【摘要】：目前國內(nèi)的凡納濱對(duì)蝦親蝦主要來自于國外。我國是養(yǎng)殖凡納濱對(duì)蝦的大國,但因苗種品質(zhì)、養(yǎng)殖不當(dāng)、資金問題等問題,災(zāi)害頻發(fā)等因素,養(yǎng)殖效益虧損至今影響著我國凡納濱對(duì)蝦產(chǎn)業(yè)體系的健康發(fā)展。為了保護(hù)與開發(fā)種質(zhì)資源,獲得具有優(yōu)良性狀的新品種。本文對(duì)子一代的群體進(jìn)行了遺傳背景分析,種質(zhì)資源鑒定,并對(duì)一些SSR進(jìn)行生長相關(guān)性檢驗(yàn),篩選了一些與生長相關(guān)的EST-SSR標(biāo)記。并對(duì)部分分子標(biāo)記進(jìn)行了體重相關(guān)性檢驗(yàn)。確定群體母系關(guān)系。通過對(duì)比不同個(gè)體mtDNA控制區(qū)部分序列,獲得(VG2Z,VNZ,OSZ,NSZ)4個(gè)群體的母系遺傳關(guān)系,依最大似然法的遺傳距離比較不同母本間的變異與進(jìn)化。211條序列平均長度604bp,共檢測(cè)到232個(gè)簡約信息位點(diǎn)。14個(gè)缺失。358個(gè)保守位點(diǎn).281個(gè)突變。232個(gè)點(diǎn)突變中,共檢測(cè)到14個(gè)缺失/插入,28轉(zhuǎn)換,36置換。一共檢測(cè)到14個(gè)單倍型,其中27個(gè)親本,共檢測(cè)到14個(gè)單倍型。子一代VG1Z84個(gè)樣本,共檢測(cè)到12個(gè)單倍型。親代群體單倍型多樣性指數(shù)0.8950,核苷酸多樣性指數(shù)0.1100,平均核苷酸差異數(shù)K65.1。子一代群體單倍型多樣性指數(shù)0.7980,核苷酸多樣性指數(shù)0.1028,平均核苷酸差異數(shù)K60.6。最大似然法計(jì)算遺傳距離,親代(母方)群體內(nèi)遺傳距離0.156,子代群體內(nèi)遺傳距離0.134,兩代群體間遺傳距離0.144。比較親代(母方)與其子代的序列,親代(母方)的Hd、pi、k、PL值大于子一代。說明F1群體的遺傳多樣性減小。27個(gè)親代(母方)中有5個(gè)親代(母方)共3單倍型未在F1檢測(cè)到。子一代群體中檢測(cè)到1個(gè)新的單倍型Hap_8。Hap_8與Hap_7相比,發(fā)生了2個(gè)轉(zhuǎn)換和1個(gè)插入,該變異位點(diǎn)發(fā)生在非編碼區(qū),發(fā)生了點(diǎn)突變的個(gè)體來自于OS群體的自交后代。輔以繁殖數(shù)據(jù),一對(duì)一一共確認(rèn)了8個(gè)母本。以11對(duì)微衛(wèi)星對(duì)子代9個(gè)群體的遺傳多樣性評(píng)價(jià)。11個(gè)SSR在9個(gè)子一代群體中共檢測(cè)到51個(gè)等位基因。等位基因數(shù)30~50,有效等位基因數(shù)Ne 22.09~28.39,觀測(cè)雜合度Ho 0.32~0.60,期望雜合度He 0.48~0.63。群體內(nèi)近交系數(shù)fis-0.2~0.37。雜交群體Shannon index指數(shù)0.94,小于自交群體1.13,由高到低依次順序?yàn)?自交群體親代群體雜交群體。與自交群體相比,雜交群體的多樣性并沒有提高。VNZ與G2Z群體固定指數(shù)F分別為-0.2,-0.08,為負(fù)值。其他群體為正值。顯示了G2Z和VNZ雜合子過量與總?cè)后w水平雜合子缺失的現(xiàn)狀。9個(gè)群體在11個(gè)SSR總體水平上的PIC范圍0.40~0.59。總體呈中高度多態(tài)。總?cè)后w水平近交系數(shù)Fit由高到低順序?yàn)?親代群體雜交群體自交群體。親代群體Na與自交后代相比,OSZ,NSZ,G1Z,G2Z分別小于OSQ,NSQ,G1Q,G2Q群體,顯示親代群體一些稀有等位基因在子代中丟失。V101Z(Na)大于V101Q(Na),這可能發(fā)生了變異或多出的等位基因來源于父本。比較自交群體與親代群體Ne與He,結(jié)果表明自交群體與對(duì)應(yīng)親代群體的遺傳多樣性差異不明顯。以Nei's遺傳距離繪制UPGMA進(jìn)化樹,結(jié)果表明:9個(gè)群體間的遺傳距離0.0685~0.6065。VNZ與OSZ遺傳距離最短,優(yōu)先合為一支。G2G1Z與VG2Z合為一支后與VG1Z、NSZ匯合,之后與VNZ和OSZ合為一支,與G1Z和G2Z融合,最后與V101Z融合。V101Z與其他8個(gè)群體的遺傳距離都相對(duì)較遠(yuǎn)。將多態(tài)性良好的EST-SSR引物的基因型與凡納濱對(duì)蝦生長性狀相關(guān)聯(lián)。采用一般線性模型與最小二乘關(guān)聯(lián)性分析,發(fā)現(xiàn)在VG2Z中,利用一般線性模型和最小二乘方差分析,共獲得4個(gè)微衛(wèi)星與生長性狀顯著相關(guān)。,其中V-16與飽滿度顯著性相關(guān)(P=0.10),LVE66F與體重極顯著性相關(guān)(P0.1)。V-6與LVE16F與體重顯著性相關(guān)(0.10P0.05)。其他標(biāo)記與體重和飽滿度無關(guān)。通過Duncan多重比對(duì)結(jié)果發(fā)現(xiàn)LVE16F、LVE70F、V-6各基因型在VG2Z中與體重不存在線性關(guān)系,LVE66F中BD基因型個(gè)體的體重顯著大于AB/BB/BF個(gè)體的體重。但在其他群體中,LVE66F與體重和飽滿度相關(guān)性不顯著(P0.05)。用主體間效應(yīng)模型檢驗(yàn)12個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記與體重、飽滿度的相關(guān)性,確定LVE16F與LVE70F在4個(gè)群體中與體重或飽滿度顯著性相關(guān)(P0.05)。對(duì)LVE16F與LVE70F進(jìn)行duncan’s多重平均值分析結(jié)果表明:LVE16F、LVE70F各基因型在VG2Z中與體重不存在線性關(guān)系,在VNZ中,LVE70F的AB基因型的個(gè)體平均體重顯著大于AA基因型的個(gè)體。LVE16F的AA,BB的個(gè)體的體重和飽滿度顯著大于CC,BC的個(gè)體,AA基因型的個(gè)體的體重和飽滿度顯著大于AB基因型的個(gè)體。LVE70F和LVE16F在VNZ中與體重和飽滿度存在明顯的線性關(guān)系。G2Z中,LVE70F,AB,BB個(gè)體體重顯著大于BC,CC。AA,AB,BB個(gè)體的體重顯著大于CC,CC基因型個(gè)體的飽滿度顯著小于AA,AB,BB個(gè)體的飽滿度。LVE16F,AC基因型的個(gè)體的體重顯著大于BC基因型體重。V101Z中,LVE70F,AB,BB,AB個(gè)體的體重顯著大于BC個(gè)體,AA個(gè)體的飽滿度顯著大于BC個(gè)體。LVE16F中,AC基因型的個(gè)體體重與飽滿度顯著大于BC個(gè)體。LVE16F與LVE70F的等位基因C為隱性,存在C的個(gè)體體重比較小。綜上所述,本文為凡納濱對(duì)蝦人工育種群體的種質(zhì)檢測(cè),與生長相關(guān)分子標(biāo)記的選擇提供了一些的理論依據(jù),在生產(chǎn)中具有一定的指導(dǎo)意義。
【學(xué)位授予單位】：上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：S917.4

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4 周歧存,丁q，

本文編號(hào)：2615187