玉米泛素結(jié)合酶基因家族分析及低氮脅迫下亞家族UBC2的表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2023-04-17 05:32
泛素結(jié)合酶是泛素/蛋白酶體途徑的重要組成部分,在蛋白質(zhì)的泛素化過(guò)程中具有重要作用。本研究利用生物信息學(xué)對(duì)玉米泛素E2家族成員進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化及基因結(jié)構(gòu)分析。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示,玉米泛素結(jié)合酶基因可分為6個(gè)亞家族,各亞家族成員數(shù)目差異較大;驍(shù)目最多的亞家族是UBC1,為22個(gè)。成員數(shù)最少的是UBC3,僅為5個(gè)。以亞家族UBC2為研究對(duì)象,發(fā)現(xiàn)UBC2中一共存在4對(duì)旁系同源基因,分別是ZmUBC3/ZmUBC70、ZmUBC8/ZmUBC34、ZmUBC31/ZmUBC53以及ZmUBC45/ZmUBC66。對(duì)UBC2中成員進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),互為旁系同源的基因其基因結(jié)構(gòu)相似。ZmUBC45/ZmUBC66含有外顯子數(shù)量最多,為9個(gè),而ZmUBC31/ZmUBC53外顯子含量最小,僅為4個(gè);蚧蚍治鼋Y(jié)果顯示,ZmUBC3/ZmUBC70含有基序數(shù)量最多(8個(gè)),ZmUBC8/ZmUBC34與ZmUBC31/ZmUBC53基序含量最小(均為3個(gè));騿(dòng)子作用元件分析顯示,泛素E2基因啟動(dòng)子元件類型可分為光響應(yīng)、激素響應(yīng)和脅迫響應(yīng)元件、組織表達(dá)相關(guān)元件以及周期性調(diào)控相關(guān)元件5大類。基因...
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料及處理方法
1.2 玉米泛素結(jié)合酶基因的基因結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)進(jìn)化分析
1.3 玉米泛素E2基因家族成員啟動(dòng)子作用元件分析
1.4 不同組織器官的表達(dá)模式分析
1.5 低氮脅迫下泛素E2家族基因成員的表達(dá)分析
1.6 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
2.1 玉米泛素結(jié)合酶蛋白家族的系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.2 玉米泛素結(jié)合酶家族基因的啟動(dòng)子作用元件分析
2.3 玉米E2基因在不同組織的表達(dá)分析
2.4 玉米E2基因在不同氮形態(tài)脅迫下的表達(dá)分析
3 討論
本文編號(hào):3792671
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1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料及處理方法
1.2 玉米泛素結(jié)合酶基因的基因結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)進(jìn)化分析
1.3 玉米泛素E2基因家族成員啟動(dòng)子作用元件分析
1.4 不同組織器官的表達(dá)模式分析
1.5 低氮脅迫下泛素E2家族基因成員的表達(dá)分析
1.6 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
2.1 玉米泛素結(jié)合酶蛋白家族的系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.2 玉米泛素結(jié)合酶家族基因的啟動(dòng)子作用元件分析
2.3 玉米E2基因在不同組織的表達(dá)分析
2.4 玉米E2基因在不同氮形態(tài)脅迫下的表達(dá)分析
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