雜種劣勢(shì)是在產(chǎn)量、生物量以及其它一些農(nóng)藝性狀表現(xiàn)與雜種優(yōu)勢(shì)相反的一種現(xiàn)象,而在雜種劣勢(shì)的相關(guān)分子機(jī)理研究方面很少受到關(guān)注。為了解析雜種劣勢(shì)的相關(guān)分子機(jī)理,本研究旨在利用雜種劣勢(shì)相關(guān)的3個(gè)粳稻品種‘Aranghyangchalbyeo’（CH7）、‘Sanghaehyangheolua’（CH8）和‘Shinseonchalbyeo’（CH9）進(jìn)行全基因組重測(cè)序,分析全基因組序列變異,解析雜種劣勢(shì)的遺傳基礎(chǔ)。通過與粳稻品種‘日本晴’參考基因組的比對(duì)分析,在CH7、CH8和CH9基因組中分別獲得了574 551個(gè)、1 026 428個(gè)和792 465個(gè)變異位點(diǎn),包括SNPs和In Dels變異位點(diǎn)。同時(shí),基于基因組的拷貝數(shù)變異（CNVs）檢測(cè),在CH7、CH8和CH9基因組中分別獲得了5 698個(gè)、6 872個(gè)和6 133個(gè)拷貝數(shù)變異位點(diǎn)。此外,本研究也發(fā)現(xiàn)CH7、CH8和CH9基因組的變異位點(diǎn)在水稻的12條染色體上的分布是不均勻的。這些結(jié)果明確了相關(guān)基因組中的變異位點(diǎn)信息,為進(jìn)一步研究雜種劣勢(shì)的遺傳機(jī)理提供了基礎(chǔ)。 

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【文章目錄】：
1 結(jié)果與分析
    1.1 全基因組重測(cè)序
    1.2 基因組DNA的多態(tài)性檢測(cè)
    1.3 基因組SNP的檢測(cè)與分析
    1.4 基因組InDel檢測(cè)與分析
    1.5 基因組CNV檢測(cè)與分析
    1.6 基因組序列變異在各染色體的分布
2 討論
3 材料與方法
    3.1 試驗(yàn)材料
    3.2 基因組DNA的提取和文庫(kù)構(gòu)建
    3.3 全基因組DNA重測(cè)序
    3.4 測(cè)序原始數(shù)據(jù)的過濾以及序列回貼
    3.5 基因組的變異檢測(cè)和注釋
作者貢獻(xiàn)



本文編號(hào)：3692637