為開發(fā)苦蕎新的SSR標(biāo)記,本研究利用MISA軟件對苦蕎種皮轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)進(jìn)行SSR位點(diǎn)信息搜索,利用Primer 3設(shè)計引物并隨機(jī)選擇53對引物進(jìn)行驗證。結(jié)果表明:苦蕎種皮轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中共搜索到9 094個SSR位點(diǎn),其中,單核苷酸、三核苷酸和二核苷酸重復(fù)類型占優(yōu)勢,占總SSR的63.99%、19.35%、15.49%;共發(fā)現(xiàn)70種重復(fù)基元,其中A/T、AT/AT、AAG/CTT基元是優(yōu)勢基元。設(shè)計合成的53對引物中,41對引物（77.36%）獲得有效擴(kuò)增,21對引物具有多態(tài)性。本研究從轉(zhuǎn)錄組序列中大規(guī)模開發(fā)的SSR分子標(biāo)記將有助于苦蕎遺傳多樣性與分子育種研究。 

【文章來源】：分子植物育種. 2020,18(18)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

SSR引物在4份苦蕎材料中的PCR擴(kuò)增

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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