施氮影響羊草秋季地下分蘗芽發(fā)生的轉錄組學研究
發(fā)布時間：2022-01-17 14:31
羊草（Leymus chinensis）,賴草屬多年生根莖型禾草,廣泛分布于歐亞草原東部,具有較高的經(jīng)濟價值和生態(tài)價值。然而,自然條件下,其有性生殖能力弱、種子產量低,限制了羊草人工草地的建植。羊草種子產量低主要與單位面積生殖枝數(shù)量少有關,而生殖枝數(shù)量又與秋季果后營養(yǎng)期地下分蘗芽的形成密切相關。因此,探究羊草果后營養(yǎng)期地下分蘗芽庫形成的內在機制,就成為解決種子產量低的關鍵。本研究利用轉錄組學方法,對比研究了果后營養(yǎng)期前、后,施氮與不施氮條件下羊草分蘗基部基因的表達及調控通路變化,研究結果發(fā)現(xiàn):（1）果后營養(yǎng)期施氮能明顯增加羊草地下芽的發(fā)生量。施氮條件下,在閾值為q<0.05,且|log2ratio|（|log2比例|）≥1,RPKM（每百萬reads中來自于某基因每千堿基長度的reads數(shù)）>0.3條件下,與芽發(fā)生有直接或間接關聯(lián)的基因上調18399個,下調10732個;而當閾值為q<0.001且|log2ratio|≥1,RPKM≥1時...
【文章來源】：東北師范大學吉林省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】：63 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
轉錄本序列長度分布
比對結果統(tǒng)計
東北師范大學碩士學位論文15圖2.3ORF長度分布Figure2.3ORFlengthdistribution注：Minlength開放閱讀框的最小長度；Maxlength開放閱讀框的最大長度；N50開放閱讀框的N50長度；N90開放閱讀框的N90長度；Mean-length開放閱讀框的平均長度對比各個數(shù)據(jù)庫，共注釋了316261個unigene，注釋比例為100%。其中注釋到NR數(shù)據(jù)庫的unigene比例為56.73%；注釋到NT數(shù)據(jù)庫的unigene比例為44.54%；注釋到GO數(shù)據(jù)庫的unigene比例為33.36%；注釋到KO數(shù)據(jù)庫的unigene比例為15.05%（圖2.4）。
【參考文獻】：
期刊論文
[1]羊草種質資源的評價與利用[J]. 劉公社,李曉霞,齊冬梅,陳雙燕,程麗琴. 科學通報. 2016(02)
[2]次生代謝產物與植物抗病防御反應[J]. 郭艷玲,張鵬英,郭默然,陳靠山. 植物生理學報. 2012(05)
[3]高通量測序技術及其應用[J]. 王興春,楊致榮,王敏,李瑋,李生才. 中國生物工程雜志. 2012(01)
[4]植物對氮脅迫的生理適應機制研究進展[J]. 林鄭和,陳榮冰,陳常頌. 湖北農業(yè)科學. 2011(23)
[5]呼倫貝爾草原異質生境羊草有性生殖及其生物量分配的研究[J]. 周嬋,張卓,郭平,白丹,楊允菲,李建東. 草原與草坪. 2011(05)
[6]活性氮、活性氧及植物激素在種子休眠解除中的作用及相互關系研究進展[J]. 強妮花,惠偉. 植物生理學報. 2011(07)
[7]松嫩平原兩個生態(tài)型羊草營養(yǎng)和生殖生長的研究[J]. 周嬋,張卓,呂勇通,楊允菲. 草地學報. 2011(03)
[8]氮、硫互作對克隆植物互花米草繁殖和生物量累積與分配的影響[J]. 甘琳,趙暉,清華,肖燕,李敏,胡秋香,安樹青. 生態(tài)學報. 2011(07)
[9]植物對氮素吸收利用的研究進展[J]. 吳巍,趙軍. 中國農學通報. 2010(13)
[10]氮素和6-BA對水稻分蘗芽發(fā)育的影響及其生理機制[J]. 劉楊,王強盛,丁艷鋒,劉正輝,李剛華,王紹華. 作物學報. 2009(10)
博士論文
[1]水稻分蘗芽萌發(fā)與休眠相互轉換的激素學機制[D]. 劉楊.南京農業(yè)大學 2011
[2]氮、水和溫度對羊草有性生殖及克隆生長的影響[D]. 王俊鋒.東北師范大學 2010
[3]羊草種群地下芽庫各類型芽變化及與地上植株形成關系的研究[D]. 張繼濤.東北師范大學 2009
[4]三種根莖型禾草繁殖特性及其生態(tài)適應性研究[D]. 郭金麗.內蒙古農業(yè)大學 2007
[5]羊草生殖生物學研究[D]. 張衛(wèi)東.中國科學院研究生院（植物研究所） 2004
碩士論文
[1]氮素營養(yǎng)對水稻分蘗基因表達特性及根系和抗倒性的影響[D]. 鄭冠龍.東北農業(yè)大學 2015
[2]水稻幼苗對氮素響應的激素生理機制[D]. 馬丹.南京農業(yè)大學 2012
[3]杜仲花粉初生代謝物與次生代謝物的研究[D]. 馬仁萍.西北農林科技大學 2008
[4]松嫩平原羊草莖頂分生組織分化研究[D]. 張兆軍.東北師范大學 2006
本文編號：3594899
【文章來源】：東北師范大學吉林省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】：63 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
轉錄本序列長度分布
比對結果統(tǒng)計
東北師范大學碩士學位論文15圖2.3ORF長度分布Figure2.3ORFlengthdistribution注：Minlength開放閱讀框的最小長度；Maxlength開放閱讀框的最大長度；N50開放閱讀框的N50長度；N90開放閱讀框的N90長度；Mean-length開放閱讀框的平均長度對比各個數(shù)據(jù)庫，共注釋了316261個unigene，注釋比例為100%。其中注釋到NR數(shù)據(jù)庫的unigene比例為56.73%；注釋到NT數(shù)據(jù)庫的unigene比例為44.54%；注釋到GO數(shù)據(jù)庫的unigene比例為33.36%；注釋到KO數(shù)據(jù)庫的unigene比例為15.05%（圖2.4）。
【參考文獻】：
期刊論文
[1]羊草種質資源的評價與利用[J]. 劉公社,李曉霞,齊冬梅,陳雙燕,程麗琴. 科學通報. 2016(02)
[2]次生代謝產物與植物抗病防御反應[J]. 郭艷玲,張鵬英,郭默然,陳靠山. 植物生理學報. 2012(05)
[3]高通量測序技術及其應用[J]. 王興春,楊致榮,王敏,李瑋,李生才. 中國生物工程雜志. 2012(01)
[4]植物對氮脅迫的生理適應機制研究進展[J]. 林鄭和,陳榮冰,陳常頌. 湖北農業(yè)科學. 2011(23)
[5]呼倫貝爾草原異質生境羊草有性生殖及其生物量分配的研究[J]. 周嬋,張卓,郭平,白丹,楊允菲,李建東. 草原與草坪. 2011(05)
[6]活性氮、活性氧及植物激素在種子休眠解除中的作用及相互關系研究進展[J]. 強妮花,惠偉. 植物生理學報. 2011(07)
[7]松嫩平原兩個生態(tài)型羊草營養(yǎng)和生殖生長的研究[J]. 周嬋,張卓,呂勇通,楊允菲. 草地學報. 2011(03)
[8]氮、硫互作對克隆植物互花米草繁殖和生物量累積與分配的影響[J]. 甘琳,趙暉,清華,肖燕,李敏,胡秋香,安樹青. 生態(tài)學報. 2011(07)
[9]植物對氮素吸收利用的研究進展[J]. 吳巍,趙軍. 中國農學通報. 2010(13)
[10]氮素和6-BA對水稻分蘗芽發(fā)育的影響及其生理機制[J]. 劉楊,王強盛,丁艷鋒,劉正輝,李剛華,王紹華. 作物學報. 2009(10)
博士論文
[1]水稻分蘗芽萌發(fā)與休眠相互轉換的激素學機制[D]. 劉楊.南京農業(yè)大學 2011
[2]氮、水和溫度對羊草有性生殖及克隆生長的影響[D]. 王俊鋒.東北師范大學 2010
[3]羊草種群地下芽庫各類型芽變化及與地上植株形成關系的研究[D]. 張繼濤.東北師范大學 2009
[4]三種根莖型禾草繁殖特性及其生態(tài)適應性研究[D]. 郭金麗.內蒙古農業(yè)大學 2007
[5]羊草生殖生物學研究[D]. 張衛(wèi)東.中國科學院研究生院（植物研究所） 2004
碩士論文
[1]氮素營養(yǎng)對水稻分蘗基因表達特性及根系和抗倒性的影響[D]. 鄭冠龍.東北農業(yè)大學 2015
[2]水稻幼苗對氮素響應的激素生理機制[D]. 馬丹.南京農業(yè)大學 2012
[3]杜仲花粉初生代謝物與次生代謝物的研究[D]. 馬仁萍.西北農林科技大學 2008
[4]松嫩平原羊草莖頂分生組織分化研究[D]. 張兆軍.東北師范大學 2006
本文編號：3594899
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