發(fā)布時(shí)間：2022-12-04 06:07

　　甘藍(lán)型油菜是世界第二大油料作物,在長(zhǎng)期馴化栽培過(guò)程中產(chǎn)生了廣泛的變異。根據(jù)油菜開花對(duì)低溫的需求將其分為3種生態(tài)類型:冬性油菜（WORs）、春性油菜（SORs）和半冬性油菜（SWORs）,其生態(tài)型分化的基礎(chǔ)尚不明確。甘藍(lán)型油菜是異源四倍體物種,基因組復(fù)雜,盡管已發(fā)布多個(gè)品種基因組草圖,但其質(zhì)量和代表性不足以滿足功能基因組研究和品種改良的需求。本研究中,我們結(jié)合多種測(cè)序技術(shù)對(duì)中雙11（ZS11）等代表3種不同生態(tài)型的8個(gè)甘藍(lán)型油菜品系進(jìn)行了測(cè)序和de novo組裝,得到了的8個(gè)高質(zhì)量參考基因組,鑒定了開花相關(guān)基因及相關(guān)的PAV,并結(jié)合開花期全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）及8個(gè)油菜品系春化前后共5個(gè)時(shí)期葉片的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,確定了調(diào)控油菜開花期的關(guān)鍵基因,初步揭示了甘藍(lán)型油菜生態(tài)型分化的遺傳基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1.8個(gè)甘藍(lán)型油菜品系包括2個(gè)冬油菜品種（Quinta和Tapidor）、2個(gè)春性油菜品種（Westar和No2127）和4個(gè)半冬性油菜品系（ZS11、Gangan、浙油7號(hào)、勝利油菜）。分別對(duì)這8個(gè)品系進(jìn)行Pac Bio和Illumina測(cè)序及de novo組裝,并以Hi C測(cè)序輔助組... 

【文章頁(yè)數(shù)】：141 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮略詞表
1 文獻(xiàn)綜述
    1.1 甘藍(lán)型油菜簡(jiǎn)介及其基因組研究進(jìn)展
        1.1.1 甘藍(lán)型油菜生態(tài)型分化
        1.1.2 甘藍(lán)型油菜基因組測(cè)序研究進(jìn)展
        1.1.3 結(jié)構(gòu)變異對(duì)作物主要農(nóng)藝性狀具有重要作用
    1.2 擬南芥開花調(diào)控研究進(jìn)展
    1.3 甘藍(lán)型油菜開花調(diào)控研究進(jìn)展
    1.4 本研究的目的與意義
2 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
    2.2 材料種植及主要農(nóng)藝性狀表型考察
    2.3 DNA的提取方法
    2.4 DNA測(cè)序及基因組組裝、注釋
    2.5 ZS11基因組中開花基因鑒定
    2.6 關(guān)聯(lián)分析群體基因型分析
    2.7 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析
    2.8 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析
    2.9 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析
    2.10 序列分析及統(tǒng)計(jì)分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 8 個(gè)甘藍(lán)型油菜自交系的主要農(nóng)藝性狀
    3.2 測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
    3.3 8 個(gè)甘藍(lán)型油菜基因組組裝
    3.4 8 個(gè)甘藍(lán)型油菜基因組比較分析
    3.5 ZS11基因組中開花相關(guān)基因的鑒定
    3.6 關(guān)聯(lián)分析鑒定甘藍(lán)型油菜中開花期相關(guān)位點(diǎn)
    3.7 8 個(gè)甘藍(lán)型油菜參考基因組中開花相關(guān)基因的PAV挖掘
    3.8 甘藍(lán)型油菜中FLC和 FT基因PAV變異鑒定及分析
        3.8.1 甘藍(lán)型油菜中FLC基因PAV變異鑒定及分析
        3.8.2 油菜中FT基因結(jié)構(gòu)變異鑒定及分析
    3.9 Bna.FT和 Bna.FLC基因在甘藍(lán)型油菜開花調(diào)控及生態(tài)型分化中的作用
        3.9.1 2 018-2019年油菜生育期田間環(huán)境溫度統(tǒng)計(jì)
        3.9.2 5個(gè)Bna.FLC和3個(gè)Bna.FT基因春化過(guò)程中m RNA轉(zhuǎn)錄水平變化
        3.9.3 4個(gè)Bna.FLC與甘藍(lán)型油菜生態(tài)型分化
        3.9.4 Bna A10.FLC、Bna A02.FLC和 Bna C02.FLC對(duì)油菜開花期的影響
4 討論
    4.1 8 個(gè)甘藍(lán)型油菜基因組為遺傳學(xué)研究及育種提供了資源
    4.2 PAV等結(jié)構(gòu)變異在基因組中普遍存在,對(duì)表型有重要影響
    4.3 4個(gè)Bna.FLC基因與甘藍(lán)型油菜開花調(diào)控
    4.4 甘藍(lán)型油菜中其它開花相關(guān)基因挖掘
5.展望
參考文獻(xiàn)
附錄 Ⅰ 附表及附圖
附錄 Ⅱ 作者簡(jiǎn)介及發(fā)表文章
致謝



本文編號(hào)：3707733