基于高密度遺傳圖譜定位新的水稻抽穗期QTLs
發(fā)布時間:2024-05-20 22:03
【目的】挖掘新的控制水稻抽穗期的QTLs,為水稻花期調(diào)控的遺傳機(jī)理研究和分子育種提供新的基因資源!痉椒ā恳远i稻品種特秈占空間誘變突變體CHA-1和秈稻航恢7號空間誘變突變體H335為親本進(jìn)行雜交,構(gòu)建包含275個株系的重組自交系(RIL)作圖群體,利用由兩親本重測序及RIL群體簡化基因組測序所構(gòu)建的高密度遺傳圖譜,在2個環(huán)境下進(jìn)行水稻抽穗期QTL定位!窘Y(jié)果】經(jīng)兩親本重測序及RIL群體簡化基因組測序,構(gòu)建了包含2 498個Bin標(biāo)記的高密度遺傳圖譜。該圖譜覆蓋水稻12條染色體,各染色體標(biāo)記數(shù)平均208.17,標(biāo)記間平均遺傳距離為0.95 cM。在2個環(huán)境下共定位到4個影響抽穗期的QTLs,分布于第3、第6和第8號染色體,其中qHD-6和qHD-8-1位于前人已報(bào)道定位的區(qū)域并被克隆,另外2個QTLs(qHD-3和qHD-8-2)尚未見報(bào)道,并且qHD-8-2能在2個環(huán)境中被重復(fù)檢測到,貢獻(xiàn)率分別為8.30%和10.89%。【結(jié)論】通過構(gòu)建的高密度遺傳圖譜在2個環(huán)境中共檢測到4個影響抽穗期的QTLs,其中qHD-3和qHD-8-2是新的抽穗期QTL位點(diǎn),可用于后續(xù)抽穗期調(diào)控基因的精細(xì)定...
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
本文編號:3979184
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圖1秈稻RIL及親本CHA-1、H335抽穗期表型分布
本研究利用GBS方法對CHA-1/H335的275個株系進(jìn)行測序,根據(jù)子代重組情況進(jìn)行Bin劃分,篩除偏分離標(biāo)記后構(gòu)建了一張包含2498個分子標(biāo)記、全長為2371.84cM(表2)、覆蓋水稻全基因組12條染色體(Ch1~Ch12)的連鎖圖譜(圖2)。每條染色體標(biāo)記數(shù)為138....
圖2秈稻遺傳標(biāo)記在染色體上的分布及QTL位置
表2秈稻CHA-1/H335的RIL群體連鎖圖譜的基本信息Table2InformationofmolecularontheRILlinkagemapderivedfromindicaCHA-1/H335連鎖群Linkagegroup上圖標(biāo)記數(shù)T....
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