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腳木足河魚類資源現(xiàn)狀和代表性物種遺傳多樣性及遺傳變異研究

發(fā)布時(shí)間:2020-04-15 01:21
【摘要】:通過2016年和2017年連續(xù)兩年調(diào)查,對(duì)腳木足河的魚類資源現(xiàn)狀進(jìn)行了研究,同時(shí)分析了川陜哲羅鮭和大渡軟刺裸裂尻線粒體DNA控制區(qū)序列,旨在了解其種群的遺傳背景,為種質(zhì)資源的有效保護(hù)提供參考依據(jù),得出主要研究結(jié)論如下:在腳木足河共采集到魚類11種,隸屬3目4科6屬。其中,鯉形目的種類最多,有8種,占種類總數(shù)的72.73%;鲇形目2種;鮭形目1種。大渡軟刺裸裂尻魚、齊口裂腹魚和麻柯河高原鰍為腳木足河魚類的優(yōu)勢(shì)種,分別占到漁獲總數(shù)的29.54%、27.94%和13.77%。青石爬洝、黃石爬洝、斯氏高原鰍、東方高原鰍和紅尾副鰍等為調(diào)查河段常見種,川陜哲羅鮭為稀有種。魚類組成在河流沿程分布上無明顯的區(qū)別,但不同河段的魚類資源量和漁獲物的個(gè)體大小存在較明顯差異。受人類活動(dòng)干擾較小的柯河鄉(xiāng)至射江村河段魚類資源相對(duì)豐富,漁獲個(gè)體較大,也是川陜哲羅鮭的核心分布區(qū)。人類活動(dòng)導(dǎo)致川陜哲羅鮭等魚類的棲息地逐漸萎縮,其棲息地?fù)p失率超過90%,腳木足河是其在大渡河流域的最后的分布區(qū),該物種已處于瀕危狀態(tài)。腳木足河魚類可劃分為三大區(qū)系,分別為北方山地區(qū)系復(fù)合體、中亞山地區(qū)系復(fù)合體和南方山地區(qū)系復(fù)合體。其中,中亞山地區(qū)系復(fù)合體魚類種類最多。腳木足河魚類大多適應(yīng)激流生活,流態(tài)需求較為單一?煞譃榱魉ㄏ额惾、流水吸附類群、流水底層類群和流水中、上層類群。魚類產(chǎn)卵類型可劃分為沉性卵、粘性卵和浮性卵三類,其中,產(chǎn)粘性卵魚類相對(duì)較多。川陜哲羅鮭、齊口裂腹魚、重口裂腹魚和大渡軟刺裸裂尻魚等具有短距離生殖洄游的習(xí)性。對(duì)腳木足河主要經(jīng)濟(jì)魚類種群結(jié)構(gòu)分析表明,大渡軟刺裸裂尻魚種群的年齡組成為2~8齡,優(yōu)勢(shì)年齡組為4~5齡;齊口裂腹魚種群年齡組成為2~10齡,3~4齡為優(yōu)勢(shì)年齡組;重口裂腹魚種群年齡組成為2~6齡,3~4齡為優(yōu)勢(shì)年齡組。大渡軟刺裸裂尻魚、齊口裂腹魚、重口裂腹魚和青石爬洝等魚類的體長和體重呈冪函數(shù)關(guān)系。選取特有魚類大渡軟刺裸裂尻魚和川陜哲羅鮭進(jìn)行遺傳多樣性研究。72尾大渡軟刺裸裂尻魚個(gè)體中一共檢測(cè)出19個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)(S),單倍型個(gè)數(shù)(H)為36,單倍型多樣度為(Hd)0.969,核苷酸多樣度為(Pi)0.01393,平均核苷酸變異數(shù)(K)為3.42684,其單倍型多樣度指數(shù)核苷酸多樣度指數(shù)均處于較高的水平。說明目前腳木足河流域大渡軟刺裸裂尻野生種群還處于遺傳多樣性較高的狀態(tài)。通過系統(tǒng)進(jìn)化樹分析大渡軟刺裸裂尻魚72個(gè)個(gè)體分成了2個(gè)分支,推測(cè)腳木足河流域的大渡軟刺裸裂尻魚種群可能來源于2個(gè)不同遺傳背景的祖先。川陜哲羅鮭15個(gè)個(gè)體中一共出現(xiàn)了1個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)(S),單倍型個(gè)數(shù)(H)為2,單倍型多樣度為(Hd)0.133,核苷酸多樣度為(Pi)0.00023,平均核苷酸變異數(shù)(K)為0.13333,其單倍型多樣度和核苷酸多樣度都處于極低水平。本研究表明,無論從種群數(shù)量還是遺傳多樣性考慮,川陜哲羅鮭都處于亟待保護(hù)的地位,建議作為腳木足河流域的優(yōu)先保護(hù)物種。本研究進(jìn)一步對(duì)川陜哲羅鮭進(jìn)行了RAD(restriction association site DNA)高通量測(cè)序,產(chǎn)生的Clean data在2.08G-2.61 G之間,測(cè)序質(zhì)量情況為Q20≥97.25%、Q30≥92.98%,GC含量41.97%,測(cè)序深度達(dá)到了10×以上,以上說明RAD測(cè)序的結(jié)果準(zhǔn)確可靠。此外,本次測(cè)序在川陜哲羅鮭3個(gè)個(gè)體中平均檢測(cè)到690559個(gè)SNP位點(diǎn),雜合位點(diǎn)所占比例平均為50.77%。本研究通過對(duì)腳木足河流域3個(gè)川陜哲羅鮭個(gè)體進(jìn)行RAD簡化基因組測(cè)序,得到了較高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù),獲得了大量潛在的SNP標(biāo)記,為今后SNP標(biāo)記的開發(fā)、群體遺傳結(jié)構(gòu)及進(jìn)化的研究、遺傳圖譜的構(gòu)建及重要性狀的QTL定位等奠定了理論基礎(chǔ)。
【圖文】:

分布圖,河魚,資源調(diào)查,采樣點(diǎn)


腳木足鄉(xiāng)、雙江口河段共設(shè)置5個(gè)采樣點(diǎn)。漁獲物調(diào)查時(shí),以5個(gè)采樣點(diǎn)為中心,在各點(diǎn)上、下游約10km的河段內(nèi)開展。圖2-1 腳木足河魚類資源調(diào)查采樣點(diǎn)分布圖Fig. 2-1 The sampling locations of fish resources investigation in the Jiaomuzu River(3)資料收集通過實(shí)地踏勘、走訪等方式,,獲取資料。從相關(guān)專業(yè)主管部門收集調(diào)查流域自

河魚,豐度,百分比,哲羅鮭


高原鰍和紅尾副鰍等為常見種,分別占樣本總數(shù)的4.59%、3.99%、5.10%、3.59%、和4.19%;細(xì)尾高原鰍數(shù)量較少,川陜哲羅鮭為調(diào)查河段稀有種,其所占比例僅有1.2%(如圖2-2)。圖2-2 腳木足河魚類豐度百分比組成Fig. 2-2 Abundance percentage of fish in the Jiaomuzu River從漁獲物生物量來看,川陜哲羅鮭所占比重最大,其占到漁獲物總量47.27%,雖然川陜哲羅鮭漁獲數(shù)量不多,捕獲個(gè)體均較大,因此導(dǎo)致其所占生物量比重較高;其次為齊口裂腹魚、大渡軟刺裸裂尻魚和重口裂腹魚,分別占到漁獲總量的32.26%、
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S917.4

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2627959

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