株高和穗位高是玉米株型的重要影響因子,與產(chǎn)量性狀緊密相關(guān)。加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(weightedgene co-expression network analysis, WGCNA)是探索基因網(wǎng)絡(luò)與特定性狀間關(guān)聯(lián)關(guān)系的重要方法,為株高和穗位高相關(guān)基因的挖掘提供新途徑。本研究利用鄭58、掖478、昌7-2和黃早四及其組配的雜交種鄭單958、安玉5號(hào)、鄭58/黃早四和掖478/黃早四,結(jié)合其在45,000株hm^–2和67,500株hm^–2條件下的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),采用WGCNA構(gòu)建了2種密度條件下的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),分別得到24個(gè)和21個(gè)共表達(dá)模塊,并鑒定到與株高和穗位高顯著且高度相關(guān)(相關(guān)系數(shù)的絕對(duì)值>0.50)的共表達(dá)模塊15個(gè),其中兩性狀相同的模塊共6個(gè)�；蚬δ芨患治鼋Y(jié)果表明,株高和穗位高共表達(dá)模塊主要參與生長(zhǎng)發(fā)育、光合作用、響應(yīng)光刺激、植物激素、碳水化合物合成/代謝等重要活動(dòng)。根據(jù)模塊內(nèi)基因的連接度,發(fā)現(xiàn)乙烯響應(yīng)因子EREB14、硫胺素酶TENA2、磷酸甘油酸激酶PGK、谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶GST2和琥珀酸脫氫酶SUDH7等是模塊內(nèi)的核心基因。...

【文章頁數(shù)】：10 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)
    1.2 加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
    1.3 株高和穗位高顯著關(guān)聯(lián)模塊的鑒定和基因功能分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 兩種密度條件下8個(gè)材料株高和穗位高的表現(xiàn)
    2.2 基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
    2.3 株高和穗位顯著相關(guān)的共表達(dá)模塊及其功能注釋
    2.4 顯著共表達(dá)模塊的核心基因和已報(bào)道株高基因的基因網(wǎng)絡(luò)
3 討論
4 結(jié)論



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