懷牛膝是河南著名的“四大懷藥”之一,也是我國(guó)重要的大宗藥材。本文以2 mg/L NAA+1 mg/L 6-BA噴施處理的懷牛膝根和葉為實(shí)驗(yàn)材料,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,對(duì)懷牛膝主要藥用成分三萜皂苷合成途徑中關(guān)鍵酶基因及其時(shí)空表達(dá)特異性和外源植物激素處理促進(jìn)根中三萜皂苷積累的分子機(jī)制進(jìn)行了研究,旨在為深入研究懷牛膝主要藥用成分三萜皂苷合成中關(guān)鍵酶基因的克隆與功能驗(yàn)證和外源植物激素對(duì)牛膝生長(zhǎng)發(fā)育及三萜皂苷代謝途徑的調(diào)控提供理論依據(jù)。其主要研究結(jié)果如下:1.首次獲得了懷牛膝不同組織中響應(yīng)激素相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序基本信息。共獲得312,151,164個(gè)raw reads,其中Ab-L-CK1、Ab-L-CK2、Ab-R-CK1、Ab-R-CK2、Ab-L-T1、Ab-L-T2、Ab-R-T1和Ab-R-T2分別有35,359,331、27,630,495、32,028,032、33,307,916、34,923,635、33,637,422、48,223,422和67,040,748個(gè)raw reads。將低質(zhì)量的reads過濾后,共獲得了26.5 G的數(shù)據(jù)量。組裝后共獲得10... 

【文章頁數(shù)】：96 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
縮略詞表(ABBREVIATION)
第一章 前言
    1.1 懷牛膝概況
        1.1.1 懷牛膝生物學(xué)特征研究
        1.1.2 懷牛膝主要化學(xué)成分及其藥理作用
    1.2 齊墩果烷型三萜皂苷代謝途徑研究
        1.2.1 三萜皂苷的生物合成途徑研究
        1.2.2 三萜皂苷生物合成關(guān)鍵酶基因的研究進(jìn)展
    1.3 植物生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑在藥用植物中的應(yīng)用
    1.4 RNA-Seq及其在藥用植物研究中的應(yīng)用
        1.4.1 RNA-Seq
        1.4.2 RNA-Seq在藥用植物次級(jí)代謝產(chǎn)物生物合成中的應(yīng)用
        1.4.3 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在牛膝研究中的應(yīng)用
    1.5 本課題的主要研究?jī)?nèi)容與技術(shù)路線
        1.5.1 主要研究?jī)?nèi)容
        1.5.2 技術(shù)路線
        1.5.3 創(chuàng)新點(diǎn)
    1.6 本課題的目的與意義
第二章 外源植物激素誘導(dǎo)的懷牛膝轉(zhuǎn)錄組分析
    2.1 材料與方法
        2.1.1 材料
        2.1.2 主要儀器與試劑
        2.1.3 方法
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 懷牛膝測(cè)序樣品總RNA的提取與質(zhì)檢
        2.2.2 懷牛膝轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估與產(chǎn)量統(tǒng)計(jì)分析
        2.2.3 懷牛膝轉(zhuǎn)錄組測(cè)序組裝
        2.2.4 Unigene的功能注釋
        2.2.5 基因的表達(dá)水平分析
        2.2.6 外源植物激素處理懷牛膝的差異基因分析
        2.2.7 三萜皂苷合成相關(guān)基因的挖掘
        2.2.8 三萜皂苷合成候選關(guān)鍵酶差異基因的表達(dá)分析
        2.2.9 植物激素合成及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中差異基因的挖掘
        2.2.10 差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子的挖掘
        2.2.11 qRT-PCR驗(yàn)證轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果
    2.3 討論
        2.3.1 Unigenes的功能注釋率
        2.3.2 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序已成為挖掘藥用植物功能基因的有效手段
        2.3.3 茉莉酸介導(dǎo)三萜皂苷合成的轉(zhuǎn)錄調(diào)控
第三章 懷牛膝三萜皂苷合成關(guān)鍵酶基因的時(shí)空表達(dá)分析
    3.1 材料與方法
        3.1.1 材料
        3.1.2 主要儀器與試劑
        3.1.3 方法
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 三萜皂苷生物合成關(guān)鍵酶基因的空間特異性表達(dá)
        3.2.2 三萜皂苷生物合成關(guān)鍵酶基因的時(shí)間特異性表達(dá)
    3.3 討論
第四章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表論文


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]紅花天冬氨酸代謝途徑關(guān)鍵酶基因的挖掘及功能鑒定[D]. 王艷芳.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]鉤藤堿和異鉤藤堿生物合成路徑的研究[D]. 郭茜茜.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]壇紫菜響應(yīng)失水脅迫的轉(zhuǎn)錄組和表達(dá)譜特征分析[D]. 王莉.中國(guó)海洋大學(xué) 2013
[4]丹參牻牛兒基牻牛兒基焦磷酸合酶基因的克隆與功能研究[D]. 張蕾.中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2009
[5]牛膝結(jié)構(gòu)和發(fā)育與主要藥用成分積累關(guān)系及其道地性形成機(jī)制的研究[D]. 李金亭.西北大學(xué) 2008
[6]中草藥刺人參和牛膝中的齊墩果烷型三萜皂苷及羽扇豆烯三萜皂苷的研究[D]. 王廣樹.吉林大學(xué) 2006

碩士論文
[1]懷菊花響應(yīng)黑斑病病原菌相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[D]. 朱玉婷.河南師范大學(xué) 2017
[2]懷牛膝細(xì)胞懸浮培養(yǎng)及主要藥用成分積累的調(diào)控研究[D]. 郭曉雙.河南師范大學(xué) 2016
[3]植物生長(zhǎng)物質(zhì)對(duì)牛膝生長(zhǎng)及主要藥用成分積累的影響[D]. 張?jiān)?河南師范大學(xué) 2015
[4]幾種齊墩果烷型三萜皂苷的合成及其生物活性研究[D]. 孫婧.西北大學(xué) 2012



本文編號(hào)：3709059