向日葵種子形成過程中差異蛋白質(zhì)組學(xué)及代謝組學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2022-10-10 13:54
本研究以向日葵(Helianthus annuus L.)品種2603為材料,首先利用正交設(shè)計(jì)法對(duì)向日葵種子的IEF-SDS-PAGE雙向電泳條件(上樣量、一向等電聚焦時(shí)間、聚丙烯酰胺凝膠濃度)進(jìn)行了優(yōu)化,建立了一套較適宜的以向日葵種子為材料的雙向電泳技術(shù)體系,此體系是上樣量為3.5mg,一向聚焦時(shí)間為5h,聚丙烯酰胺凝膠濃度為12.5%;其次再以不同授粉時(shí)間的向日葵子房作為研究對(duì)象,通過采用已優(yōu)化好的雙向電泳條件,對(duì)向日葵未授粉的子房以及授粉7天和授粉28天的子房進(jìn)行差異蛋白分析。結(jié)果顯示,不同授粉時(shí)間的向日葵子房經(jīng)ImageMaster-Dplatinum5.0軟件分析可識(shí)別的差異蛋白點(diǎn)數(shù)約為87、122和183個(gè),選取表達(dá)量在3倍以上的13個(gè)差異蛋白點(diǎn)進(jìn)行質(zhì)譜分析,初步鑒定有12個(gè)差異蛋白在向日葵種子形成過程中具有重要作用和功能,這些蛋白質(zhì)分別是:貯藏蛋白11S球蛋白G3、谷蛋白、烯醇酶、捕光葉綠素蛋白復(fù)合體亞基β1、26S蛋白酶調(diào)節(jié)亞基、熱休克蛋白、蔗糖果糖基轉(zhuǎn)移酶、ATP合酶β亞基、線粒體甘氨酸脫羧酶復(fù)雜P蛋白、聚光葉綠素蛋白復(fù)合物、磷酸甘油酸變位酶和S-腺苷甲硫氨酸合成酶;...
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 植物蛋白質(zhì)組學(xué)研究概況
1.1.1 植物蛋白質(zhì)(2-DE)樣品的制備
1.1.2 雙向電泳技術(shù)
1.1.3 蛋白質(zhì)質(zhì)譜檢測(cè)技術(shù)
1.1.4 向日葵蛋白質(zhì)組學(xué)研究進(jìn)展
1.2 植物代謝組學(xué)的研究概況
1.3 本研究的目的和意義
1.4 本研究的技術(shù)路線
第二章 向日葵種子蛋白質(zhì)的提取及雙向電泳體系優(yōu)化的研究
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 向日葵種子蛋白質(zhì)的提取方法
2.2.2 蛋白定量
2.2.3 水化
2.2.4 向日葵種子雙向電泳體系的優(yōu)化
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 向日葵種子差異蛋白正交實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.3.2 上樣量對(duì)向日葵種子蛋白質(zhì)雙向電泳分辨率的影響
2.3.3 等電聚焦時(shí)間對(duì)向日葵種子差異蛋白的影響
2.3.4 膠濃度對(duì)向日葵種子差異蛋白的影響
2.4 討論
2.4.1 上樣量對(duì) 2-DE圖譜的影響
2.4.2 一向等電聚焦時(shí)間對(duì) 2-DE圖譜的影響
2.4.3 其它因素對(duì)向日葵雙向電泳的影響
2.5 本章小結(jié)
第三章 向日葵種子形成過程中差異蛋白質(zhì)組學(xué)的研究
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 差異蛋白點(diǎn)的選取
3.2.2 差異蛋白點(diǎn)的膠內(nèi)切取和酶解
3.2.3 MALDI-TOF/TOF-MS質(zhì)譜鑒定及數(shù)據(jù)庫(kù)檢索
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 不同授粉時(shí)間向日葵子房差異蛋白質(zhì)雙向電泳的圖譜結(jié)果
3.3.2 不同授粉時(shí)間向日葵子房差異蛋白質(zhì)的質(zhì)譜鑒定結(jié)果
3.3.3 向日葵種子形成過程中的關(guān)鍵蛋白
3.3.4 向日葵種子形成過程中差異蛋白功能分類
3.3.5 向日葵種子形成過程中差異蛋白質(zhì)在擬南芥數(shù)據(jù)庫(kù)中的蛋白映射
3.4 討論
3.4.1 向日葵種子形成過程中的關(guān)鍵蛋白功能分析
3.4.2 向日葵種子形成過程中差異蛋白質(zhì)在擬南芥數(shù)據(jù)庫(kù)中的映射分析
3.5 本章小結(jié)
3.5.1 不同授粉時(shí)間向日葵子房雙向電泳圖譜鑒定結(jié)果
3.5.2 不同授粉時(shí)間向日葵子房差異蛋白質(zhì)的質(zhì)譜鑒定結(jié)果
3.5.3 向日葵種子形成過程中的關(guān)鍵蛋白分類
3.5.4 向日葵種子形成過程中差異蛋白質(zhì)在擬南芥數(shù)據(jù)庫(kù)中的蛋白映射
第四章 向日葵種子形成過程中代謝組學(xué)研究
4.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 樣品處理方法的優(yōu)化
4.2.2 樣品提取條件的優(yōu)化
4.2.3 實(shí)驗(yàn)方案
4.2.4 數(shù)據(jù)分析方法
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 正交優(yōu)化實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.2 內(nèi)標(biāo)物選擇結(jié)果
4.3.3 不同授粉時(shí)間的向日葵子房代謝物定性及定量結(jié)果
4.3.4 不同授粉時(shí)間的向日葵子房代謝物比較
4.3.5 不同授粉時(shí)期的向日葵子房代謝組學(xué)分析
4.3.6 不同授粉時(shí)間的向日葵子房標(biāo)志性代謝差異物的查找
4.4 討論
4.4.1 基于GC-MS聯(lián)用的向日葵代謝組學(xué)分析前處理研究
4.4.2 基于GC-MS聯(lián)用的向日葵代謝組學(xué)研究
4.5 本章小結(jié)
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
實(shí)驗(yàn)試劑
攻讀碩士學(xué)位論文期間發(fā)表的論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]代謝組學(xué)及其在藥用植物研究中的應(yīng)用[J]. 宋發(fā)軍,黃珍,羅忠,張鵬,林愛華,孫東立,孟艷艷. 中南民族大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(02)
[2]種子發(fā)育和萌發(fā)過程的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[J]. 李佳,陸秀君,梅梅,張曉林,馬躍. 種子. 2016(05)
[3]基于正交試驗(yàn)的向日葵種子蛋白雙向電泳技術(shù)的研究[J]. 張曉倩,劉洋,呂瀟,楊仁杰,李夢(mèng)婷,劉海學(xué). 種子. 2016(01)
[4]植物代謝組學(xué)技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 劉賢青,羅杰. 科技導(dǎo)報(bào). 2015(16)
[5]枯草芽孢桿菌代謝組樣品前處理方法的比較研究[J]. 王洪彬,楊泓喆,楊霽菡,王永帥,路福平. 分析化學(xué). 2015(08)
[6]基于GC-MS的植物代謝組學(xué)研究[J]. 段禮新,漆小泉. 生命科學(xué). 2015(08)
[7]氣相色譜-質(zhì)譜代謝組學(xué)研究關(guān)鍵技術(shù)及典型應(yīng)用[J]. 辜雪琴,范國(guó)榮,陸峰,亓云鵬. 中國(guó)醫(yī)藥工業(yè)雜志. 2015(01)
[8]向日葵種子蛋白雙向電泳技術(shù)體系建立的初步研究[J]. 夏江勇,呂瀟,張曉倩,劉洋,劉海學(xué). 種子. 2014(12)
[9]強(qiáng)休眠玉米種子休眠前后的蛋白差異表達(dá)[J]. 蘭海,冷亦峰,周樹峰,劉堅(jiān),榮廷昭. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2015(01)
[10]代謝組學(xué)在植物逆境脅迫研究中的應(yīng)用[J]. 倪建偉,楊秀艷,張華新,倪元穎,武海雯,魏琦. 世界林業(yè)研究. 2014(05)
博士論文
[1]玉米籽粒代謝組的生化及遺傳基礎(chǔ)研究[D]. 李東.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]油桐種仁不同發(fā)育時(shí)期表達(dá)蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 占志勇.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2013
[3]葉綠體ATP合酶的活性調(diào)節(jié)與亞基的定點(diǎn)突變[D]. 董慧.中國(guó)科學(xué)院研究生院(上海生命科學(xué)研究院) 2005
碩士論文
[1]轉(zhuǎn)基因水稻的代謝組學(xué)研究[D]. 王玲.北京化工大學(xué) 2013
[2]四川小麥新品種高分子量谷蛋白亞基及1B/1R易位系遺傳變異研究[D]. 楊恩年.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[3]核桃楸(Juglans mandshurica Maxim.)胚胎學(xué)研究[D]. 孟穎.東北林業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):3689738
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 植物蛋白質(zhì)組學(xué)研究概況
1.1.1 植物蛋白質(zhì)(2-DE)樣品的制備
1.1.2 雙向電泳技術(shù)
1.1.3 蛋白質(zhì)質(zhì)譜檢測(cè)技術(shù)
1.1.4 向日葵蛋白質(zhì)組學(xué)研究進(jìn)展
1.2 植物代謝組學(xué)的研究概況
1.3 本研究的目的和意義
1.4 本研究的技術(shù)路線
第二章 向日葵種子蛋白質(zhì)的提取及雙向電泳體系優(yōu)化的研究
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 向日葵種子蛋白質(zhì)的提取方法
2.2.2 蛋白定量
2.2.3 水化
2.2.4 向日葵種子雙向電泳體系的優(yōu)化
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 向日葵種子差異蛋白正交實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.3.2 上樣量對(duì)向日葵種子蛋白質(zhì)雙向電泳分辨率的影響
2.3.3 等電聚焦時(shí)間對(duì)向日葵種子差異蛋白的影響
2.3.4 膠濃度對(duì)向日葵種子差異蛋白的影響
2.4 討論
2.4.1 上樣量對(duì) 2-DE圖譜的影響
2.4.2 一向等電聚焦時(shí)間對(duì) 2-DE圖譜的影響
2.4.3 其它因素對(duì)向日葵雙向電泳的影響
2.5 本章小結(jié)
第三章 向日葵種子形成過程中差異蛋白質(zhì)組學(xué)的研究
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 差異蛋白點(diǎn)的選取
3.2.2 差異蛋白點(diǎn)的膠內(nèi)切取和酶解
3.2.3 MALDI-TOF/TOF-MS質(zhì)譜鑒定及數(shù)據(jù)庫(kù)檢索
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 不同授粉時(shí)間向日葵子房差異蛋白質(zhì)雙向電泳的圖譜結(jié)果
3.3.2 不同授粉時(shí)間向日葵子房差異蛋白質(zhì)的質(zhì)譜鑒定結(jié)果
3.3.3 向日葵種子形成過程中的關(guān)鍵蛋白
3.3.4 向日葵種子形成過程中差異蛋白功能分類
3.3.5 向日葵種子形成過程中差異蛋白質(zhì)在擬南芥數(shù)據(jù)庫(kù)中的蛋白映射
3.4 討論
3.4.1 向日葵種子形成過程中的關(guān)鍵蛋白功能分析
3.4.2 向日葵種子形成過程中差異蛋白質(zhì)在擬南芥數(shù)據(jù)庫(kù)中的映射分析
3.5 本章小結(jié)
3.5.1 不同授粉時(shí)間向日葵子房雙向電泳圖譜鑒定結(jié)果
3.5.2 不同授粉時(shí)間向日葵子房差異蛋白質(zhì)的質(zhì)譜鑒定結(jié)果
3.5.3 向日葵種子形成過程中的關(guān)鍵蛋白分類
3.5.4 向日葵種子形成過程中差異蛋白質(zhì)在擬南芥數(shù)據(jù)庫(kù)中的蛋白映射
第四章 向日葵種子形成過程中代謝組學(xué)研究
4.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 樣品處理方法的優(yōu)化
4.2.2 樣品提取條件的優(yōu)化
4.2.3 實(shí)驗(yàn)方案
4.2.4 數(shù)據(jù)分析方法
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 正交優(yōu)化實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.2 內(nèi)標(biāo)物選擇結(jié)果
4.3.3 不同授粉時(shí)間的向日葵子房代謝物定性及定量結(jié)果
4.3.4 不同授粉時(shí)間的向日葵子房代謝物比較
4.3.5 不同授粉時(shí)期的向日葵子房代謝組學(xué)分析
4.3.6 不同授粉時(shí)間的向日葵子房標(biāo)志性代謝差異物的查找
4.4 討論
4.4.1 基于GC-MS聯(lián)用的向日葵代謝組學(xué)分析前處理研究
4.4.2 基于GC-MS聯(lián)用的向日葵代謝組學(xué)研究
4.5 本章小結(jié)
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
實(shí)驗(yàn)試劑
攻讀碩士學(xué)位論文期間發(fā)表的論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]代謝組學(xué)及其在藥用植物研究中的應(yīng)用[J]. 宋發(fā)軍,黃珍,羅忠,張鵬,林愛華,孫東立,孟艷艷. 中南民族大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(02)
[2]種子發(fā)育和萌發(fā)過程的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[J]. 李佳,陸秀君,梅梅,張曉林,馬躍. 種子. 2016(05)
[3]基于正交試驗(yàn)的向日葵種子蛋白雙向電泳技術(shù)的研究[J]. 張曉倩,劉洋,呂瀟,楊仁杰,李夢(mèng)婷,劉海學(xué). 種子. 2016(01)
[4]植物代謝組學(xué)技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 劉賢青,羅杰. 科技導(dǎo)報(bào). 2015(16)
[5]枯草芽孢桿菌代謝組樣品前處理方法的比較研究[J]. 王洪彬,楊泓喆,楊霽菡,王永帥,路福平. 分析化學(xué). 2015(08)
[6]基于GC-MS的植物代謝組學(xué)研究[J]. 段禮新,漆小泉. 生命科學(xué). 2015(08)
[7]氣相色譜-質(zhì)譜代謝組學(xué)研究關(guān)鍵技術(shù)及典型應(yīng)用[J]. 辜雪琴,范國(guó)榮,陸峰,亓云鵬. 中國(guó)醫(yī)藥工業(yè)雜志. 2015(01)
[8]向日葵種子蛋白雙向電泳技術(shù)體系建立的初步研究[J]. 夏江勇,呂瀟,張曉倩,劉洋,劉海學(xué). 種子. 2014(12)
[9]強(qiáng)休眠玉米種子休眠前后的蛋白差異表達(dá)[J]. 蘭海,冷亦峰,周樹峰,劉堅(jiān),榮廷昭. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2015(01)
[10]代謝組學(xué)在植物逆境脅迫研究中的應(yīng)用[J]. 倪建偉,楊秀艷,張華新,倪元穎,武海雯,魏琦. 世界林業(yè)研究. 2014(05)
博士論文
[1]玉米籽粒代謝組的生化及遺傳基礎(chǔ)研究[D]. 李東.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]油桐種仁不同發(fā)育時(shí)期表達(dá)蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 占志勇.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2013
[3]葉綠體ATP合酶的活性調(diào)節(jié)與亞基的定點(diǎn)突變[D]. 董慧.中國(guó)科學(xué)院研究生院(上海生命科學(xué)研究院) 2005
碩士論文
[1]轉(zhuǎn)基因水稻的代謝組學(xué)研究[D]. 王玲.北京化工大學(xué) 2013
[2]四川小麥新品種高分子量谷蛋白亞基及1B/1R易位系遺傳變異研究[D]. 楊恩年.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[3]核桃楸(Juglans mandshurica Maxim.)胚胎學(xué)研究[D]. 孟穎.東北林業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):3689738
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