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黃淮麥區(qū)部分小麥品種(系)重要產(chǎn)量相關(guān)性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2023-04-21 04:37
  全基因組關(guān)聯(lián)分析是以LD為基礎(chǔ),鑒定植物性狀與目標(biāo)基因之間關(guān)系的技術(shù)。本試驗(yàn)以52個(gè)黃淮麥區(qū)品種(系)為材料,統(tǒng)計(jì)兩年多點(diǎn)株高(PH)、穗長(zhǎng)(SL)、單株穗數(shù)(SNP)、可育小穗數(shù)(FSS)、穗粒數(shù)(GPS)、千粒重(TKW)6個(gè)重要產(chǎn)量相關(guān)性狀數(shù)據(jù),分析種質(zhì)遺傳多樣性和群體遺傳結(jié)構(gòu),并與覆蓋全基因組的248個(gè)SSRs(Simple Sequence Repeats)、SNPs(Single Nucleotide Polymorphisms)標(biāo)記進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果如下:1.表型分析顯示,小麥材料的6個(gè)性狀差異均達(dá)到顯著水平(P<0.01)。地區(qū)間,產(chǎn)量由河南、江蘇、陜西遞減,六個(gè)重要產(chǎn)量性狀這三地趨勢(shì)基本一致;性狀間,不同性狀情況不同,穗長(zhǎng)和單株穂數(shù)均值和變幅系數(shù)最大,可育小穗數(shù)和穗粒數(shù)次之,千粒重和株高的均值和變幅差別最小。2.通過(guò)基因型分析,共檢測(cè)到了899個(gè)等位變異,平均等位變異豐富度為3.625,遺傳多樣性指數(shù)變化范圍為0.301到0.715,平均值為0.586;多態(tài)性信息含量(PIC)平均值為0.510,達(dá)到高度多態(tài)(PIC≥0.5)水平。3.群體遺傳結(jié)構(gòu)分析及聚類分...

【文章頁(yè)數(shù)】:49 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 分子標(biāo)記研究進(jìn)展
    1.2 遺傳多樣性研究
        1.2.1 遺傳多樣性研究的意義
        1.2.2 小麥遺傳多樣性研究的方法
    1.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析
        1.3.1 連鎖不平衡(Linkagedisequilibrium,LD)
        1.3.2 全基因組關(guān)聯(lián)分析的方法和步驟
        1.3.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析的應(yīng)用
    1.4 本研究的主要內(nèi)容與目的意義
        1.4.1 研究的目的及意義
        1.4.2 主要研究?jī)?nèi)容
第二章 材料與方法
    2.1 供試材料
    2.2 田間種植
    2.3 表型性狀調(diào)查
    2.4 小麥基因組DNA的提取及質(zhì)控
        2.4.1 基因組DNA提取
        2.4.2 DNA質(zhì)量檢測(cè)與控制
    2.5 SSR分析和電泳檢測(cè)
        2.5.1 SSR引物的篩選
        2.5.2 PCR反應(yīng)
        2.5.3 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)
    2.6 SNP分析和檢測(cè)
        2.6.1 SNP引物的篩選
        2.6.2 PCR反應(yīng)
        2.6.3 SNP基因分型
    2.7 數(shù)據(jù)分析
        2.7.1 表型數(shù)據(jù)分析
        2.7.2 遺傳多樣性分析
        2.7.3 聚類分析
        2.7.4 群體結(jié)構(gòu)分析
        2.7.5 親緣關(guān)系分析
        2.7.6 全基因組關(guān)聯(lián)分析
第三章 結(jié)果與分析
    3.1 產(chǎn)量性狀表型統(tǒng)計(jì)結(jié)果
    3.2 標(biāo)記遺傳多樣性結(jié)果
    3.3 聚類結(jié)果與分析
    3.4 群體結(jié)構(gòu)結(jié)果
    3.5 全基因組關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
第四章 討論
    4.1 小麥品種遺傳多樣性分析
    4.2 分子標(biāo)記的遺傳多樣性分析
    4.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附表
致謝
作者簡(jiǎn)介



本文編號(hào):3795849

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