為建立刺五加轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫、獲得三萜皂苷高含量組(B)與低含量組(M)刺五加間差異性表達基因以及法尼基焦磷酸合酶基因(FPS)全長,采用Illumina Hi Seq 4000測序平臺的二代測序技術(shù)、生物信息學(xué)方法、PCR和熱不對稱交錯PCR(TAIL-PCR)技術(shù)進行研究,并取得了以下主要結(jié)果:1)刺五加轉(zhuǎn)錄組共有8.34 Gb,77087條Unigenes,總長52940804 nt,平均長度為687 nt,N50長度為1207 nt。與7個基因數(shù)據(jù)庫進行比對,有29348條Unigenes獲得注釋信息,其中與葡萄的同源性最高;歸于55個GO分類和24個COG分類;涉及到116個KEGG標(biāo)準(zhǔn)代謝途徑。預(yù)測出59098條CDSs、5028個SSRs以及162831個SNPs。2)篩選出差異性表達基因530條,上調(diào)基因有223條,下調(diào)基因307條。與GO、COG和KEGG進行比對,共有434條基因獲得注釋。3)FPS全長為7952 bp,A/T含量64.29%。FPS轉(zhuǎn)錄起始位點為G,位于起始密碼子ATG上游117 bp處,含有12個外顯子和11個內(nèi)含子。啟動子中有120個順式作用元件,分...

【文章頁數(shù)】：93 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1四環(huán)三萜皂苷化學(xué)結(jié)構(gòu)

基；母核的17位上有1個有8個碳原子組成的側(cè)鏈（圖1）。圖1四環(huán)三萜皂苷化學(xué)結(jié)構(gòu)Fig.1Thechemicalstructureoftetracyclictriterpenoidsaponins五環(huán)三萜皂苷類是中藥材中比較常見的生物活性物質(zhì)，根據(jù)苷....

圖2五環(huán)三萜皂苷化學(xué)結(jié)構(gòu)

圖2五環(huán)三萜皂苷化學(xué)結(jié)構(gòu)2Thechemicalstructureofpentacyclictriterpenoids代謝產(chǎn)物具有很好的藥理功效與生物活性固醇、護肝等，還可增強植物抗病、抗蟲三萜皂苷可以抑制腫瘤。目前，已在刺五用植物中分離提取出具有抑制腫瘤的三萜....

圖3三萜皂苷生物合成途徑[75]

圖3三萜皂苷生物合成途徑[75]Fig.3TriterpenoidSaponinsBiosynthesis[75]釋見附錄。1999年時，法國科學(xué)家MichelRohmer在細菌、綠藻以及高等植物的萜類化合物合成途徑[77]，隨后因其重要的中間體為2-C-甲....

圖6Contigs長度分布

圖6Contigs長度分布Fig.6Contigslengthdistribution數(shù)量

本文編號：4012333