【摘要】:自古以來,海洋漁業(yè)在我國國民經(jīng)濟發(fā)展中一直享有不可取代的重要地位,屬于我國國民經(jīng)濟的重要產(chǎn)業(yè)。漁業(yè)資源也是我國漁業(yè)生產(chǎn)的基礎,近年來,鰳魚在我國漁業(yè)產(chǎn)量中排列前五。全面了解并掌握鰳魚群體的種群結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性以及其詳細的生物地理是實現(xiàn)鰳魚資源保護和可持續(xù)發(fā)展的基礎,對鰳魚等漁業(yè)管理政策的制定也起到積極的作用,是漁業(yè)可持續(xù)發(fā)展戰(zhàn)略的根本保障。近幾年由于忽視了鰳魚種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究,過度捕撈鰳魚,導致了鰳魚種群捕獲量的明顯下降和嚴重的種群衰減,主要表現(xiàn)在鰳魚的捕獲總量和鰳魚的尺寸大小上,還有鰳魚的分布范圍也逐漸縮小。因此,為實現(xiàn)鰳魚資源的可持續(xù)發(fā)展,急需對其做出科學的管理以及科學的捕撈和利用。為了進一步了解太平洋西部鰳魚群體演化歷程和地理格局形成的機制,我們還開展了太平洋西部分子系統(tǒng)地理學的研究。鰳魚(Ilisha elongate),是屬于鯡形目(Clupeiformes),鯡科(Clupeidae),暖水性中上層魚類,白天大多在水的中、下層活動,而在陰天、傍晚和黎明的時候喜歡棲息于水的中上層。鰳魚集中分布于太平洋西部到馬來西亞沙撈越的爪哇海。在我國黃渤海、東海、南海都有鰳魚的分布,而鰳魚產(chǎn)量最多的海域?qū)儆跂|海。我們主要采用了線粒體DNA(mtDNA)控制區(qū)(D-Loop)基因作為分子標記,對太平洋西部16個采樣點的鰳魚群體(每個采樣點5-10條鰳魚,湛江僅采集到一條鰳魚)進行了種群結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性的研究,以及太平洋西部鰳魚群體分子系統(tǒng)地理學的研究。本研究的主要結(jié)果如下:1.采集了太平洋西部中國沿海包括韓國和日本在內(nèi)的16個采樣點的125條鰳魚樣本,試驗魚分別采自黃海(Yellow Sea,YS)的煙臺(YT)、丹東(DD)、青島(QD),東海(East China Sea,ECS)的溫州(WZ)、象山(XS)、嵊泗(SS)、霞浦(XP),臺灣海峽(Taiwan Strait,TWS)的閩清(MQ)和廈門(XM)以及南海(South China Sea,SCS)的海安(HA)、湛江(ZJ)、閘坡(ZP)、汕尾(SW),日本的有明海(Ariake Sound,AS)以及韓國的濟州島(Jeju-do,JJ)和木浦(Mokpo,MP),并根據(jù)鰳魚采樣點所屬海域劃分為6個組群,利用mtdna控制區(qū)序列d-loop,研究了太平洋西部鰳魚群體的群體結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性。結(jié)果顯示,丹東種群與其它種群間存在顯著的單倍型分化,除丹東和日本以外的其它種群間單倍型在地理上的分布頻率不存在顯著的差異,即種群遺傳結(jié)構(gòu)不顯著。由此推測,鰳魚在更新世間冰期時可能形成了兩個不同的避難所,其中丹東群體形成一個避難所,其它不同的所有群體可能相互混合在一起,形成了另外一個避難所,因此沒能夠形成顯著的遺傳分化以及譜系結(jié)構(gòu)。2.從遺傳學和形態(tài)學兩方面對16個群體125尾鰳魚的可量性狀和可數(shù)性狀特征進行了分析,并探討尾鰭對稱和不對稱的兩種鰳魚的親緣關(guān)系。結(jié)果顯示,兩種鰳魚除了尾鰭不對稱有極顯著的差異,其它的可量、可數(shù)性狀的特征不存在顯著差異。從分子遺傳學方面,對形態(tài)學特征不同的兩種鰳魚的線粒體dna完整的控制區(qū)d-loop片段序列進行序列比較分析,結(jié)果顯示這兩種鰳魚的遺傳距離僅為2.7%,屬于種內(nèi)遺傳距離,重建的raxml系統(tǒng)發(fā)育樹,也顯示這兩種形態(tài)學特征的鰳魚混在一起,親緣關(guān)系很近,也并不存在顯著差異。3.對125尾鰳魚個體d-loop研究,其結(jié)果顯示,鰳魚群體遺傳多樣性水平較高(h=0.98;π=0.006),將丹東鰳魚群體剔除掉之后做的amova分析結(jié)果表明,大部分的遺傳變異來源于群體內(nèi)部,僅有丹東的遺傳變異來自于群體之間。從鰳魚群體間遺傳分化多樣性指數(shù)Φst值(Φst=0.06118)顯示在鰳魚群體的分布范圍,也不存在顯著的遺傳結(jié)構(gòu)。但是鰳魚群體間存在一定的地理隔離模式(r=0.0591;p=0.0060)。從核苷酸錯配分布分析結(jié)果和中性檢驗看,推測太平洋西部鰳魚群體在更新世間冰期經(jīng)歷了群體擴張事件,不同的群體在經(jīng)歷群體擴張時匯合在一起,發(fā)生了一定程度的基因交流,因此不同的群體間的遺傳分化不是很明顯。4.單核苷酸多態(tài)性(snp)分子標記結(jié)合二代測序技術(shù)是研究群體遺傳學強有力的工具,同時也是界定物種的最佳方法。靶基因富集的方法可以用來豐富不同物種的同源片段,我們發(fā)現(xiàn),通過一套通用的的脊椎動物的單拷貝核基因標記,可以獲取日本涽魚(鱭屬)成千上萬個snps位點,這些涽魚來自于三個取樣位點:靠近長江入?诘难睾5貐^(qū),長江干流和洞庭湖,與長江中游相連的一個湖泊。我們的研究表明,基因富集可以用來獲得snps數(shù)據(jù)。
【學位授予單位】:上海海洋大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:S917.4
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2639980
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