油菜產(chǎn)量相關(guān)性狀的聯(lián)合連鎖分析和全基因組關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時間:2022-05-08 08:46
油菜是世界上主要的油料作物之一,是植物食用油和飼用蛋白的主要來源。隨著人口的不斷增加和生活水平的不斷提高,世界范圍內(nèi)對食用植物油和蛋白的需求日益增長,必須不斷提高油菜籽產(chǎn)量來滿足人類的需求。隨著耕地面積的不斷減少,通過擴大種植面積進(jìn)一步增加油菜籽總產(chǎn)量的可能性較小,比較有效的途徑是提高單位面積油菜籽的產(chǎn)量。其中,解析產(chǎn)量相關(guān)性狀的遺傳基礎(chǔ)是進(jìn)一步提高油菜產(chǎn)量的前提。本研究中,我們以本實驗室前期構(gòu)建的包含15個重組自交系(RIL)群體的油菜巢式關(guān)聯(lián)作圖(Brassica napus Nested association mapping,BN-NAM)群體,對有效分枝數(shù)、第一分枝高度、每角果粒數(shù)、主花序有效長度、主花序角果數(shù)、株高、角果長和千粒重等8個產(chǎn)量相關(guān)性狀進(jìn)行了連鎖分析和全基因組關(guān)聯(lián)分析。主要結(jié)果如下:1.BN-NAM群體產(chǎn)量相關(guān)性狀的表型統(tǒng)計分析:于2015-2017年分別在蔡甸、陽邏、鄂州種植BN-NAM群體,并調(diào)查了有效分枝數(shù)、第一分枝高度、每角果粒數(shù)、主花序有效長度、主花序角果數(shù)、株高、角果長和千粒重等8個產(chǎn)量相關(guān)性狀。表型數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),8個產(chǎn)量相關(guān)性狀都存在廣泛的表型變異...
【文章頁數(shù)】:100 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 植物數(shù)量性狀遺傳解析
1.1.1 連鎖分析研究進(jìn)展
1.1.2 常用的連鎖群體
1.1.3 關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展
1.1.4 常用的關(guān)聯(lián)群體
1.2 產(chǎn)量相關(guān)性狀研究進(jìn)展
1.2.1 甘藍(lán)型油菜產(chǎn)量相關(guān)性狀QTL研究進(jìn)展
1.2.2 甘藍(lán)型油菜產(chǎn)量相關(guān)性狀的調(diào)控基因研究進(jìn)展
1.2.3 其他作物產(chǎn)量相關(guān)性狀研究進(jìn)展
1.3 本研究的目的與意義
2 材料與方法
2.1 群體構(gòu)建
2.2 群體遺傳圖譜構(gòu)建
2.3 BN-NAM群體全基因組關(guān)聯(lián)圖譜的構(gòu)建
2.4 實驗設(shè)計及田間性狀考察
2.5 表型數(shù)據(jù)分析
2.6 QTL定位
2.7 全基因組關(guān)聯(lián)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 BN-NAM群體產(chǎn)量相關(guān)性狀的表型統(tǒng)計分析
3.1.1 表型變異
3.1.2 相關(guān)性分析
3.2 15個RIL群體8 個產(chǎn)量相關(guān)性狀的QTL分析
3.2.1 有效分枝數(shù)
3.2.2 第一分枝高度
3.2.3 每角果粒數(shù)
3.2.4 主花序有效長度
3.2.5 主花序角果數(shù)
3.2.6 株高
3.2.7 角果長
3.2.8 千粒重
3.3 BN-NAM群體產(chǎn)量相關(guān)性狀的GWAS分析
3.3.1 有效分枝數(shù)
3.3.2 第一分枝高度
3.3.3 每角果粒數(shù)
3.3.4 主花序有效長度
3.3.5 主花序角果數(shù)
3.3.6 株高
3.3.7 角果長
3.3.8 千粒重
3.3.9 與不同產(chǎn)量相關(guān)性狀共同關(guān)聯(lián)位點
3.4 連鎖分析和關(guān)聯(lián)分析的比較及應(yīng)用
3.4.1 連鎖分析與關(guān)聯(lián)分析的比較
3.4.2 結(jié)合QTL定位和GWAS分析結(jié)果預(yù)測株高性狀候選基因
3.5 角果長三種基因型的GWAS分析
3.5.1 角果長三種基因型的劃分
3.5.2 角果長三種類型的GWAS分析
4 討論
4.1 甘藍(lán)型油菜產(chǎn)量相關(guān)性狀的相關(guān)性
4.2 連鎖分析和關(guān)聯(lián)分析的比較分析
4.3 每角果粒數(shù)的位點發(fā)掘
4.4 角果長候選基因
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]GS6, A Member of the GRAS Gene Family,Negatively Regulates Grain Size in Rice[J]. Lianjun Sun,Xiaojiao Li,Yongcai Fu,Zuofeng Zhu,Lubin Tan,Fengxia Liu,Xianyou Sun,Xuewen Sun,Chuanqing Sun. Journal of Integrative Plant Biology. 2013(10)
[2]數(shù)量性狀基因的完備區(qū)間作圖方法[J]. 王建康. 作物學(xué)報. 2009(02)
[3]甘藍(lán)型油菜產(chǎn)量及相關(guān)性狀的QTL分析[J]. 易斌,陳偉,馬朝芝,傅廷棟,涂金星. 作物學(xué)報. 2006(05)
[4]數(shù)量性狀基因定位的混合線性模型分析方法[J]. 朱軍. 遺傳. 1998(S1)
博士論文
[1]甘藍(lán)型油菜產(chǎn)量相關(guān)性狀遺傳解析[D]. 王軍.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[2]甘藍(lán)型油菜株型與角果相關(guān)性狀的QTL分析[D]. 漆麗萍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]甘藍(lán)型油菜產(chǎn)量和品質(zhì)相關(guān)性狀關(guān)聯(lián)分析[D]. 蔡東芳.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]甘藍(lán)型油菜雜種優(yōu)勢及其遺傳分析[D]. 沈金雄.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
碩士論文
[1]甘藍(lán)型油菜開花時間的遺傳及株高和開花時間的QTL定位[D]. 張冰冰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]甘藍(lán)型油菜株高和一次有效分枝高度候選基因的篩選[D]. 楊鴻.西南大學(xué) 2019
[3]甘藍(lán)型油菜株高遺傳及株高和開花時間的QTL定位[D]. 劉霞.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[4]甘藍(lán)型油菜株高和角果長及其相關(guān)性狀QTL定位[D]. 陰濤.西南大學(xué) 2015
[5]人工合成特長角甘藍(lán)型油菜產(chǎn)量相關(guān)性狀的遺傳分析和基因定位[D]. 龍艷.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
本文編號:3651327
【文章頁數(shù)】:100 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 植物數(shù)量性狀遺傳解析
1.1.1 連鎖分析研究進(jìn)展
1.1.2 常用的連鎖群體
1.1.3 關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展
1.1.4 常用的關(guān)聯(lián)群體
1.2 產(chǎn)量相關(guān)性狀研究進(jìn)展
1.2.1 甘藍(lán)型油菜產(chǎn)量相關(guān)性狀QTL研究進(jìn)展
1.2.2 甘藍(lán)型油菜產(chǎn)量相關(guān)性狀的調(diào)控基因研究進(jìn)展
1.2.3 其他作物產(chǎn)量相關(guān)性狀研究進(jìn)展
1.3 本研究的目的與意義
2 材料與方法
2.1 群體構(gòu)建
2.2 群體遺傳圖譜構(gòu)建
2.3 BN-NAM群體全基因組關(guān)聯(lián)圖譜的構(gòu)建
2.4 實驗設(shè)計及田間性狀考察
2.5 表型數(shù)據(jù)分析
2.6 QTL定位
2.7 全基因組關(guān)聯(lián)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 BN-NAM群體產(chǎn)量相關(guān)性狀的表型統(tǒng)計分析
3.1.1 表型變異
3.1.2 相關(guān)性分析
3.2 15個RIL群體8 個產(chǎn)量相關(guān)性狀的QTL分析
3.2.1 有效分枝數(shù)
3.2.2 第一分枝高度
3.2.3 每角果粒數(shù)
3.2.4 主花序有效長度
3.2.5 主花序角果數(shù)
3.2.6 株高
3.2.7 角果長
3.2.8 千粒重
3.3 BN-NAM群體產(chǎn)量相關(guān)性狀的GWAS分析
3.3.1 有效分枝數(shù)
3.3.2 第一分枝高度
3.3.3 每角果粒數(shù)
3.3.4 主花序有效長度
3.3.5 主花序角果數(shù)
3.3.6 株高
3.3.7 角果長
3.3.8 千粒重
3.3.9 與不同產(chǎn)量相關(guān)性狀共同關(guān)聯(lián)位點
3.4 連鎖分析和關(guān)聯(lián)分析的比較及應(yīng)用
3.4.1 連鎖分析與關(guān)聯(lián)分析的比較
3.4.2 結(jié)合QTL定位和GWAS分析結(jié)果預(yù)測株高性狀候選基因
3.5 角果長三種基因型的GWAS分析
3.5.1 角果長三種基因型的劃分
3.5.2 角果長三種類型的GWAS分析
4 討論
4.1 甘藍(lán)型油菜產(chǎn)量相關(guān)性狀的相關(guān)性
4.2 連鎖分析和關(guān)聯(lián)分析的比較分析
4.3 每角果粒數(shù)的位點發(fā)掘
4.4 角果長候選基因
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]GS6, A Member of the GRAS Gene Family,Negatively Regulates Grain Size in Rice[J]. Lianjun Sun,Xiaojiao Li,Yongcai Fu,Zuofeng Zhu,Lubin Tan,Fengxia Liu,Xianyou Sun,Xuewen Sun,Chuanqing Sun. Journal of Integrative Plant Biology. 2013(10)
[2]數(shù)量性狀基因的完備區(qū)間作圖方法[J]. 王建康. 作物學(xué)報. 2009(02)
[3]甘藍(lán)型油菜產(chǎn)量及相關(guān)性狀的QTL分析[J]. 易斌,陳偉,馬朝芝,傅廷棟,涂金星. 作物學(xué)報. 2006(05)
[4]數(shù)量性狀基因定位的混合線性模型分析方法[J]. 朱軍. 遺傳. 1998(S1)
博士論文
[1]甘藍(lán)型油菜產(chǎn)量相關(guān)性狀遺傳解析[D]. 王軍.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[2]甘藍(lán)型油菜株型與角果相關(guān)性狀的QTL分析[D]. 漆麗萍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]甘藍(lán)型油菜產(chǎn)量和品質(zhì)相關(guān)性狀關(guān)聯(lián)分析[D]. 蔡東芳.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]甘藍(lán)型油菜雜種優(yōu)勢及其遺傳分析[D]. 沈金雄.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
碩士論文
[1]甘藍(lán)型油菜開花時間的遺傳及株高和開花時間的QTL定位[D]. 張冰冰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]甘藍(lán)型油菜株高和一次有效分枝高度候選基因的篩選[D]. 楊鴻.西南大學(xué) 2019
[3]甘藍(lán)型油菜株高遺傳及株高和開花時間的QTL定位[D]. 劉霞.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[4]甘藍(lán)型油菜株高和角果長及其相關(guān)性狀QTL定位[D]. 陰濤.西南大學(xué) 2015
[5]人工合成特長角甘藍(lán)型油菜產(chǎn)量相關(guān)性狀的遺傳分析和基因定位[D]. 龍艷.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
本文編號:3651327
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