinium邋E.邋Brown邋et邋Hovasse,邋1946逡逑圖i-2邋worms數(shù)據(jù)庫(kù)中眼點(diǎn)淀粉卵甲藻分類學(xué)位置逡逑Fig.邋1-2邋taxonomic邋status邋Amyloodinium邋ocellatum邋in邋WoRMS逡逑眼點(diǎn)淀粉卵甲藻與嗜酸性卵甲藻(Oodinium邋acidophilum邋Nie)由于形態(tài)學(xué)逡逑和病理學(xué)表現(xiàn)高度相似而容易被人混靖。Worms將這兩種病原都?xì)w為胚溝科,逡逑嗜酸卵甲藻屬于卵渦鞭蟲屬或卵甲藻屬(Oodinium)。眼點(diǎn)淀粉卵甲藻被稱作逡逑海洋天鵝絨病,而嗜酸性卵甲藻被稱作淡水天鵝絨病、淡水魚胡椒病、打粉病等。逡逑AlgaeBase記載的淡水卵禍鞭蟲只有兩種,沼澤卵圓鞭毛蟲(Piscinoodinium逡逑limneticum)與柱狀卵圓鞭毛蟲(Piscinoodinium邋pillulare),,通過(guò)對(duì)文獻(xiàn)中的記錄分逡逑析比較
邐福建農(nóng)林大學(xué)博士學(xué)位論文邐逡逑rDNA已廣泛用于分類鑒定與檢測(cè)。ITS由于不參與核糖體的形成,生物功能低,逡逑變異較快。常用ITS序列作為種見或?qū)匍g物種親緣關(guān)系分析[911。IGS進(jìn)化速度逡逑比ITS更快且所含信息量大,具有高度的特異性。適合種間或種內(nèi)親緣關(guān)系分析逡逑或分子生物學(xué)檢測(cè)。需要特別指出的是,沒(méi)有一個(gè)簡(jiǎn)單的基因就可以提供的完備逡逑的分子進(jìn)化信息,必須通過(guò)不同的的序列得到不同的發(fā)育樹來(lái)分析相互佐證192]。逡逑為得到更為準(zhǔn)確的發(fā)育樹,需要對(duì)多個(gè)基因或大量DNA序列進(jìn)行分析I93L逡逑NTS邐NTS逡逑
【學(xué)位授予單位】:福建農(nóng)林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S941.5
【圖文】:
逡逑圖1-1邋AlgaeBase數(shù)據(jù)庫(kù)中眼點(diǎn)淀粉卵甲藻分類學(xué)位置逡逑Fig,邋1-1邋taxonomic邋status邋of邋Amyloodinium邋ocellatum邋in邋AlgaeBase逡逑Biota邋+逡逑Chromista邋+逡逑Harosa邋+逡逑Alveo邋lata邋Cavalier-Smith邋+逡逑Myzozoa邋Cavalier-Smith邋&邋Chao邋+逡逑Dinozoa邋+逡逑Dinoflagellata邋+逡逑Dinophyceae邋Fritsch,邋1927邋+逡逑Blastodiniales邋Chatton-i-逡逑Oodiniaceae邋+逡逑Amyloodinium邋E.邋Brown邋et邋Hovasse,邋1946逡逑圖i-2邋worms數(shù)據(jù)庫(kù)中眼點(diǎn)淀粉卵甲藻分類學(xué)位置逡逑Fig.邋1-2邋taxonomic邋status邋Amyloodinium邋ocellatum邋in邋WoRMS逡逑眼點(diǎn)淀粉卵甲藻與嗜酸性卵甲藻(Oodinium邋acidophilum邋Nie)由于形態(tài)學(xué)逡逑和病理學(xué)表現(xiàn)高度相似而容易被人混靖。Worms將這兩種病原都?xì)w為胚溝科,逡逑嗜酸卵甲藻屬于卵渦鞭蟲屬或卵甲藻屬(Oodinium)。眼點(diǎn)淀粉卵甲藻被稱作逡逑海洋天鵝絨病,而嗜酸性卵甲藻被稱作淡水天鵝絨病、淡水魚胡椒病、打粉病等。逡逑AlgaeBase記載的淡水卵禍鞭蟲只有兩種,沼澤卵圓鞭毛蟲(Piscinoodinium逡逑limneticum)與柱狀卵圓鞭毛蟲(Piscinoodinium邋pillulare),,通過(guò)對(duì)文獻(xiàn)中的記錄分逡逑析比較
邐福建農(nóng)林大學(xué)博士學(xué)位論文邐逡逑rDNA已廣泛用于分類鑒定與檢測(cè)。ITS由于不參與核糖體的形成,生物功能低,逡逑變異較快。常用ITS序列作為種見或?qū)匍g物種親緣關(guān)系分析[911。IGS進(jìn)化速度逡逑比ITS更快且所含信息量大,具有高度的特異性。適合種間或種內(nèi)親緣關(guān)系分析逡逑或分子生物學(xué)檢測(cè)。需要特別指出的是,沒(méi)有一個(gè)簡(jiǎn)單的基因就可以提供的完備逡逑的分子進(jìn)化信息,必須通過(guò)不同的的序列得到不同的發(fā)育樹來(lái)分析相互佐證192]。逡逑為得到更為準(zhǔn)確的發(fā)育樹,需要對(duì)多個(gè)基因或大量DNA序列進(jìn)行分析I93L逡逑NTS邐NTS逡逑
【學(xué)位授予單位】:福建農(nóng)林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S941.5
【參考文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 LIU An;YI Zhenzhen;LIN Xiaofeng;HU Xiaozhong;Saleh A.AL-FARRAJ;Khaled A.S.AL-RASHEID;;Molecular Phylogenetic Lineage of Plagiopogon and Askenasia(Protozoa, Ciliophora) Revealed by Their Gene Sequences[J];Journal of Ocean University of China;2015年04期
2 溫衛(wèi)棟;汪博良;賈舒安;郝翠蘭;王新;岳城;;額爾齊斯河銀鯽寄生指環(huán)蟲18S rDNA序列測(cè)定及系統(tǒng)發(fā)育研究[J];水生態(tài)學(xué)雜志;2015年03期
3 張新艷;樊海平;林煜;吳斌;;刺激隱核蟲PCR檢測(cè)方法的建立[J];福建水產(chǎn);2015年01期
4 何祥楷;;大黃魚苗淀粉卵渦鞭蟲病的診斷及防治方法[J];福建水產(chǎn);2013年06期
5 王國(guó)良;周e
本文編號(hào):2647247
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/2647247.html
最近更新
教材專著