干旱脅迫下兩個(gè)玉米自交系雄穗花器官分化期的轉(zhuǎn)錄組分析
發(fā)布時(shí)間:2022-07-07 13:34
【目的】運(yùn)用現(xiàn)代分子生物學(xué)及高通量測序技術(shù),在全基因組水平鑒定耐旱相關(guān)的基因,研究玉米雄穗花器官分化期對干旱脅迫的響應(yīng)機(jī)理,為抗旱育種將提供新的理論基礎(chǔ)。【方法】以干旱脅迫15 d和正常澆水的耐旱自交系"PHBA6"和干旱敏感自交系"吉63"花器官分化期的雄穗進(jìn)行Illumina HiSeq 2000高通量測序分析,將測序得到的Unigene與玉米參考基因組進(jìn)行比對,利用RPKM來衡量樣本間的基因表達(dá)豐度,以|log2foldchange|≥1,P<0.05,FDR≤0.001篩選出樣本間的差異表達(dá)基因,并通過Gene Onto 1ogy (GO)數(shù)據(jù)庫、 KEGG pathway數(shù)據(jù)庫對篩選出的差異表達(dá)基因的功能和參與的調(diào)控路徑進(jìn)行分析!窘Y(jié)果】與正常水分處理相比,耐旱自交"PHBA6"和干旱敏感自交系"吉63"在干旱脅迫下分別有1 394個(gè)和1 300個(gè)顯著差異表達(dá)基因,其中共有差異表達(dá)基因831個(gè),包括上下調(diào)表達(dá)趨勢是一致的822個(gè)基因和9個(gè)具有相反的表達(dá)模式基因。除這些基因外,各自分別還有563個(gè)和469個(gè)基因型特異的干旱響應(yīng)基因,這些特異的干旱響應(yīng)...
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
特異響應(yīng)基因的富集功能
代謝途徑顯著性富集的代謝通路
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于昌7-2導(dǎo)入系發(fā)掘干旱脅迫下玉米產(chǎn)量相關(guān)QTL位點(diǎn)[J]. 李晶晶,王利鋒,馬娟,曹言勇,王浩,王麗艷,賈騰蛟,董春林,李會勇. 玉米科學(xué). 2019(04)
[2]玉米耐旱QTL定位研究進(jìn)展[J]. 郝轉(zhuǎn)芳,李新海,張世煌. 玉米科學(xué). 2007(02)
[3]玉米開花期耐旱相關(guān)性狀的遺傳及育種策略[J]. 劉賢德,李新海,張世煌. 玉米科學(xué). 2002(03)
博士論文
[1]玉米高密度重組圖譜構(gòu)建及耐旱相關(guān)性狀的遺傳解析[D]. 李春輝.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[2]玉米抗旱性指標(biāo)的篩選及其遺傳特性研究[D]. 李鳳海.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
碩士論文
[1]基于玉米根系轉(zhuǎn)錄組測序的耐旱基因挖掘及Zmhdz6的功能分析[D]. 郝陸洋.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
本文編號:3656512
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
特異響應(yīng)基因的富集功能
代謝途徑顯著性富集的代謝通路
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于昌7-2導(dǎo)入系發(fā)掘干旱脅迫下玉米產(chǎn)量相關(guān)QTL位點(diǎn)[J]. 李晶晶,王利鋒,馬娟,曹言勇,王浩,王麗艷,賈騰蛟,董春林,李會勇. 玉米科學(xué). 2019(04)
[2]玉米耐旱QTL定位研究進(jìn)展[J]. 郝轉(zhuǎn)芳,李新海,張世煌. 玉米科學(xué). 2007(02)
[3]玉米開花期耐旱相關(guān)性狀的遺傳及育種策略[J]. 劉賢德,李新海,張世煌. 玉米科學(xué). 2002(03)
博士論文
[1]玉米高密度重組圖譜構(gòu)建及耐旱相關(guān)性狀的遺傳解析[D]. 李春輝.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[2]玉米抗旱性指標(biāo)的篩選及其遺傳特性研究[D]. 李鳳海.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
碩士論文
[1]基于玉米根系轉(zhuǎn)錄組測序的耐旱基因挖掘及Zmhdz6的功能分析[D]. 郝陸洋.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
本文編號:3656512
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