陸地棉產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀的雜種優(yōu)勢(shì)QTL定位與遺傳基礎(chǔ)研究
發(fā)布時(shí)間:2023-01-30 17:06
棉花是世界上種植最廣泛的可再生天然紡織來源,棉花纖維產(chǎn)量和品質(zhì)的遺傳改良是棉花育種工作的首要目標(biāo)。棉花產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀均為數(shù)量性狀,遺傳基礎(chǔ)復(fù)雜,且具有較強(qiáng)的雜種優(yōu)勢(shì)。本研究利用Cotton 63K Illumina SNP芯片,基于來自陸地棉品種間雜交組合(HS46×MARCABUCAG8US-1-88)的188個(gè)陸地棉重組自交系(RIL),構(gòu)建了具有超高密度的陸地棉種內(nèi)遺傳圖譜,并在RIL群體以及在RIL群體和其親本的基礎(chǔ)上構(gòu)建的永久F2(IF2)和回交Fi群體(BCF1)中,同時(shí)使用復(fù)合區(qū)間作圖法和完備區(qū)間作圖法對(duì)陸地棉產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀進(jìn)行QTL定位、雜種優(yōu)勢(shì)的遺傳和QTL遺傳效應(yīng)解析,主要結(jié)果如下:(1)陸地棉SNP高密度遺傳圖譜的構(gòu)建基于陸地棉RIL群體使用Cotton 63K SNP芯片構(gòu)建了一張包含2618個(gè)多態(tài)性SNP標(biāo)記,總長度為1784.28cM,密度為0.68cM的高密度遺傳圖譜;遺傳圖譜中的大多數(shù)SNP位點(diǎn)與它們?cè)陉懙孛尬锢韴D譜中相應(yīng)染色體上的順序相一致,與物理圖譜具有較好的共線性;在所有上圖的標(biāo)記中,有13.29%的標(biāo)記顯著偏離1:1的分離比,其中大多數(shù)偏...
【文章頁數(shù)】:243 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
縮略詞表
第一部分 文獻(xiàn)綜述
1.1 雜種優(yōu)勢(shì)遺傳基礎(chǔ)研究及其假說
1.2 雜種優(yōu)勢(shì)機(jī)理研究與分子數(shù)量遺傳學(xué)
1.2.1 分子標(biāo)記(Molecular marker)技術(shù)
1.2.2 分子標(biāo)記的類型及特點(diǎn)
1.2.2.1 基于雜交技術(shù)的分子標(biāo)記
1.2.2.2 基于PCR技術(shù)的分子標(biāo)記
1.2.2.3 基于測序技術(shù)的分子標(biāo)記
1.2.2.4 基于芯片技術(shù)的分子標(biāo)記
1.2.3 作圖群體類型
1.2.3.1 初級(jí)作圖群體
1.2.3.2 次級(jí)作圖群體
1.2.4 棉花遺傳圖譜研究進(jìn)展
1.2.5 QTL定位與雜種優(yōu)勢(shì)
1.2.5.1 QTL定位研究方法
1.2.5.2 棉花產(chǎn)量和纖維品質(zhì)QTL定位研究進(jìn)展
1.2.5.3 利用BCF_1和IF_2群體研究雜種優(yōu)勢(shì)QTL
1.3 棉花雜種優(yōu)勢(shì)機(jī)理研究進(jìn)展
1.4 本研究的目的和意義
第二部分 研究報(bào)告
2.1 材料和方法
2.1.1 試驗(yàn)材料
2.1.1.1 遺傳圖譜構(gòu)建材料
2.1.1.2 雜種優(yōu)勢(shì)QTL定位及遺傳分析材料
2.1.2 田間種植和表型測定
2.1.3 SNP圖譜構(gòu)建
2.1.3.1 基因組DNA提取
2.1.3.2 SNP芯片雜交
2.1.3.3 SNP基因分型
2.1.3.4 遺傳圖譜構(gòu)建
2.1.3.5 偏分離標(biāo)記檢測
2.1.3.6 共線性分析
2.1.4 數(shù)據(jù)分析
2.1.4.1 表型數(shù)據(jù)分析
2.1.4.2 QTL定位及效應(yīng)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 遺傳圖譜構(gòu)建
2.2.1.1 圖譜構(gòu)建
2.2.1.2 偏分離位點(diǎn)
2.2.1.3 共線性分析
2.2.2 陸地棉產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀的雜種優(yōu)勢(shì)表現(xiàn)
2.2.2.1 產(chǎn)量和產(chǎn)量構(gòu)成因子
2.2.2.2 纖維品質(zhì)性狀
2.2.3 陸地棉產(chǎn)量和纖維品質(zhì)的遺傳率分析
2.2.3.1 產(chǎn)量和產(chǎn)量構(gòu)成因子性狀
2.2.3.2 纖維品質(zhì)性狀
2.2.4 陸地棉產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀相關(guān)性分析
2.2.4.1 產(chǎn)量性狀間的相關(guān)性
2.2.4.2 纖維品質(zhì)性狀間的相關(guān)性
2.2.4.3 產(chǎn)量性狀與纖維品質(zhì)性狀間的相關(guān)性
2.2.5 單位點(diǎn)QTL定位
2.2.5.1 產(chǎn)量性狀單位點(diǎn)QTL定位
2.2.5.2 產(chǎn)量性狀雜種優(yōu)勢(shì)單位點(diǎn)QTL定位
2.2.5.3 產(chǎn)量性狀QTL效應(yīng)分析
2.2.5.4 纖維品質(zhì)性狀單位點(diǎn)QTL定位
2.2.5.5 纖維品質(zhì)性狀雜種優(yōu)勢(shì)單位點(diǎn)QTL定位
2.2.5.6 纖維品質(zhì)性狀QTL效應(yīng)分析
2.2.6 m-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.6.1 產(chǎn)量性狀m-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.6.2 產(chǎn)量性狀雜種優(yōu)勢(shì)m-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.6.3 纖維品質(zhì)性狀m-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.6.4 纖維品質(zhì)性狀雜種優(yōu)勢(shì)m-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.7 e-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.7.1 產(chǎn)量性狀e-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.7.2 產(chǎn)量性狀雜種優(yōu)勢(shì)e-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.7.3 纖維品質(zhì)性狀e-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.7.4 纖維品質(zhì)性狀雜種優(yōu)勢(shì)e-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.8 單位點(diǎn)QTL和m-QTL的一致性分析
2.2.8.1 產(chǎn)量性狀單位點(diǎn)QTL和m-QTL的一致性分析
2.2.8.2 纖維品質(zhì)性狀單位點(diǎn)QTL和m-QTL一致性分析
2.3 討論
2.3.1 關(guān)于陸地棉SNP遺傳圖譜
2.3.2 RIL、IF_2和BCF_1群體在雜種優(yōu)勢(shì)研究中的應(yīng)用
2.3.3 產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀加性QTLs的一致性和可靠性分析
2.3.4 產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀雜種優(yōu)勢(shì)位點(diǎn)的特征
2.3.5 產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀近交衰退和雜種優(yōu)勢(shì)遺傳基礎(chǔ)
2.3.6 標(biāo)記輔助育種的應(yīng)用對(duì)培育高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)陸地棉的影響
2.4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
本文編號(hào):3733275
【文章頁數(shù)】:243 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
縮略詞表
第一部分 文獻(xiàn)綜述
1.1 雜種優(yōu)勢(shì)遺傳基礎(chǔ)研究及其假說
1.2 雜種優(yōu)勢(shì)機(jī)理研究與分子數(shù)量遺傳學(xué)
1.2.1 分子標(biāo)記(Molecular marker)技術(shù)
1.2.2 分子標(biāo)記的類型及特點(diǎn)
1.2.2.1 基于雜交技術(shù)的分子標(biāo)記
1.2.2.2 基于PCR技術(shù)的分子標(biāo)記
1.2.2.3 基于測序技術(shù)的分子標(biāo)記
1.2.2.4 基于芯片技術(shù)的分子標(biāo)記
1.2.3 作圖群體類型
1.2.3.1 初級(jí)作圖群體
1.2.3.2 次級(jí)作圖群體
1.2.4 棉花遺傳圖譜研究進(jìn)展
1.2.5 QTL定位與雜種優(yōu)勢(shì)
1.2.5.1 QTL定位研究方法
1.2.5.2 棉花產(chǎn)量和纖維品質(zhì)QTL定位研究進(jìn)展
1.2.5.3 利用BCF_1和IF_2群體研究雜種優(yōu)勢(shì)QTL
1.3 棉花雜種優(yōu)勢(shì)機(jī)理研究進(jìn)展
1.4 本研究的目的和意義
第二部分 研究報(bào)告
2.1 材料和方法
2.1.1 試驗(yàn)材料
2.1.1.1 遺傳圖譜構(gòu)建材料
2.1.1.2 雜種優(yōu)勢(shì)QTL定位及遺傳分析材料
2.1.2 田間種植和表型測定
2.1.3 SNP圖譜構(gòu)建
2.1.3.1 基因組DNA提取
2.1.3.2 SNP芯片雜交
2.1.3.3 SNP基因分型
2.1.3.4 遺傳圖譜構(gòu)建
2.1.3.5 偏分離標(biāo)記檢測
2.1.3.6 共線性分析
2.1.4 數(shù)據(jù)分析
2.1.4.1 表型數(shù)據(jù)分析
2.1.4.2 QTL定位及效應(yīng)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 遺傳圖譜構(gòu)建
2.2.1.1 圖譜構(gòu)建
2.2.1.2 偏分離位點(diǎn)
2.2.1.3 共線性分析
2.2.2 陸地棉產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀的雜種優(yōu)勢(shì)表現(xiàn)
2.2.2.1 產(chǎn)量和產(chǎn)量構(gòu)成因子
2.2.2.2 纖維品質(zhì)性狀
2.2.3 陸地棉產(chǎn)量和纖維品質(zhì)的遺傳率分析
2.2.3.1 產(chǎn)量和產(chǎn)量構(gòu)成因子性狀
2.2.3.2 纖維品質(zhì)性狀
2.2.4 陸地棉產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀相關(guān)性分析
2.2.4.1 產(chǎn)量性狀間的相關(guān)性
2.2.4.2 纖維品質(zhì)性狀間的相關(guān)性
2.2.4.3 產(chǎn)量性狀與纖維品質(zhì)性狀間的相關(guān)性
2.2.5 單位點(diǎn)QTL定位
2.2.5.1 產(chǎn)量性狀單位點(diǎn)QTL定位
2.2.5.2 產(chǎn)量性狀雜種優(yōu)勢(shì)單位點(diǎn)QTL定位
2.2.5.3 產(chǎn)量性狀QTL效應(yīng)分析
2.2.5.4 纖維品質(zhì)性狀單位點(diǎn)QTL定位
2.2.5.5 纖維品質(zhì)性狀雜種優(yōu)勢(shì)單位點(diǎn)QTL定位
2.2.5.6 纖維品質(zhì)性狀QTL效應(yīng)分析
2.2.6 m-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.6.1 產(chǎn)量性狀m-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.6.2 產(chǎn)量性狀雜種優(yōu)勢(shì)m-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.6.3 纖維品質(zhì)性狀m-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.6.4 纖維品質(zhì)性狀雜種優(yōu)勢(shì)m-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.7 e-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.7.1 產(chǎn)量性狀e-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.7.2 產(chǎn)量性狀雜種優(yōu)勢(shì)e-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.7.3 纖維品質(zhì)性狀e-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.7.4 纖維品質(zhì)性狀雜種優(yōu)勢(shì)e-QTL定位及其環(huán)境互作分析
2.2.8 單位點(diǎn)QTL和m-QTL的一致性分析
2.2.8.1 產(chǎn)量性狀單位點(diǎn)QTL和m-QTL的一致性分析
2.2.8.2 纖維品質(zhì)性狀單位點(diǎn)QTL和m-QTL一致性分析
2.3 討論
2.3.1 關(guān)于陸地棉SNP遺傳圖譜
2.3.2 RIL、IF_2和BCF_1群體在雜種優(yōu)勢(shì)研究中的應(yīng)用
2.3.3 產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀加性QTLs的一致性和可靠性分析
2.3.4 產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀雜種優(yōu)勢(shì)位點(diǎn)的特征
2.3.5 產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀近交衰退和雜種優(yōu)勢(shì)遺傳基礎(chǔ)
2.3.6 標(biāo)記輔助育種的應(yīng)用對(duì)培育高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)陸地棉的影響
2.4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
本文編號(hào):3733275
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